; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC09g0587 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC09g0587
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationMC09:5379026..5379821
RNA-Seq ExpressionMC09g0587
SyntenyMC09g0587
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014351.1 Exopolygalacturonase-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.33e-10577.83Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTIS S I T DDCVSIGHSCEK+TVTNVTCG GHG+++GSL KYK EKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA+ +S SA  
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIF++ +MR +KNPIIIDQTY T+KK  SKWKIS+VHFKNIRGTSTTNVAVLLECS LFPCEGVEL+DINL+Y G + +NTTIVSSCLNAKI T GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        P C
Subjt:  PPC

XP_022153668.1 exopolygalacturonase-like [Momordica charantia]5.64e-12391.13Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTISDSVI T DDC+SIGHSCEKVTVTNVTCG GHGL+VGSL KY KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWA  VS SATE
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED IMRN+KNPIIIDQTY T +KK SKW+ISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

XP_022991773.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]1.47e-10477.34Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTIS S I T DDCVSIGHSCEK+TVTNVTCG GHG+++GSL +YK EKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S SA  
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        I+F++ +MR +KNPIIIDQTY T EKK SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECS LFPCEGVEL+DINL+Y G + +NTT VSSCLNAKI T GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        P C
Subjt:  PPC

XP_023549400.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.42e-10677.83Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTIS S I T DDCVSIGHSCEK+TVTN+TCG GHG+++GSL +YK EKSV  VLV+NCTIFN TNGARIKTWA+ +S SA  
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIF++ +MR +KNPIIIDQTY T+KK  SKWKIS+VHFKNIRGTSTTNVAVLLECS LFPCEGVEL+DINL+Y G +S+NTTIVSSCLNAKI T GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

XP_031745093.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus]1.93e-10578.33Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P NSPNTDGMHL+TSKLVTI++SVI T DDCVSIGHS E +TVTNVTCG GHGL+VGSL KY KEK V  VLVKNCTIFN TNGARIKTWA  VS  A+ 
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED +M N+KNPIIIDQTY T+KK  S WK+S+V FKNIRGTSTTNVAVLLECS LFPCEGVEL+DINL+Y GTN RNTTIVSSC NAKIAT GV+ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like7.22e-10479.31Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P NSPNTDGMHL+TSKLVTI++SVI T DDCVSIGHS E + VTNVTCG GHGL+VGSL KY KEKSV  VLVKNCTIFN TNGARIKTWA  +S  A+ 
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED +M N+KNPIIIDQTY T+KK  S WKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECS L PCEGVEL+DINL Y GTN RNTTIVSSC NAKIAT GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

A0A5A7U0D6 Exopolygalacturonase-like1.02e-10478.82Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P NSPNTDGMHL+TSKLVTI++SVI T DDCVSIGHS E + VTNVTCG GHGL+VGSL KY KEKSV  VLVKNCTIFN TNGARIKTWA  +S  A+ 
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED +M N+KNPIIIDQTY T+KK  S WKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECS L PCEGVEL+DINL Y GTN RNTTIVSSC NAKI T GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like7.22e-10479.31Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P NSPNTDGMHL+TSKLVTI++SVI T DDCVSIGHS E + VTNVTCG GHGL+VGSL KY KEKSV  VLVKNCTIFN TNGARIKTWA  +S  A+ 
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED +M N+KNPIIIDQTY T+KK  S WKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECS L PCEGVEL+DINL Y GTN RNTTIVSSC NAKIAT GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKG-SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

A0A6J1DI36 exopolygalacturonase-like2.73e-12391.13Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTISDSVI T DDC+SIGHSCEKVTVTNVTCG GHGL+VGSL KY KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWA  VS SATE
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        IIFED IMRN+KNPIIIDQTY T +KK SKW+ISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        PPC
Subjt:  PPC

A0A6J1JX85 exopolygalacturonase-like7.12e-10577.34Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PGNSPNTDGMHL+TSKLVTIS S I T DDCVSIGHSCEK+TVTNVTCG GHG+++GSL +YK EKSV+ VLV+NCTIFN TNGARIKTWA  +S SA  
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP
        I+F++ +MR +KNPIIIDQTY T EKK SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECS LFPCEGVEL+DINL+Y G + +NTT VSSCLNAKI T GVQ P
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYET-EKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIP

Query:  PPC
        P C
Subjt:  PPC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24548 Exopolygalacturonase (Fragment)7.7e-4548.53Show/hide
Query:  SPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATEIIF
        S NTDG+H+  S  V I ++ I T DDC+S+G   + + +TN+TCG GHG++VGSL +YK E+SVVG+ VKNCTI  + NG RIKTW +     A+E+ F
Subjt:  SPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATEIIF

Query:  EDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQI
        +D  M ++  PI+IDQ Y      T +  S  K+S + FKNI+GTSTT  AV L CS  FPC GVEL DI+L YSG     T++   C N K    G QI
Subjt:  EDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQI

Query:  PPPC
        P  C
Subjt:  PPPC

P49062 Exopolygalacturonase clone GBGE1843.8e-4447.6Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P  SPNTDG+HL+ +  V+I DS I T DDCVS+G     VTV  V CG GHGL+VGSL KYK E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW       A +
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSG------TNSRNTTIVSSCLNAKIATS
        I FE+ IM+++KNPIIIDQ Y +    S+  ISD+ FKNIRGT+ T   V + CS   PC+GV + D+NL Y G       +S    + + C NA +   
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSG------TNSRNTTIVSSCLNAKIATS

Query:  GVQIPPPC
        G    P C
Subjt:  GVQIPPPC

Q05967 Polygalacturonase2.2e-4448.31Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSL-DKYKEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P NSPNTDG+H++ S  V I+DS   T DDC+S+G   E++ +T VTCG GHG++VGSL     EK VVGV V+NCT  NT NG RIKTW         +
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSL-DKYKEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-----GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG
        + FED I++N+ NP++IDQ Y    K      S+ KIS V F+NI+GTS T  AV L  S   PCEG+E+ DI++ YSG   +     SSC N K +  G
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKK-----GSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG

Query:  VQIPPPC
         Q PP C
Subjt:  VQIPPPC

Q39786 Polygalacturonase2.1e-4245.41Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P  SPNTDG+H+  S+ V I  S I T DDC+SIG   + + +  +TCG GHG+++GSL K++ E+ V G+ + NCTI NT+NGARIKTW      + +E
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG
        I FED  M N+ +PI+IDQ Y       + + SK K+S++ FKNIRGTS    A+   CS   PC+ VEL DI++ ++G         S CLN K  TSG
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG

Query:  VQIPPPC
           P PC
Subjt:  VQIPPPC

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)1.7e-4445.59Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        PG S NTDG+H+  SK VTI+++ I T DDC+SIG   + VT+T V CG GHG+++GSL +Y  EK V G+ VK CT   T NG R+KTW      +AT+
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG
        + F+D  M N++NP+I+DQ Y      + +  S+ K+S+++F NIRGTST  VAV++ CS   PC  +++ +INL+Y G     T   S+C N K   SG
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG

Query:  VQIP
         Q+P
Subjt:  VQIP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02790.1 polygalacturonase 42.7e-4547.6Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P  SPNTDG+HL+ +  V+I DS I T DDCVS+G     VTV  V CG GHGL+VGSL KYK E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW       A +
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSG------TNSRNTTIVSSCLNAKIATS
        I FE+ IM+++KNPIIIDQ Y +    S+  ISD+ FKNIRGT+ T   V + CS   PC+GV + D+NL Y G       +S    + + C NA +   
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSG------TNSRNTTIVSSCLNAKIATS

Query:  GVQIPPPC
        G    P C
Subjt:  GVQIPPPC

AT3G07830.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.4e-4145.19Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AEMVSKSAT
        P  SPNTDG+HL  S  V+I +S I T DDCVS+G     + V NV CG GHG++VGSL +Y  E+ V G+ V NCT+  T NG RIKTW +   S +A+
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AEMVSKSAT

Query:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATS
         I FE+ I+RN+ NPI+IDQ Y       ++K S  K++++ F+ IRGTS    AV L CS  +PCE V++ DIN+ Y+G +   T +   C N +    
Subjt:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATS

Query:  GVQIPPPC
        G Q P  C
Subjt:  GVQIPPPC

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.2e-4046.86Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE
        P  S NTDG+H+  S  V +  + I T DDCVSIG   E + V NV CG GHG+++GSL +Y  E+ V GV V+ C I NT NG RIKTW       A+ 
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATE

Query:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETE---KKG--SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG
        I+FED  M N+  P++IDQ Y      K G  SK K+SDV  KNI+GTS T VAV L CS   PC  + L DINL ++G   +    VS+C N K   SG
Subjt:  IIFEDNIMRNIKNPIIIDQTYETE---KKG--SKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSG

Query:  VQIPPPC
          +P  C
Subjt:  VQIPPPC

AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein4.2e-4647.69Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKS-AT
        P +SPNTDG+H+  S  V  S S I T DDCVSIG    ++T+T++ CG GHG++VGSL +Y  EK V G++VK+C I  TTNG RIKTWA     S AT
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKY-KEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKS-AT

Query:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYS--------GTNSRNTTIVSSC
         + FE+ IM N+ NPIIIDQ+Y           SK ++S+++FKNIRGTS++ VAV L CS   PC+ V L++++L  S         +N  N  + SSC
Subjt:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYS--------GTNSRNTTIVSSC

Query:  LNAKIATSGVQIPPPC
         N +    G QIPPPC
Subjt:  LNAKIATSGVQIPPPC

AT5G48140.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.5e-4042.31Show/hide
Query:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AEMVSKSAT
        P  SPNTDG+H+  S  + I +S I T DDCVS+G   + + V  VTCG GHG+++GSL +Y  E++V G+ + NCT+  T NG RIKTW +   + +A+
Subjt:  PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYK-EKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AEMVSKSAT

Query:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATS
        +I FE+ +++N+ NPI+IDQ Y       ++K S  K++++ FK IRGTS    AV L CS  +PC+ VE+ D+N+ Y+G +   T     C N      
Subjt:  EIIFEDNIMRNIKNPIIIDQTY-----ETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATS

Query:  GVQIPPPC
        G QIP  C
Subjt:  GVQIPPPC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CCTGGAAATAGCCCCAACACTGACGGTATGCACCTCACCACCTCGAAATTGGTCACCATTTCTGATAGCGTCATCGACACTAGTGACGACTGCGTCTCCATCGGCCACAG
TTGTGAAAAAGTCACCGTCACCAACGTCACCTGTGGCCTCGGACATGGCCTCAATGTGGGCAGCCTGGACAAGTACAAGGAGAAAAGTGTGGTTGGTGTTCTAGTGAAGA
ACTGCACCATTTTCAATACCACCAACGGTGCTAGAATCAAGACATGGGCAGAGATGGTGTCAAAATCAGCAACGGAAATTATCTTCGAAGACAACATAATGAGAAACATC
AAGAACCCCATAATCATCGACCAAACCTACGAGACAGAAAAAAAAGGATCCAAGTGGAAGATCAGCGACGTTCACTTCAAGAACATTCGCGGTACGTCGACGACAAATGT
GGCGGTGTTGTTGGAGTGCAGCGCATTGTTTCCGTGCGAGGGGGTCGAGCTGAAAGACATTAACTTGGCTTACAGCGGCACCAACTCGAGAAACACTACCATCGTCTCGT
CGTGTTTGAATGCCAAGATAGCTACTTCTGGGGTGCAGATCCCTCCTCCTTGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCTGGAAATAGCCCCAACACTGACGGTATGCACCTCACCACCTCGAAATTGGTCACCATTTCTGATAGCGTCATCGACACTAGTGACGACTGCGTCTCCATCGGCCACAG
TTGTGAAAAAGTCACCGTCACCAACGTCACCTGTGGCCTCGGACATGGCCTCAATGTGGGCAGCCTGGACAAGTACAAGGAGAAAAGTGTGGTTGGTGTTCTAGTGAAGA
ACTGCACCATTTTCAATACCACCAACGGTGCTAGAATCAAGACATGGGCAGAGATGGTGTCAAAATCAGCAACGGAAATTATCTTCGAAGACAACATAATGAGAAACATC
AAGAACCCCATAATCATCGACCAAACCTACGAGACAGAAAAAAAAGGATCCAAGTGGAAGATCAGCGACGTTCACTTCAAGAACATTCGCGGTACGTCGACGACAAATGT
GGCGGTGTTGTTGGAGTGCAGCGCATTGTTTCCGTGCGAGGGGGTCGAGCTGAAAGACATTAACTTGGCTTACAGCGGCACCAACTCGAGAAACACTACCATCGTCTCGT
CGTGTTTGAATGCCAAGATAGCTACTTCTGGGGTGCAGATCCCTCCTCCTTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
PGNSPNTDGMHLTTSKLVTISDSVIDTSDDCVSIGHSCEKVTVTNVTCGLGHGLNVGSLDKYKEKSVVGVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAEMVSKSATEIIFEDNIMRNI
KNPIIIDQTYETEKKGSKWKISDVHFKNIRGTSTTNVAVLLECSALFPCEGVELKDINLAYSGTNSRNTTIVSSCLNAKIATSGVQIPPPC