; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1607 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1607
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptioneukaryotic initiation factor 4A-3
Genome locationMC08:23828482..23835128
RNA-Seq ExpressionMC08g1607
SyntenyMC08g1607
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0071013 - catalytic step 2 spliceosome (cellular component)
GO:0003724 - RNA helicase activity (molecular function)
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GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001650 - Helicase, C-terminal
IPR011545 - DEAD/DEAH box helicase domain
IPR014001 - Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014014 - RNA helicase, DEAD-box type, Q motif
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052762.1 eukaryotic initiation factor 4A-3 [Cucumis melo var. makuwa]1.25e-28798.28Show/hide
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A0A0A0L9P0 Uncharacterized protein1.00e-28797.56Show/hide
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A0A5A7UAL9 Eukaryotic initiation factor 4A-36.07e-28898.28Show/hide
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A0A6J1DI60 eukaryotic initiation factor 4A-32.20e-29199.27Show/hide
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A0A6J1GB02 eukaryotic initiation factor 4A-3-like4.97e-28897.8Show/hide
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A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like4.97e-28897.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41380 Eukaryotic initiation factor 4A-32.4e-20291.26Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        ED+L FET++GVEPI+SF +MGIKDDLLRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQ+VDT S EVQALILSPTRELA QT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EKVILAIGDYIN+QAHACIGGKSVGEDIRKLE GVQ+VSGTPGRVCDMIKRRTLRTR IKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        +EILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLT KMR NNFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FR GTTRVLITTDVWARGLD   VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Q10I26 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog B2.2e-20087.53Show/hide
Query:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT
        AAATTS      RR   A +D+ L FET+ GVE ISSFDQMGI++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ+VDT
Subjt:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT

Query:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY
        + REVQALILSPTRELA QTE+V+LAIGDYINIQ HACIGGKS+GEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIY
Subjt:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY

Query:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF
        DVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNF
Subjt:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF

Query:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE
        TVS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLD   VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDE
Subjt:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE

Query:  MPMNVADLI
        MPMNVADLI
Subjt:  MPMNVADLI

Q2NL22 Eukaryotic initiation factor 4A-III4.6e-18277.13Show/hide
Query:  MAAAATTSVVPPNRRRSINAPE-DKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMV
        MAA AT +     R+R +   +  K+EFET+E V+   +FD MG+++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRA++ II+GRDVIAQ+QSGTGKT+  +++V Q +
Subjt:  MAAAATTSVVPPNRRRSINAPE-DKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMV

Query:  DTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQ
        D   RE QALIL+PTRELA Q +K +LA+GDY+N+Q HACIGG +VGEDIRKL++G  +V+GTPGRV DMI+RR+LRTRAIK+LVLDE+DEML++GFK+Q
Subjt:  DTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQ

Query:  IYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSN
        IYDVYRYLPP  QVVLISATLPHEILEMTNKFMTDP+RILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTEKMR  
Subjt:  IYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSN

Query:  NFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQI
        NFTVS MHGDMPQ+ER++IM EFRSG +RVLI+TDVWARGLD   VSL+INYDLPNNRELYIHRIGRSGR+GRKGVAINFVK+DDI+ILRDIEQYYSTQI
Subjt:  NFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQI

Query:  DEMPMNVADLI
        DEMPMNVADLI
Subjt:  DEMPMNVADLI

Q5VNM3 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog A2.2e-20087.53Show/hide
Query:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT
        AAATTS      RR   A +D+ L FET+ GVE ISSFDQMGI+DDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ+VDT
Subjt:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT

Query:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY
        + REVQALILSPTRELA QTE+V+LAIGD+INIQ HACIGGKS+GEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIY
Subjt:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY

Query:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF
        DVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNF
Subjt:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF

Query:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE
        TVS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLD   VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDE
Subjt:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE

Query:  MPMNVADLI
        MPMNVADLI
Subjt:  MPMNVADLI

Q94A52 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog1.9e-19687.92Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +DKL FETT+G+EPI+SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ+VDTSSREVQALILSPTRELATQT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        HEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRSG +RVLITTDVWARG+D   VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51380.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein3.2e-16273.01Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        E+ L FETT+G++PI SFD MG+ D +LRG+Y YG++KPS IQQRA+ PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIA++VCQ+V+ SSR+VQ L+LSP+RELA+QT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGGKS+GEDI+KLE GV  VSGTPGRV DMIKR +L+T+A+KLLVLDESDEMLS+G KDQIYDVYR LP ++QV LISATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
         EILEMT KFMTDPVRILVK DELTLEGIKQ++V V++EEWKFDTLCDLY  LTI QA+IFCNT++KV+WLTEKMRS+NF VS MHGD  Q+ERD IM +
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRS  +RVLI +DVWARG+D   VS VINYD+PNN ELYIHRIGR+GRFGR+GVAINFVKS D+K L+DIE++Y T+I EMP   ADL+
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT1G54270.1 eif4a-27.2e-13864.88Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D +  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY  ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM++R++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+E+WK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+D   VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.1 eukaryotic translation initiation factor 4A12.2e-13965.68Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+D   VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.3 eukaryotic translation initiation factor 4A12.2e-13965.68Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+D   VSLVIN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G19760.1 eukaryotic initiation factor 4A-III1.4e-19787.92Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +DKL FETT+G+EPI+SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ+VDTSSREVQALILSPTRELATQT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        HEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRSG +RVLITTDVWARG+D   VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLD---VSLVINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCGCAGCTACGACAAGCGTTGTGCCGCCTAATCGACGGCGATCAATTAATGCGCCGGAAGATAAGTTGGAATTCGAGACGACGGAGGGGGTTGAGCCGATCTC
GAGTTTCGATCAGATGGGCATTAAGGACGATCTTCTCCGTGGAATATATGCATACGGGTTCGAGAAGCCCTCGGCCATTCAGCAGAGAGCCGTGAGACCGATTATCGAGG
GGCGAGATGTCATTGCTCAGGCCCAGTCTGGAACAGGCAAGACGTCCATGATTGCCCTTACCGTTTGCCAAATGGTTGATACATCGAGTAGAGAAGTACAGGCCTTGATC
TTGTCCCCTACGAGAGAATTGGCAACTCAGACAGAGAAAGTAATATTGGCCATTGGCGACTACATTAATATACAAGCACACGCTTGCATTGGCGGCAAAAGTGTAGGTGA
AGATATCAGGAAGCTCGAGTTTGGAGTTCAGATTGTATCAGGAACCCCTGGAAGAGTCTGTGACATGATCAAGAGAAGGACATTGCGTACCAGAGCCATTAAGTTGTTAG
TTCTGGATGAGTCTGACGAGATGTTGAGCAGAGGGTTTAAAGACCAGATTTATGATGTGTATAGATATCTCCCACCAGAACTTCAGGTTGTCTTGATTTCTGCTACCCTT
CCTCATGAAATCCTGGAGATGACAAACAAGTTCATGACGGATCCTGTGAGAATACTTGTCAAGCGTGATGAGTTAACTTTGGAGGGTATTAAGCAATTCTTCGTTGCAGT
TGAAAGGGAAGAGTGGAAGTTTGATACCTTATGTGATCTTTATGACACCTTGACTATCACTCAAGCTGTAATTTTCTGTAACACTAAGCGGAAGGTTGAATGGTTAACTG
AGAAGATGCGTAGTAATAACTTCACAGTTTCACATATGCATGGGGACATGCCTCAGAGGGAAAGAGATGCAATCATGGGGGAGTTCCGATCAGGAACTACTCGTGTCCTA
ATCACCACTGATGTTTGGGCACGAGGGCTTGATGTATCACTAGTGATAAACTACGACCTTCCAAACAATCGAGAACTTTACATTCACAGGATAGGAAGATCTGGTCGGTT
TGGGCGCAAGGGTGTTGCCATTAACTTTGTGAAAAGCGATGACATAAAGATCCTGAGAGATATTGAGCAGTATTACAGTACCCAGATTGATGAGATGCCCATGAACGTTG
CTGATTTGATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAAAATTCAAAATTAAATTGTAATTTACAAATAAACACAATGTTCAAAGTACATACATTAAAATGTCTCAAAAAGAAAGTACATACGTTAAAATGATAATTTAACCTA
AATCCTACAAACACGAGAGCCCACGTTCCTCCAAAGGTTTGAAACCTACGGCACGTCTGAGCCGTAGATTCTAGGGTTTATATATCGACGGTCACGATTCGATTCTCGCG
GTGGAAAATTGGATAGGATTTCATCCCGTACATAAACAAATATCTTTTTCCCTTTTCTTTCTCCCTTCGCTTTCGAATCGTCATCGGCCCTAATCTGCGGCTTCTGCTCC
ATCTCTTCCCCTCGCCGTCGGTAACTCGCCGGAAATTATCGGGAAATCTCTCCGGTAAGTAGAACCCTTAATCACGATCTAGGAAGATACGCCCACCGACATGGCGGCCG
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