| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.93e-223 | 86.17 | Show/hide |
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| XP_022946029.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita moschata] | 1.25e-224 | 86.74 | Show/hide |
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| XP_023546561.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 4.17e-223 | 86.17 | Show/hide |
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MSFND+R SV+P PLHSYGA NGDASGCW Q+PRNDLFDPQSQFE Q PPFKRAR EENQS PMPYP PSNSRV PPNAP+NKG++NIFFKTRMCAKF
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TPL+NGSDS+YPE +AASSSV D LRA N N RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLS+GR+GE SN+ALN+KPLVVA EAPSS A S
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PSSA+PEGQ K+ LLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSS S++EG
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| XP_038890424.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39 [Benincasa hispida] | 5.04e-222 | 85.88 | Show/hide |
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MSFND+RASV+ PLHSYGAANGD SGCW QFPRND FDP SQFE Q PPFKRARNSEENQS P+PY P NSRVHPPNAPVNKG+SNIFFKTRMCAKF
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K GLCRNGA+CNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVG+REDDQSVSNWNDDQKIIQK+KLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDD GRFRESSAISIGTTG
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TPLMNGSDS+YPE SRA SSSVSD LRA N N RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFG+KCHFAHGQSELQLS+GR+GEAS++ALN+KPL+V EA SS A S
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PSSA+ +GQ K CLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPS SKMEG
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like | 4.98e-213 | 83.95 | Show/hide |
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MSFND+R SV+P PLHSYG+ NGDASGCW QFPRND FDPQSQFE Q PP+KRARNSEEN S P+ Y P NSR HPPNAPVNKG+SNIFFKTRMCAKF
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S PSSA+PEGQ K LLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSS SKMEG
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| A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like | 4.98e-213 | 83.95 | Show/hide |
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MSFND+R SV+P PLHSYG+ NGDASGCW QFPRND FDPQSQFE Q PP+KRARNSEEN S P+ Y P NSR HPPNAPVNKG+SNIFFKTRMCAKF
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TPLMNGSDS+ Y E SRA S SVSD LRA N NVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFG+KCHFAHGQSELQL +GR+GE S +ALN+KPL+VA EA SS
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S PSSA+PEGQ K LLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSS SKMEG
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| A0A6J1CPS7 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like | 1.11e-261 | 100 | Show/hide |
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| A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like | 6.04e-225 | 86.74 | Show/hide |
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TPL+NGSDS+YPE +AASSSV D LRA N N RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLS+GR+GE SN+ALN+KPLVVA EAPSS A S
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| A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like | 2.88e-222 | 86.17 | Show/hide |
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TPLMNGSDS+YPE +AASSSV D LRA N N RPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLS+GR+GE SN+ALN+KPLVVA EAPS S
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
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| Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 28 | 5.4e-22 | 34.3 | Show/hide |
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K KLC KF G CPY C+F H P +++ ++ R RES A+S+G G +V+ TL++ N W
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Query: KTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR--DGE---ASNSALNIK-----PLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIY
KT++C KW+ TG+CPFG CHFAHG SEL G +GE +++ L+ K V + +P S+ S+ + G R KWKGP KI+R+Y
Subjt: KTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR--DGE---ASNSALNIK-----PLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIY
Query: ADWLDDL
DW+DD+
Subjt: ADWLDDL
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| Q6S9E0 mRNA decay activator protein ZFP36 | 5.2e-09 | 31.01 | Show/hide |
Query: PQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDD
P PP F P+ PS+ P +P ++ +KT +C F ++G CR GA C FAHG+ ++RQP + +
Subjt: PQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDD
Query: QKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLH
K +LC KFY CPYG RC+F+H
Subjt: QKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLH
|
|
| Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 56 | 1.7e-47 | 34.23 | Show/hide |
Query: QPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQK
QPPP K++R + N ++ + +FFKT++C KF+AG C NCNFAHG+E++R+PPPNWQEIV E+ + ++ +
Subjt: QPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQK
Query: I--------------------------IQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSAYPEASRAASSSV
I K + C+KFY E CPYGD C FLH D+ + RES AIS+ +P + G S AA+++
Subjt: I--------------------------IQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSAYPEASRAASSSV
Query: SDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR----DGEASNSALNIKPLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVP-----------
+ +PS WKT++C KWE+TG+CPFG KCHFAHG +EL G D + + + K VV+A+AP+ +A +A ++ +P
Subjt: SDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR----DGEASNSALNIKPLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVP-----------
Query: ---------EGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDD
GQ +R + KWKGP KI+RIY DW+D+
Subjt: ---------EGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDD
|
|
| Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 12 | 1.3e-47 | 34.42 | Show/hide |
Query: AANGDASGCWPQFPRNDLFDPQSQFEPQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMR
A D + W P N D PP K+ R S + S SN K + +FFKT++C KF+AG C NCNFAH VE++R
Subjt: AANGDASGCWPQFPRNDLFDPQSQFEPQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMR
Query: QPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTT
+PPPNWQEIV E+++S +++ K + C+KFY E CPYG+ C FLH D++ R RES AIS+G
Subjt: QPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTT
Query: GTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL-------SVGRDGEASN-----
G G S SSS L + ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL G+DG + N
Subjt: GTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL-------SVGRDGEASN-----
Query: -----SALNIKPLVVAAEAPSSS--------AMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
L+ +++ P ++ A+ SSAV + G R KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt: -----SALNIKPLVVAAEAPSSS--------AMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
|
|
| Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39 | 4.3e-80 | 49.14 | Show/hide |
Query: NDLFDPQSQFEPQ---PPPFKRARNSEENQSDP---MPYPPSNS-----RVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPP
+ L + QSQ +P P KR R ++N +P P P S++ ++PP PVNKG +NIF+KTRMCAKF+AG CRNG CNFAHG+ED+RQPP
Subjt: NDLFDPQSQFEPQ---PPPFKRARNSEENQSDP---MPYPPSNS-----RVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPP
Query: NWQEIVG------------LREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMN
NWQEIVG RE ++ +NW DDQKII +MKLCRKF GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T +
Subjt: NWQEIVG------------LREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMN
Query: GSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR-DGEASN--SALNIKPLVVAAEA----PSSSA
+ S E +R S V + V V+ +WKT+LC K++ITG CPFG+KCHFAHGQ+EL SVGR +GEA N +++N + +V A EA P +
Subjt: GSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR-DGEASN--SALNIKPLVVAAEA----PSSSA
Query: MSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKME
+ S EG+ K+CLLKW KKINRIY DW+DDLP+ S +E
Subjt: MSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKME
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein | 9.0e-49 | 34.42 | Show/hide |
Query: AANGDASGCWPQFPRNDLFDPQSQFEPQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMR
A D + W P N D PP K+ R S + S SN K + +FFKT++C KF+AG C NCNFAH VE++R
Subjt: AANGDASGCWPQFPRNDLFDPQSQFEPQPPPFKRARNSEENQSDPMPYPPSNSRVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMR
Query: QPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTT
+PPPNWQEIV E+++S +++ K + C+KFY E CPYG+ C FLH D++ R RES AIS+G
Subjt: QPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTT
Query: GTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL-------SVGRDGEASN-----
G G S SSS L + ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL G+DG + N
Subjt: GTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQL-------SVGRDGEASN-----
Query: -----SALNIKPLVVAAEAPSSS--------AMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
L+ +++ P ++ A+ SSAV + G R KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt: -----SALNIKPLVVAAEAPSSS--------AMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
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| AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein | 1.2e-05 | 27.1 | Show/hide |
Query: KTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
KT +C K+ + G C G +C FAHG++++R +R K ++CR G+ CPYG RC+F H + + + F+
Subjt: KTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
Query: SAISIGT
S++ + T
Subjt: SAISIGT
|
|
| AT1G68200.2 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein | 1.2e-05 | 27.1 | Show/hide |
Query: KTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
KT +C K+ + G C G +C FAHG++++R +R K ++CR G+ CPYG RC+F H + + + F+
Subjt: KTRMCAKF-KAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGLREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
Query: SAISIGT
S++ + T
Subjt: SAISIGT
|
|
| AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein | 3.8e-23 | 34.3 | Show/hide |
Query: KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFW
K KLC KF G CPY C+F H P +++ ++ R RES A+S+G G +V+ TL++ N W
Subjt: KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFW
Query: KTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR--DGE---ASNSALNIK-----PLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIY
KT++C KW+ TG+CPFG CHFAHG SEL G +GE +++ L+ K V + +P S+ S+ + G R KWKGP KI+R+Y
Subjt: KTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR--DGE---ASNSALNIK-----PLVVAAEAPSSSAMSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIY
Query: ADWLDDL
DW+DD+
Subjt: ADWLDDL
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| AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein | 3.1e-81 | 49.14 | Show/hide |
Query: NDLFDPQSQFEPQ---PPPFKRARNSEENQSDP---MPYPPSNS-----RVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPP
+ L + QSQ +P P KR R ++N +P P P S++ ++PP PVNKG +NIF+KTRMCAKF+AG CRNG CNFAHG+ED+RQPP
Subjt: NDLFDPQSQFEPQ---PPPFKRARNSEENQSDP---MPYPPSNS-----RVHPPNAPVNKGVSNIFFKTRMCAKFKAGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPP
Query: NWQEIVG------------LREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMN
NWQEIVG RE ++ +NW DDQKII +MKLCRKF GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T +
Subjt: NWQEIVG------------LREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMN
Query: GSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR-DGEASN--SALNIKPLVVAAEA----PSSSA
+ S E +R S V + V V+ +WKT+LC K++ITG CPFG+KCHFAHGQ+EL SVGR +GEA N +++N + +V A EA P +
Subjt: GSDSAYPEASRAASSSVSDTLRATNVNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGEKCHFAHGQSELQLSVGR-DGEASN--SALNIKPLVVAAEA----PSSSA
Query: MSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKME
+ S EG+ K+CLLKW KKINRIY DW+DDLP+ S +E
Subjt: MSAPSSAVPEGQGKRCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKME
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