CuGenDBv2

Gene ID	MC09g1461
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	DNA repair REX1-B protein
Genome location	MC09:20569317..20572810
RNA-Seq Expression	MC09g1461
Synteny	MC09g1461
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR039491 - Required for excision 1-B domain-containing protein

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7012978.1 hypothetical protein SDJN02_25732 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.89e-113

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4.89e-113

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        EI ALED
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XP_022150684.1 uncharacterized protein LOC111018757 [Momordica charantia]

6.34e-140

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XP_022945518.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita moschata]

7.11e-114

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XP_023541138.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.01e-114

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A1S3BGI9 uncharacterized protein LOC103489347

2.37e-113

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A0A5D3CFT2 Uncharacterized protein

2.37e-113

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A0A6J1DAT6 uncharacterized protein LOC111018757

3.07e-140

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A0A6J1G147 uncharacterized protein C19orf60 homolog

3.44e-114

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A0A6J1HYI6 uncharacterized protein C19orf60 homolog

3.44e-114

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q17Q97 Required for excision 1-B domain-containing protein

6.0e-04

29.9

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        L+++  ++Q  RA+A+ +L+ G  +Y++SG       Y+    E+T  F   S++V+ +E++   P    L LA  +RS+Q  E+ +L   A +QL+
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G04910.1 unknown protein

1.6e-68

62.21

Show/hide

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        EDF  K+SL + +  + + E G +              S TL LLR  LEIQQRRA+AYA LK GF EY+ SG E  YQ+LCSEITTEF+ CSKQV ++E
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Query:  SDFRNPDHSRLELADLLRSVQLQEKQKLHLTAQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNSLKEAIKGVQDAVT
        S F NP+  R +LA LL  +Q QEKQKLHLT  IQ+LKKAGRPSER+++HENC+FK P +HECVH+HEITEA+GTEEAEADAE+DN+LKEAI+GVQDAVT
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Query:  TINEHMEEVRYEIAALE
        +INE++E++RYEI ALE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

TTAAAAGCTTCCTTAGTAGTGTTCGCTTCGCCTCGACATAGAGTTAGAAGCTTCAGGTTGAAGACTGAAGTCGAAGCGAAAAAAAAAATCATTACGAGAATGGAAGATTT
TGACAATAAGCTCTCTCTGGCTGAACCCATGGAGATGGAGGAAGATCAAGAATTCGGGGCCACCGATCCCTCCAACACTCTTGGTTTGCTCCGCAAGTTTCTTGAAATCC
AGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAGAGGGGTTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAAGTATCTTACCAACAACTTTGCAGTGAGATCACGACGGAG
TTCAATTATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATTGAGTCAGATTTCCGGAATCCTGATCACAGCAGGCTCGAGTTAGCTGACCTGCTTAGATCTGTTCAATTACAGGAGAA
GCAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTACTGAAGAAGGCTGGCCGTCCATCAGAGCGTTTGGTGAGCCACGAGAATTGCAGATTCAAGACGCCTCGAGAGCACG
AGTGCGTGCATGTCCATGAGATAACCGAAGCTTCTGGTACTGAGGAAGCAGAAGCAGATGCCGAATACGACAATTCTCTCAAGGAAGCAATCAAAGGCGTCCAAGATGCT
GTGACCACCATAAACGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATGAGTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TTTAAAAGCTTCCTTAGTAGTGTTCGCTTCGCCTCGACATAGAGTTAGAAGCTTCAGGTTGAAGACTGAAGTCGAAGCGAAAAAAAAAATCATTACGAGAATGGAAGATT
TTGACAATAAGCTCTCTCTGGCTGAACCCATGGAGATGGAGGAAGATCAAGAATTCGGGGCCACCGATCCCTCCAACACTCTTGGTTTGCTCCGCAAGTTTCTTGAAATC
CAGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAGAGGGGTTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAAGTATCTTACCAACAACTTTGCAGTGAGATCACGACGGA
GTTCAATTATTGCTCTAAACAAGTCATTGACATTGAGTCAGATTTCCGGAATCCTGATCACAGCAGGCTCGAGTTAGCTGACCTGCTTAGATCTGTTCAATTACAGGAGA
AGCAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTACTGAAGAAGGCTGGCCGTCCATCAGAGCGTTTGGTGAGCCACGAGAATTGCAGATTCAAGACGCCTCGAGAGCAC
GAGTGCGTGCATGTCCATGAGATAACCGAAGCTTCTGGTACTGAGGAAGCAGAAGCAGATGCCGAATACGACAATTCTCTCAAGGAAGCAATCAAAGGCGTCCAAGATGC
TGTGACCACCATAAACGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATGAGTAATCTTGTGACATATAAGATGATATCTTGCTCGCAATTCAATTGA
TAACAGGAACATACCTGTACAGATATACAGAATCGGTTTCGAAAAATTTTCTTCTGCGCGTTTTGCTTGATCTTTCACCTTCTTTGATGAGATTTATCAACTGAATTCTT
AATTTTTAGCCTCGATTTTTGTGTGTCTACTCTAGATTGGGAAATAAAGCAGGGAGAGTGATTAGGAGAAGGTCAAGGATACTGTTTCAAGAGTGTGGTTGGAGCCTTCC
AGCCTTTTTTACCTCTGCCATTTGCTCCAAACGAGACTGAGGAACTGAAGTCAATGTTTCAAATTTCCTTTACGCTGCTGAAGTTCAGTGGTGGTTTGCAACTTGAAATT
CAATCCGAGGGAAAATTTGATGAACTGAATTGATCCGATTGAAATTGAACCAATCTATTTGTATTTGGACCACGGGGCTATATTCCAGTTGGTGTAAGATGGTTCTGTTT
GATTTTTCCTTGAAGCAGCAAATTGTCTGTTCAATTTCATATATGAGCAGGACAGCATTGAAAGAAGGAAAAAAACCAAACATTTTCCTATGGCGTAAATCAAATTTCGT
TATATATTGCTATATACTCGGCTAGACTAGTGGTGTTTACAATTGATTTCCGCTCCCATAAACTCCACTGTCCATGAATTTTAATACCTAATAATTTAGTTCTTGTAGTT
TATCCAATATAAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

LKASLVVFASPRHRVRSFRLKTEVEAKKKIITRMEDFDNKLSLAEPMEMEEDQEFGATDPSNTLGLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITTE
FNYCSKQVIDIESDFRNPDHSRLELADLLRSVQLQEKQKLHLTAQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNSLKEAIKGVQDA
VTTINEHMEEVRYEIAALEDE

MC09g1461 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome