; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g2448 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g2448
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationMC08:33288201..33289586
RNA-Seq ExpressionMC08g2448
SyntenyMC08g2448
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061603.1 putative polygalacturonase [Cucumis melo var. makuwa]1.42e-13566.56Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG--------------------------------RCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAF
        QAI KAWKAAC+SKT+SSTVLIPKR T++VKPI+L G                                RCK SQI+G IVAPTSP EW  TD+S WLAF
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG--------------------------------RCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAF

Query:  EGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGI
        +G+SRL++TG+GIGKIDGRGT WW+QSCRDHP L           LLQA KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGI
Subjt:  EGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGI

Query:  HIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESV
        HIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GDYTS+VNISHI+CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ     I  V+ +NL+  S+
Subjt:  HIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESV

Query:  NNPFI
        +N  I
Subjt:  NNPFI

TYJ97813.1 putative polygalacturonase [Cucumis melo var. makuwa]1.90e-12167.66Show/hide
Query:  WKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFG
        W+  C      ST    +R  LL K   + GRCK SQI+G IVAPTSP EW  TD+S WLAF+G+SRL++TG+GIGKIDGRGT WW+QSCRDHP L    
Subjt:  WKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFG

Query:  ELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHI
           + R L+   A KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GDYTS+VNISHI
Subjt:  ELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHI

Query:  RCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFI
        +CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ     I  V+ +NL+  S++N  I
Subjt:  RCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFI

VVA10736.1 PREDICTED: polygalacturonase [Prunus dulcis]2.70e-11961.35Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIH----GEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QA LKAW AAC+S+TE+ T+++P++  LL  PIV  G C+   I+    G ++AP SPG W   D SQWLAF GVS LN+ G   G+I+GRG  WW QSC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIH----GEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
        RDHP L     L  +     A+K++SC N+S+S IHF+NSSQTHVLI  S  + I+N++I APE SPNTDGIHI +SHNV+I N  IGTGDDCVSIGD+T
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SN+ IS+++CGPGHGISIGSLGRSGNFVQVE+I VS VY +GTTNGARIKTWQ+GRG +R+VTF++++F SV NP IIDQNY
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

XP_016902034.1 PREDICTED: probable polygalacturonase At1g80170 isoform X1 [Cucumis melo]5.97e-13273.83Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QAI +AWKAAC+SKT+SSTVLIPKR T++VKPI+L G C+   I    +G I+APTSP EW  TD+S WLAFEG+SRL++TG+ IGKIDGRGT WW+QSC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD
        RDHP L       + R L+   A KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GD
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD

Query:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQI
        YTS VNISHI+CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ+
Subjt:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQI

XP_022143115.1 probable polygalacturonase At1g80170 [Momordica charantia]9.07e-18392.17Show/hide
Query:  AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG C+ + I    HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
Subjt:  AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
        DHPDL+    L  +     AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS

Query:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
Subjt:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E1D2 probable polygalacturonase At1g80170 isoform X12.89e-13273.83Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QAI +AWKAAC+SKT+SSTVLIPKR T++VKPI+L G C+   I    +G I+APTSP EW  TD+S WLAFEG+SRL++TG+ IGKIDGRGT WW+QSC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD
        RDHP L       + R L+   A KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GD
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD

Query:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQI
        YTS VNISHI+CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ+
Subjt:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQI

A0A5A7V0D8 Putative polygalacturonase6.86e-13666.56Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG--------------------------------RCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAF
        QAI KAWKAAC+SKT+SSTVLIPKR T++VKPI+L G                                RCK SQI+G IVAPTSP EW  TD+S WLAF
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG--------------------------------RCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAF

Query:  EGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGI
        +G+SRL++TG+GIGKIDGRGT WW+QSCRDHP L           LLQA KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGI
Subjt:  EGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGI

Query:  HIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESV
        HIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GDYTS+VNISHI+CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ     I  V+ +NL+  S+
Subjt:  HIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESV

Query:  NNPFI
        +N  I
Subjt:  NNPFI

A0A5D3BEX0 Putative polygalacturonase9.21e-12267.66Show/hide
Query:  WKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFG
        W+  C      ST    +R  LL K   + GRCK SQI+G IVAPTSP EW  TD+S WLAF+G+SRL++TG+GIGKIDGRGT WW+QSCRDHP L    
Subjt:  WKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFG

Query:  ELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHI
           + R L+   A KIISCN+T+LSN+HFINSSQ HVL+M  +R EIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHN+IIKNTTIGTGDDCVS GDYTS+VNISHI
Subjt:  ELTKSRALLQ--AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHI

Query:  RCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFI
        +CGPGHGISIGSLG+SGNFVQVEDI VSN+YFKGTTN ARIKTWQ     I  V+ +NL+  S++N  I
Subjt:  RCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFI

A0A5E4E632 PREDICTED: polygalacturonase1.31e-11961.35Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIH----GEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QA LKAW AAC+S+TE+ T+++P++  LL  PIV  G C+   I+    G ++AP SPG W   D SQWLAF GVS LN+ G   G+I+GRG  WW QSC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIH----GEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
        RDHP L     L  +     A+K++SC N+S+S IHF+NSSQTHVLI  S  + I+N++I APE SPNTDGIHI +SHNV+I N  IGTGDDCVSIGD+T
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SN+ IS+++CGPGHGISIGSLGRSGNFVQVE+I VS VY +GTTNGARIKTWQ+GRG +R+VTF++++F SV NP IIDQNY
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

A0A6J1CMV4 probable polygalacturonase At1g801704.39e-18392.17Show/hide
Query:  AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRG C+ + I    HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
Subjt:  AILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQI----HGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
        DHPDL+    L  +     AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS

Query:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
Subjt:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23147 Polygalacturonase ADPG19.6e-5441.2Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKF---SQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        QA  KAWK ACS+    +T L+PK  T L+K    RG CK     QI G + A T   ++   D++ WL  E V+ L++ G   G I+G G  WW  SC+
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKF---SQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQ---AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD
                  + KS+   +   A+ + +  N ++ N+   N+ Q  + I    +VE+ N+ ITAP  SPNTDGIHI ++ N+ + N+ IGTGDDC+SI D
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQ---AMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGD

Query:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         T N+ I  + CGPGHGISIGSLG   +   V  I V    F  + NG RIKT+Q G G  + + FQN+  E+V NP IIDQ+Y
Subjt:  YTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

P35336 Polygalacturonase3.9e-5543.06Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        +A  KAWKAACSS T S+ +L+PK++  LV+PI   G CK     QI+G I A     ++ R D   WL F+ V  L V G   G I+G G  WW  SC+
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
         +  L      T       A+      +  + N+   N+ Q HV       V+  NL++TAPE+SPNTDGIH+  + N+ I +  IGTGDDC+SI + + 
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS

Query:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         V ++ I CGPGHGISIGSLG   +   V D+ V+     GTTNG RIKTWQ G G+   + FQN+   +V NP IIDQNY
Subjt:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

Q94AJ5 Probable polygalacturonase At1g801702.5e-6243.06Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        +A   AWK ACSSK + + +L+P+ +T L++PI L G CK     QI G I+AP  P  W   ++ +WL F G+SRL V G   G ++G G  WW +SC+
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
         +            R    A+    C N  + N++ I+S Q H+ +   +RV I  L + AP +SPNTDGIHI  S  ++I NTT+ TGDDC+SI   ++
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS

Query:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         ++IS+I CGPGHGISIGSLG+S ++ +V DI V       T NG RIKTWQ G G + ++ F+N+   +V+NP IIDQ Y
Subjt:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

Q9LW07 Probable polygalacturonase At3g157206.4e-5844.33Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QA LKAW+A CS  T     ++P   T +++P+  +G CK    F Q+ G++VAP S G W + D+ QW+ F  +  L + G   G+I+G+G+ WW    
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
         +H   R             A+K  SCNN  LS +  ++S   H+ I     V I +L I APESSPNTDGI + +S NV+I++  I TGDDC++I   T
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SN++IS I CGPGHGISIGSLG+ G    VE++ V N  F+GT NGARIKTWQ G G  R +TF  +  ++V NP IIDQ Y
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

Q9SFB7 Polygalacturonase QRT22.4e-5740.78Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS----QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        +A +KAW+AACSS T    ++ PK    ++K +   G CK S    +I+G I A  +P ++   ++  W+ FE V+ L V G   G+IDG G  WW +SC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS----QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
        + +P L   G  T       A+  + CNN  +SNI   N+ Q H+     K V+  NL++T+P  SPNTDGIH+  + N++I+++ + TGDDC+SI   +
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         NV  + I CGPGHGISIGSLG   +   V ++ V+     GTTNG RIKTWQ G G  + + FQ++  ++V NP II+Q+Y
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G80140.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.7e-6146.24Show/hide
Query:  TVLIPKRHTLLVKPIVLRGRC----KFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQS--QWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSR
        +V +P     L+  +   G C        I GE++A + P +W   +     WL F+ V  L + G G+  +DG+G  WW   CRDHP            
Subjt:  TVLIPKRHTLLVKPIVLRGRC----KFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQS--QWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTKSR

Query:  ALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGI
             M   +C N +L ++ F NS+QTHVL+MGS+ V I ++ IT+PE+SPNTDGIHI SS  V I ++ I TGDDCVSIGD  +N+N++ + CGPGHG+
Subjt:  ALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGI

Query:  SIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SIGSLGR G  V VE+IRVS+V F GTTNGARIKTW  G G +R + F ++ F SV NP IIDQ Y
Subjt:  SIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

AT1G80170.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.8e-6343.06Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR
        +A   AWK ACSSK + + +L+P+ +T L++PI L G CK     QI G I+AP  P  W   ++ +WL F G+SRL V G   G ++G G  WW +SC+
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS---QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCR

Query:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS
         +            R    A+    C N  + N++ I+S Q H+ +   +RV I  L + AP +SPNTDGIHI  S  ++I NTT+ TGDDC+SI   ++
Subjt:  DHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTS

Query:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         ++IS+I CGPGHGISIGSLG+S ++ +V DI V       T NG RIKTWQ G G + ++ F+N+   +V+NP IIDQ Y
Subjt:  NVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

AT3G07970.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.7e-5840.78Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS----QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        +A +KAW+AACSS T    ++ PK    ++K +   G CK S    +I+G I A  +P ++   ++  W+ FE V+ L V G   G+IDG G  WW +SC
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFS----QIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
        + +P L   G  T       A+  + CNN  +SNI   N+ Q H+     K V+  NL++T+P  SPNTDGIH+  + N++I+++ + TGDDC+SI   +
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
         NV  + I CGPGHGISIGSLG   +   V ++ V+     GTTNG RIKTWQ G G  + + FQ++  ++V NP II+Q+Y
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

AT3G15720.1 Pectin lyase-like superfamily protein4.6e-5944.33Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QA LKAW+A CS  T     ++P   T +++P+  +G CK    F Q+ G++VAP S G W + D+ QW+ F  +  L + G   G+I+G+G+ WW    
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
         +H   R             A+K  SCNN  LS +  ++S   H+ I     V I +L I APESSPNTDGI + +S NV+I++  I TGDDC++I   T
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SN++IS I CGPGHGISIGSLG+ G    VE++ V N  F+GT NGARIKTWQ G G  R +TF  +  ++V NP IIDQ Y
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY

AT3G15720.2 Pectin lyase-like superfamily protein8.6e-5843.62Show/hide
Query:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC
        QA LKAW+A CS  T     ++P   T +++P+  +G CK    F Q+ G++VAP S G W + D+ QW+ F  +  L + G   G+I+G+G+ WW    
Subjt:  QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCK----FSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSC

Query:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT
           P  R                  SCNN  LS +  ++S   H+ I     V I +L I APESSPNTDGI + +S NV+I++  I TGDDC++I   T
Subjt:  RDHPDLRVFGELTKSRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYT

Query:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY
        SN++IS I CGPGHGISIGSLG+ G    VE++ V N  F+GT NGARIKTWQ G G  R +TF  +  ++V NP IIDQ Y
Subjt:  SNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRSGNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CAGGCAATACTAAAAGCATGGAAAGCAGCATGTAGCTCTAAAACAGAAAGTTCTACAGTGCTAATTCCCAAGAGGCATACACTTCTAGTAAAACCAATTGTTTTGAGAGG
TAGATGCAAATTTTCACAGATACATGGAGAGATTGTGGCACCAACCTCACCAGGCGAATGGACGCGGACTGACCAGAGCCAGTGGCTGGCTTTTGAAGGGGTAAGCAGGC
TCAATGTCACTGGCACCGGCATTGGCAAAATAGATGGAAGAGGTACAAGATGGTGGAGCCAATCATGTAGGGATCACCCAGACTTGAGAGTATTTGGTGAACTTACCAAA
TCTCGTGCATTATTGCAGGCAATGAAGATTATTTCATGCAACAACACCAGCTTGAGCAACATTCACTTTATTAACAGCTCACAAACACATGTACTAATAATGGGGAGCAA
GAGAGTTGAAATTAAAAATTTGGTAATCACAGCTCCAGAAAGCAGCCCAAACACTGATGGCATTCACATTCATTCCTCTCACAATGTTATTATAAAGAACACAACAATAG
GCACAGGTGATGATTGTGTATCTATAGGAGATTACACCTCTAACGTGAATATCTCACACATCAGATGTGGACCTGGTCATGGAATAAGCATTGGAAGCTTGGGAAGAAGC
GGCAATTTTGTACAAGTAGAGGATATTAGAGTGAGTAATGTCTACTTCAAAGGAACTACCAATGGAGCTCGGATTAAGACTTGGCAGATTGGTAGGGGTAACATCCGAAG
GGTCACATTTCAGAATCTCTATTTTGAATCAGTCAATAACCCCTTTATTATAGACCAAAACTAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGGCAATACTAAAAGCATGGAAAGCAGCATGTAGCTCTAAAACAGAAAGTTCTACAGTGCTAATTCCCAAGAGGCATACACTTCTAGTAAAACCAATTGTTTTGAGAGG
TAGATGCAAATTTTCACAGATACATGGAGAGATTGTGGCACCAACCTCACCAGGCGAATGGACGCGGACTGACCAGAGCCAGTGGCTGGCTTTTGAAGGGGTAAGCAGGC
TCAATGTCACTGGCACCGGCATTGGCAAAATAGATGGAAGAGGTACAAGATGGTGGAGCCAATCATGTAGGGATCACCCAGACTTGAGAGTATTTGGTGAACTTACCAAA
TCTCGTGCATTATTGCAGGCAATGAAGATTATTTCATGCAACAACACCAGCTTGAGCAACATTCACTTTATTAACAGCTCACAAACACATGTACTAATAATGGGGAGCAA
GAGAGTTGAAATTAAAAATTTGGTAATCACAGCTCCAGAAAGCAGCCCAAACACTGATGGCATTCACATTCATTCCTCTCACAATGTTATTATAAAGAACACAACAATAG
GCACAGGTGATGATTGTGTATCTATAGGAGATTACACCTCTAACGTGAATATCTCACACATCAGATGTGGACCTGGTCATGGAATAAGCATTGGAAGCTTGGGAAGAAGC
GGCAATTTTGTACAAGTAGAGGATATTAGAGTGAGTAATGTCTACTTCAAAGGAACTACCAATGGAGCTCGGATTAAGACTTGGCAGATTGGTAGGGGTAACATCCGAAG
GGTCACATTTCAGAATCTCTATTTTGAATCAGTCAATAACCCCTTTATTATAGACCAAAACTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
QAILKAWKAACSSKTESSTVLIPKRHTLLVKPIVLRGRCKFSQIHGEIVAPTSPGEWTRTDQSQWLAFEGVSRLNVTGTGIGKIDGRGTRWWSQSCRDHPDLRVFGELTK
SRALLQAMKIISCNNTSLSNIHFINSSQTHVLIMGSKRVEIKNLVITAPESSPNTDGIHIHSSHNVIIKNTTIGTGDDCVSIGDYTSNVNISHIRCGPGHGISIGSLGRS
GNFVQVEDIRVSNVYFKGTTNGARIKTWQIGRGNIRRVTFQNLYFESVNNPFIIDQNY