| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022143379.1 THO complex subunit 4D-like [Momordica charantia] | 2.82e-185 | 90.32 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISK PPRRMK
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Query: GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRG+GRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
Subjt: GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
Query: ENYHAEAMQT
ENYHAEAMQT
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 1.81e-159 | 79.32 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLTSESGRT SS VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GG GRG G GRGRG GRK
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
Query: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
K VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.74e-157 | 77.25 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGG------------GRGQGRGRG------
LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLTSESGRT SS VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GG GRG+GRGRG
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGG------------GRGQGRGRG------
Query: ----RGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
RG GRKK VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: ----RGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 8.99e-160 | 79.32 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLTSESGRT SS VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GG GRG G GRGRG GRK
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
Query: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
K VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 1.88e-161 | 81.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VV+GS+RRGPL IN R SA+SI K PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGGG--RGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTVVLT ESGRT SS VVN FPGPS+RG LR GRGRGRGGW+RGQG GGG RG+GRGRGRG GRKK VEKSSDEL
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGGG--RGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
Query: DKDLENYHAEAMQT
DK+LENYHAEAMQT
Subjt: DKDLENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 2.76e-156 | 79.3 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI K PP RM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRG-RGRGRGGWSRGQGQ--VGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
LGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT ESGR + VVN FPGPS+RG LR RGRGRG W+RG G GGGRG+GRGRGRG GRKK VEKSSDEL
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRG-RGRGRGGWSRGQGQ--VGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
Query: DKDLENYHAEAMQT
DK+LENYHAEAMQT
Subjt: DKDLENYHAEAMQT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 8.62e-138 | 89.7 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KASFKL GSV +LF GESHCGSPS P LPP RM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESG
LGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT SG
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESG
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 1.37e-185 | 90.32 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISK PPRRMK
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Query: GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRG+GRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
Subjt: GDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKDL
Query: ENYHAEAMQT
ENYHAEAMQT
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 8.78e-160 | 79.32 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLTSESGRT SS VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GG GRG G GRGRG GRK
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR---GRGRGRGGWSRGQGQVGG----------GRGQGRGRGRGLGRK
Query: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
K VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: KTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 8.43e-158 | 77.25 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGG------------GRGQGRGRG------
LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLTSESGRT SS VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GG GRG+GRGRG
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALR-GRGRGRGGWSRGQGQVGG------------GRGQGRGRG------
Query: ----RGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
RG GRKK VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: ----RGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q3T0I4 THO complex subunit 4 | 1.5e-34 | 35.62 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREK-LRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MA +DMSL+D+IK N ++ R GR R G+ G GG + RG I RP+ + G + G + P + P+++
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREK-LRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+ +WQHDLF+ G +G+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKD
VT RR + G T R RG GG+ G G G RG RGRGRG GR + S++ELD
Subjt: LGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDELDKD
Query: LENYHA
L+ Y+A
Subjt: LENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 5.3e-69 | 50.61 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT-----------SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLG
LG N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+ GR + TV P + +G G GRGG+ R +G+ GGRG+G GRG G
Subjt: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT-----------SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLG
Query: RKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
KK VEKS+ +LDKDLE+YHA+AM T
Subjt: RKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 3.9e-40 | 41.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G GG+ GGR GS N+ PS ++ G+ + PY R + ++
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
+ WQ+D+F + S+ A+ G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNN
Subjt: KNVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
Query: VLLDGKPMKIEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRG------RGGWSRGQGQVGGGRG-QGR-GR
V LDGK MKIEI+G N P + + + + +E+ +F G N G RGRGRG RGG G G GGRG +GR GR
Subjt: VLLDGKPMKIEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRG------RGGWSRGQGQVGGGRG-QGR-GR
Query: GRGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
G G GR + S+++LD +L+ YH EAM+T
Subjt: GRGLGRKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 1.6e-41 | 39.81 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A RG G G + R P +TR + + +KA
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: NVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
W HD+F ED +GIE GTKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMK
Subjt: NVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
Query: IEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
IEI+G N + + SGR + G SN RG G+GRGG RG G+ GGGRG G GRGR G+ + S+++L
Subjt: IEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
Query: DKDLENYHAEAMQT
D DL+ YH+ M+T
Subjt: DKDLENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 1.3e-64 | 48.52 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
LDG+PMK+EILG N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V F G RG GRGRG G R QG V GRG +GRGR
Subjt: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
Query: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
G G GR KK VEKS+ +LDKDLE+YHAEAM
Subjt: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.6e-66 | 48.52 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
LDG+PMK+EILG N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V F G RG GRGRG G R QG V GRG +GRGR
Subjt: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
Query: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
G G GR KK VEKS+ +LDKDLE+YHAEAM
Subjt: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.6e-66 | 48.52 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR +++ W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
LDG+PMK+EILG N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V F G RG GRGRG G R QG V GRG +GRGR
Subjt: LDGKPMKIEILGDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSR-------GQGQVGGGRG--QGRGR
Query: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
G G GR KK VEKS+ +LDKDLE+YHAEAM
Subjt: GRGLGR---------KKTVEKSSDELDKDLENYHAEAM
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 3.8e-70 | 50.61 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT-----------SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLG
LG N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+ GR + TV P + +G G GRGG+ R +G+ GGRG+G GRG G
Subjt: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT-----------SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLG
Query: RKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
KK VEKS+ +LDKDLE+YHA+AM T
Subjt: RKKTVEKSSDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 4.4e-71 | 51.89 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT---SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKS
LG N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+ GR + TV P + +G G GRGG+ R +G+ GGRG+G GRG G KK VEKS
Subjt: LGDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVLT---SESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKS
Query: SDELDKDLENYHAEAMQT
+ +LDKDLE+YHA+AM T
Subjt: SDELDKDLENYHAEAMQT
|
|
| AT5G59950.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-42 | 39.81 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A RG G G + R P +TR + + +KA
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: NVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
W HD+F ED +GIE GTKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMK
Subjt: NVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
Query: IEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
IEI+G N + + SGR + G SN RG G+GRGG RG G+ GGGRG G GRGR G+ + S+++L
Subjt: IEILGDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTSESGRTDSSTVVNHFPGPSNRGALRGRGRGRGGWSRGQGQVGGGRGQGRGRGRGLGRKKTVEKSSDEL
Query: DKDLENYHAEAMQT
D DL+ YH+ M+T
Subjt: DKDLENYHAEAMQT
|
|
