; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC10g0478 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC10g0478
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationMC10:3873166..3875983
RNA-Seq ExpressionMC10g0478
SyntenyMC10g0478
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA8545449.1 hypothetical protein F0562_020233 [Nyssa sinensis]2.68e-12993.69Show/hide
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XP_008452238.1 PREDICTED: ras-related protein RABD1 isoform X1 [Cucumis melo]6.52e-13096.43Show/hide
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XP_022136911.1 ras-related protein RABD1 [Momordica charantia]1.43e-133100Show/hide
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XP_022929522.1 ras-related protein RABD1-like [Cucurbita moschata]4.59e-13096.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein3.16e-13096.94Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X13.16e-13096.43Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD16.95e-134100Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like2.22e-13096.94Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like2.22e-13096.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM17.3e-8480.2Show/hide
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        IDRYANDSV KLLVGNKCDL EN+ VDT  A+A A E+GIPFLETSAK+SINVE+AFL M+A IKK K GSQ +   K S  VQMKG+PI+Q+    S C
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P40392 Ras-related protein RIC12.0e-8680.71Show/hide
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        IDRYA+++V KLLVGNKCDL EN+VV  +  KALADE+GIPFLETSAKD+ NVE+AF+TMA EIK +M SQP++  S   TVQM+GQP+ Q+SSCCS
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Q05737 GTP-binding protein YPTM25.0e-8580.2Show/hide
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        IDRYA+D+V KLLVGNK DL  NKVV T+TAKA ADE+GIPF+ETSAK++ NV+QAF+ MAA IK +M SQP++  +   TVQ++GQP+ QK+SCCS
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c5.0e-8579.08Show/hide
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        IDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV T+TAKA ADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP+      TVQ++GQP+ Q+S CCS
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD12.3e-9085.28Show/hide
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        IDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV T+T +ALADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ ++ K+S  GTVQMKGQPI+Q +  C
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 57.4e-8477.66Show/hide
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        IDRYA+D+V KLLVGNK DL EN+ +  +TAKA ADE+GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ M+A IK++M SQP+   +   TVQ++GQP+ QK+ CCS
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.0e-6158.82Show/hide
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        DYL KLLLIGDS VGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVT+  SFNN++ W+  
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        I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +ALADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    +  +  G    K            +KS
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        +CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.7e-9185.28Show/hide
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        IDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV T+T +ALADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ ++ K+S  GTVQMKGQPI+Q +  C
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C3.6e-8679.08Show/hide
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        IDRYA+++V KLLVGNKCDL   KVV T+TAKA ADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP+      TVQ++GQP+ Q+S CCS
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.1e-8478.57Show/hide
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        IDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV T+TAKA ADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP+      TVQ++GQP+ Q+S CCS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTTGTTAATCGGCGACTCGTCGGTGGGAAAATCGTGTCTGCTTCTCAGATTTGCAGATGATTCTTATGTGGATAGCTATATAAGTACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCA
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CAAAAGAGCAGCTGTTGCAGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QKSSCCS