; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC10g0408 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC10g0408
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X1
Genome locationMC10:3287792..3289795
RNA-Seq ExpressionMC10g0408
SyntenyMC10g0408
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136197.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucumis sativus]2.42e-6287.61Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG NC+AIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_008466002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X1 [Cucumis melo]2.32e-6085.84Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG NC+AIPYQV LS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]3.18e-6796.46Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG NCYAIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKRREDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_023553751.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.30e-6086.49Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG NC+AIPYQV++S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKRQKR++DNG
Subjt:  SKRQKRREDNG

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]2.51e-6490.27Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMS+QG NC+AIPYQVV+S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKR+EDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQ80 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X11.12e-6085.84Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDE M+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG NC+AIPYQV LS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X11.54e-6796.46Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG NCYAIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKRREDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X12.74e-5384.26Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGNCYAIPYQVVLSS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG   A+ + +  S 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGNCYAIPYQVVLSS

Query:  KRQKRRED
         ++ RRE+
Subjt:  KRQKRRED

A0A6J1HIC3 protein SAMBA isoform X19.23e-6085.59Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQG NC+AIPYQV++S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKRQKR++D+G
Subjt:  SKRQKRREDNG

A0A6J1HU80 protein SAMBA isoform X11.26e-5784.68Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS
        M +SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INL SRQG NC+AIPYQVV+S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQG-NCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKR KR++DNG
Subjt:  SKRQKRREDNG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA7.3e-2159.55Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGN
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDE M  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRS I+L+SR+GN
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein5.2e-2259.55Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGN
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDE M  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRS I+L+SR+GN
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGTCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGACGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCAGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTAATTGCTATGCAATTCCCTATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAGAGAAGATAATGGG
TCGGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGTCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGACGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCAGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTAATTGCTATGCAATTCCCTATCAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAGAGAAGATAATGGG
TCGGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEVMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSSINLMSRQGNCYAIPYQVVLSSKRQKRREDNG
SD