; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1648 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1648
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
Genome locationMC08:24448695..24451537
RNA-Seq ExpressionMC08g1648
SyntenyMC08g1648
Gene Ontology termsGO:0006515 - protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins (biological process)
GO:0009526 - plastid envelope (cellular component)
GO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
GO:0009840 - chloroplastic endopeptidase Clp complex (cellular component)
GO:0004176 - ATP-dependent peptidase activity (molecular function)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0051117 - ATPase binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001907 - ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
IPR018215 - ClpP, Ser active site
IPR023562 - Clp protease proteolytic subunit /Translocation-enhancing protein TepA
IPR029045 - ClpP/crotonase-like domain superfamily
IPR033135 - ClpP, histidine active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036637.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.58e-17595.29Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLD+SSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

XP_008454281.1 PREDICTED: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucumis melo]7.55e-17796.08Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKA+YS EFSS+DR+SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

XP_022155316.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Momordica charantia]3.50e-182100Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

XP_022998282.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita maxima]3.58e-17595.29Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLD+SSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

XP_038906134.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Benincasa hispida]9.97e-17796.47Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVK++YS E SSLDR+SRQG+WSIRDDVQIPSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY88 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit3.65e-17796.08Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKA+YS EFSS+DR+SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

A0A5A7TNH0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit3.65e-17796.08Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKA+YS EFSS+DR+SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

A0A6J1DRD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.70e-182100Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

A0A6J1GAD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit2.87e-17494.51Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGK VGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLD+SSR+GLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

A0A6J1K7I3 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.73e-17595.29Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RKLGKLVGGGRNLKN+PVKAIYS EFSSLD+SSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERF SVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA+EYGLIDGVIMNPLKA QPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P54416 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 14.6e-6365.05Show/hide
Query:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        +R   + S+L + RI+  G  V D+ AN++VAQLL+L+A DP KDI +Y+NSPGGSV+AG+ IFDTM  IRPDV T+C+GLAASMGAFLLSAG KGKR S
Subjt:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPL
        LPNSRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+ KA LN +L+ HTG+SLE+I  DT+RDFFMSA+E+KEYGLID VI     A  P+
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPL

Q2JIP1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 27.2e-6465.61Show/hide
Query:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ DP KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DTM+HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ GTKGKR +
Subjt:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AKEYGLID VI    K  QP  AA
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

Q3MFR5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 19.1e-6767.38Show/hide
Query:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAGTKGKR S
Subjt:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EA++YGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q8YXH5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 12.0e-6666.84Show/hide
Query:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RI+  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAG KGKR S
Subjt:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EAK+YGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q9S834 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic1.2e-12788.63Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RK  KLV   +N KN+  KA+YS    + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF S+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02560.1 nuclear encoded CLP protease 58.5e-12988.63Show/hide
Query:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
        RK  KLV   +N KN+  KA+YS    + +  S QG+WSIRDD+Q+PSSPYFP YAQGQGPPPMVQERF S+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL
Subjt:  RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQL

Query:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
        LYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA
Subjt:  LYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKA

Query:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        NLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  NLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

AT1G11750.1 CLP protease proteolytic subunit 61.7e-3938.82Show/hide
Query:  KNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIP---SSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFH-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA
        +  P++ I S+  S    S + GL S      I     +P F      +G PP++           + S LF+ RII  G  ++  +A  +++QL+ L +
Subjt:  KNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIP---SSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFH-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDA

Query:  VDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY
        +D   DI+MY+N PGGS  + +AI+D M  I+P V TV  G+AAS GA LL+ G KG RY++PN+R+MIHQP  G  G   D+  Q NE +  +  ++  
Subjt:  VDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGY

Query:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI
         +  TGQ LEK+ Q T+RD F+SA EA E+GLIDG++
Subjt:  LSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI

AT1G66670.1 CLP protease proteolytic subunit 37.1e-5149.77Show/hide
Query:  SLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGM
        SL +  RQ L S  D     SS    + AQ     P  +E      + L + RI+  G  VDD  A+++++QLL LDA D  +DI +++NSPGGS+TAGM
Subjt:  SLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGM

Query:  AIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFM
         I+D M+  + DVSTVC+GLAASMGAFLL++G+KGKRY +PNS++MIHQPLG A G  T++ I+  EM++HK  LN   S  TG+   +I  DTDRD F+
Subjt:  AIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFM

Query:  SAKEAKEYGLIDGVI
        +  EAKEYGLID VI
Subjt:  SAKEAKEYGLIDGVI

AT5G23140.1 nuclear-encoded CLP protease P71.2e-4550Show/hide
Query:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER + + S+L + RII   G ++DD ++++VAQLLYL++ +P+K I MY+NSPGG VTAG+AI+DTM++IR  +ST+C+G AASM + LL+AG KG+R S
Subjt:  ERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI
        LPN+ +MIHQP GG  G   DI I   +++     LN     HTGQ L+ +  + DRD FM+ +EAK +G+ID VI
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI

AT5G45390.1 CLP protease P43.3e-4852.63Show/hide
Query:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR
        V+  L + RI+  G ++DD +A+ I++QLL LDA DP KDI +++NSPGGS++A MAI+D ++ +R DVST+ +G+AAS  + +L AGTKGKR+++PN+R
Subjt:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR

Query:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI
        IMIHQPLGGA G   D++IQA E++H+K N+   ++  T +S E++ +D DRD +MS  EA EYGLIDGVI
Subjt:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGGAAACTAGGAAAATTAGTTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATACTCCAGTCAAAGCCATCTACTCAAGCGAGTTTTCGTCTCTGGATAGGAGTTCTCGCCAGGGCCT
TTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAATTCCATCTTCACCATACTTCCCCACTTATGCGCAAGGGCAAGGTCCTCCCCCGATGGTGCAGGAACGCTTCCACAGTGTTATAA
GCCAGCTTTTCCAATATAGAATTATTCGTTGTGGTGGAGCGGTTGATGATGATATGGCAAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTGTTGATCCCAATAAG
GATATCGTCATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACTATGAGGCATATTCGGCCTGATGTATCTACTGTCTGCGTAGGGCT
AGCAGCCAGTATGGGCGCCTTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCAAATTCAAGGATAATGATCCATCAGCCTCTTGGTGGTGCTCAAGGTG
GACAGACTGACATCGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCAAATCTTAATGGGTATCTTTCCTACCACACCGGTCAAAGTCTCGAGAAGATTAACCAGGAT
ACAGATCGCGATTTCTTCATGAGTGCCAAAGAAGCCAAAGAATATGGACTCATAGATGGAGTTATCATGAATCCTCTCAAAGCCCTCCAACCTTTAGCAGCTGCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAAACTAGGAAAATTAGTTGGAGGTGGAAGAAACCTCAAGAATACTCCAGTCAAAGCCATCTACTCAAGCGAGTTTTCGTCTCTGGATAGGAGTTCTCGCCAGGGCCT
TTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAATTCCATCTTCACCATACTTCCCCACTTATGCGCAAGGGCAAGGTCCTCCCCCGATGGTGCAGGAACGCTTCCACAGTGTTATAA
GCCAGCTTTTCCAATATAGAATTATTCGTTGTGGTGGAGCGGTTGATGATGATATGGCAAATATCATTGTTGCTCAACTTCTATACCTTGATGCTGTTGATCCCAATAAG
GATATCGTCATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGACACTATGAGGCATATTCGGCCTGATGTATCTACTGTCTGCGTAGGGCT
AGCAGCCAGTATGGGCGCCTTCCTGCTTAGTGCTGGAACTAAAGGAAAAAGATACAGCTTGCCAAATTCAAGGATAATGATCCATCAGCCTCTTGGTGGTGCTCAAGGTG
GACAGACTGACATCGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCAAATCTTAATGGGTATCTTTCCTACCACACCGGTCAAAGTCTCGAGAAGATTAACCAGGAT
ACAGATCGCGATTTCTTCATGAGTGCCAAAGAAGCCAAAGAATATGGACTCATAGATGGAGTTATCATGAATCCTCTCAAAGCCCTCCAACCTTTAGCAGCTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
RKLGKLVGGGRNLKNTPVKAIYSSEFSSLDRSSRQGLWSIRDDVQIPSSPYFPTYAQGQGPPPMVQERFHSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNK
DIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQD
TDRDFFMSAKEAKEYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA