; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC09g1895 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC09g1895
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionNuclear proteasome inhibitor UBLCP1
Genome locationMC09:23722506..23725411
RNA-Seq ExpressionMC09g1895
SyntenyMC09g1895
Gene Ontology termsGO:0006470 - protein dephosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0004722 - protein serine/threonine phosphatase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000626 - Ubiquitin-like domain
IPR004274 - FCP1 homology domain
IPR011943 - HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIID
IPR023214 - HAD superfamily
IPR029071 - Ubiquitin-like domain superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008445998.1 PREDICTED: ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucumis melo]1.30e-22193.03Show/hide
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XP_022956710.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucurbita moschata]1.92e-22394.24Show/hide
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XP_022998279.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucurbita maxima]2.25e-22293.94Show/hide
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A0A1S3BE06 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP16.28e-22293.03Show/hide
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A0A6J1DD82 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP16.46e-238100Show/hide
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A0A6J1GYI7 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP19.32e-22494.24Show/hide
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A0A6J1KDX1 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP11.09e-22293.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2KJD7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.9e-9354.84Show/hide
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Q5FWT7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.5e-9355.16Show/hide
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Q5ZJJ8 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 13.9e-9454.84Show/hide
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        N NYKIT +LD  AMITV +  RG  D KPLG+IW +F E+Y+ +NTIMFDD+ RNF+MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  SLDHNDWELY
         L+H  WE Y
Subjt:  SLDHNDWELY

Q8W3M6 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase1.9e-15482.01Show/hide
Query:  AAAAASASSSEEEITLTLKWSGKEYTVRVCADDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQLDSP
        +AAAA +  +EEE+TLT+KW+GKEYTVR+CADDSV ELKRRIC LT VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQ +SP
Subjt:  AAAAASASSSEEEITLTLKWSGKEYTVRVCADDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQLDSP

Query:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGK+E +D+KDK+VNKQKLRRRI Q KI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
Subjt:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL

Query:  KMGQLGVLNNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVLNNPNYK+TALLDHLAMITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRNFVMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
Subjt:  KMGQLGVLNNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL

Query:  AIAELDDLSSLDHNDWELYTEDAPKRRR
         IAEL DLSSL H+ WE +++D  KRRR
Subjt:  AIAELDDLSSLDHNDWELYTEDAPKRRR

Q8WVY7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.9e-9354.84Show/hide
Query:  ITLTLKWSGKEYTVRVCA-DDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQLDSPEIIDDFELG
        + + +KW G+EY+V   + DD+V +LK+ +  LT VLP+RQKLL  KV  K A++ + L  L LK + K+ M+GT E   +D++    D+ ++++DF++ 
Subjt:  ITLTLKWSGKEYTVRVCA-DDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQLDSPEIIDDFELG

Query:  KDEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLN
        +DEV+++++++ N  K+ RR+ + K+E+ NP REGKKLLVLD+DYTLFDHRS AE  ++LMRPYLHEFLT+AY +YDI+IWSAT++KW+E KM +LGV  
Subjt:  KDEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLN

Query:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS
        N NYKIT +LD  AMITV +  RG  D KPLG+IW +F EFY+ +NTIMFDD+ RNF+MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  SLDHNDWELY
         L+H  WE Y
Subjt:  SLDHNDWELY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G06599.1 ubiquitin family protein1.4e-15582.01Show/hide
Query:  AAAAASASSSEEEITLTLKWSGKEYTVRVCADDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQLDSP
        +AAAA +  +EEE+TLT+KW+GKEYTVR+CADDSV ELKRRIC LT VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQ +SP
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Query:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGK+E +D+KDK+VNKQKLRRRI Q KI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
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Query:  KMGQLGVLNNPNYKITALLDHLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVLNNPNYK+TALLDHLAMITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRNFVMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
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Query:  AIAELDDLSSLDHNDWELYTEDAPKRRR
         IAEL DLSSL H+ WE +++D  KRRR
Subjt:  AIAELDDLSSLDHNDWELYTEDAPKRRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GCCGCTGCCGCTGCCTCAGCATCCAGTTCAGAGGAAGAGATAACATTGACGCTGAAGTGGAGCGGAAAGGAGTATACTGTGCGAGTTTGCGCAGATGACTCGGTGGGTGA
GCTGAAGCGTCGAATCTGCGAGCTTACTAACGTCTTGCCCAAACGCCAAAAGCTTCTTTATCCCAAAGTTGGATCCAAGCTAGCCGATGATTCGCTTTTGCTTTCTCACC
TTCCGCTCAAGTCTTCTCTCAAGATGACCATGATCGGAACTGTTGAAGATGATATTATCGTGGATCAACTGGACTCCCCTGAAATTATTGACGATTTTGAACTTGGGAAA
GATGAAGTCATTGACATTAAGGATAAGGATGTCAATAAGCAGAAACTGAGGAGACGTATTGGTCAATGCAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCGTGAAGGGAAGAAATT
GCTTGTTCTGGATATTGATTATACGCTTTTTGATCATCGCTCTCCTGCAGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGGCCTTATCTTCATGAATTTCTGACAGCTGCTTATGCTG
AATATGACATCATGATATGGTCAGCAACCAGCCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGACAGCTCGGTGTTCTCAACAATCCAAACTACAAAATCACTGCCCTTCTAGAC
CATTTAGCTATGATCACAGTTCAGTCAGATCATCGTGGGACCTTCGATTGCAAGCCACTAGGCTTGATCTGGGCACAGTTTCCTGAGTTCTACAATTCGAGAAATACTAT
AATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTTTGTAATGAATCCACAAAATGGTCTGGTAATAAAGCCATTCAGGAAAGCTCATGCAAATCGTGATAGTGACCAGGAGCTTATGA
AGCTGACGCAATACTTGCTTGCCATTGCGGAGCTTGACGACTTGAGTTCTCTTGATCATAATGATTGGGAACTATACACTGAGGATGCTCCAAAAAGACGGCGGCATGCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCGCTGCCGCTGCCTCAGCATCCAGTTCAGAGGAAGAGATAACATTGACGCTGAAGTGGAGCGGAAAGGAGTATACTGTGCGAGTTTGCGCAGATGACTCGGTGGGTGA
GCTGAAGCGTCGAATCTGCGAGCTTACTAACGTCTTGCCCAAACGCCAAAAGCTTCTTTATCCCAAAGTTGGATCCAAGCTAGCCGATGATTCGCTTTTGCTTTCTCACC
TTCCGCTCAAGTCTTCTCTCAAGATGACCATGATCGGAACTGTTGAAGATGATATTATCGTGGATCAACTGGACTCCCCTGAAATTATTGACGATTTTGAACTTGGGAAA
GATGAAGTCATTGACATTAAGGATAAGGATGTCAATAAGCAGAAACTGAGGAGACGTATTGGTCAATGCAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCGTGAAGGGAAGAAATT
GCTTGTTCTGGATATTGATTATACGCTTTTTGATCATCGCTCTCCTGCAGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGGCCTTATCTTCATGAATTTCTGACAGCTGCTTATGCTG
AATATGACATCATGATATGGTCAGCAACCAGCCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGACAGCTCGGTGTTCTCAACAATCCAAACTACAAAATCACTGCCCTTCTAGAC
CATTTAGCTATGATCACAGTTCAGTCAGATCATCGTGGGACCTTCGATTGCAAGCCACTAGGCTTGATCTGGGCACAGTTTCCTGAGTTCTACAATTCGAGAAATACTAT
AATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTTTGTAATGAATCCACAAAATGGTCTGGTAATAAAGCCATTCAGGAAAGCTCATGCAAATCGTGATAGTGACCAGGAGCTTATGA
AGCTGACGCAATACTTGCTTGCCATTGCGGAGCTTGACGACTTGAGTTCTCTTGATCATAATGATTGGGAACTATACACTGAGGATGCTCCAAAAAGACGGCGGCATGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
AAAAASASSSEEEITLTLKWSGKEYTVRVCADDSVGELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSHLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQLDSPEIIDDFELGK
DEVIDIKDKDVNKQKLRRRIGQCKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLNNPNYKITALLD
HLAMITVQSDHRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLSSLDHNDWELYTEDAPKRRRHA