; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC10g0839 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC10g0839
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationMC10:7090164..7092168
RNA-Seq ExpressionMC10g0839
SyntenyMC10g0839
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022136380.1 uncharacterized protein LOC111008104 [Momordica charantia]5.88e-298100Show/hide
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XP_022931532.1 homeobox protein prospero-like [Cucurbita moschata]5.19e-22280.54Show/hide
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XP_022985085.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucurbita maxima]9.02e-22380.76Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.22e-22380.76Show/hide
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]6.59e-22381.88Show/hide
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        LFLDGKLVPLQ+SSVKPSVN  KSTRC   PETAA+SRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKK+YQSSS           AKNE+HKTT+ S
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        SSYFSEANSKALKY LH SSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    NNPPRMR
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        VTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG LF+GT  SSSRNHQSS++ S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein4.14e-21478.57Show/hide
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        KTT  SSSSYFSEANSKALKY LH SSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    
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        NNPPRMR+VKPR KSE+ NPRS  TADH      RVGRSPIRRT GES+SS  RLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK RGME
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        RSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG L       SSRNHQ SS+N S+  +RT
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein1.56e-21378.7Show/hide
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        LF DGKLVPLQ+SS KPSVN  KSTRC   PET  +SRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKK+YQSSS               AKNENHKT
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        T  SSSSYFSEANSKALKY LH SSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    NN
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        PPRMR+VKPR KSE+ NPRST  ADH      RVGRSPIRRT GES+SS  RLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK RGMERS
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        YSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG L       SSRNHQ SS+N S+  +RT
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A0A6J1C3Q8 uncharacterized protein LOC1110081042.85e-298100Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like2.52e-22280.54Show/hide
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        FLDGKLVPLQ+SSVKPSVN  KSTRC   PET  ++RRRVE+EC+TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKK+YQSSS         AKNENHKTT  SSSS
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        YFSEANSKALKY LH +SKSSL+SS DSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN NPI LHRNPN    NNPPRMR+V
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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.134.37e-22380.76Show/hide
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Query:  KPRSKSETTNPRSTA--DH-----RVGRSPIRRTQGESASSRLG-IRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQRGMERSYSANVRVTP
        KPR KSET NPRST+  DH     RVGRSP+RRT GES+SSRLG IRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFK RGMERSYSANVRVTP
Subjt:  KPRSKSETTNPRSTA--DH-----RVGRSPIRRTQGESASSRLG-IRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQRGMERSYSANVRVTP

Query:  VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASS--SRNHQSSTNRST
        VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFG LF+GT   S  S +  SSTNR+T
Subjt:  VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASS--SRNHQSSTNRST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein5.0e-6545.76Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MASACV + G+SPE F         S YGW SPR+S +R   D +  SS +   +S P P        EI+DP     V +FEF L+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPE-----TAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANS
         DGKLVPL+ S  K +     +T      E        KS RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK++   ++ + E     SSSS  +   +
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPE-----TAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANS

Query:  KALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPNGTNNPPRMRMVKPRSK
         + K  LH  SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD D KP++NP    R  + N   N PR+R+ KPR  
Subjt:  KALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPNGTNNPPRMRMVKPRSK

Query:  SETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSR-LGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQ-RGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSS
           + P                 G S+SS  +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ KQ  GM RSYSANVR+TPVLNVPVCS 
Subjt:  SETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSR-LGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQ-RGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSS

Query:  LRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSS-------RNHQSSTNRSTRLDRT
          G         FGQLFS +++SSS       ++   S     R++RT
Subjt:  LRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSS-------RNHQSSTNRSTRLDRT

AT1G79060.1 unknown protein2.7e-7449.1Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MAS CVNNV +S +             YG  +PR SFSRD  DG  +S  +A               SEI   +  +   +FEFRL++    MLPADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSK
         DGKLV  Q              +  +  E   K RR     +E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS       TT+++     +++ 
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSK

Query:  ALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIF-LHRN-------PNPNGTNNPPRMR
        +LK  LH SS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD + +PN N I  L+ N       P  +   NPPRMR
Subjt:  ALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIF-LHRN-------PNPNGTNNPPRMR

Query:  MVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKQRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        +V   +         T   RVGRSP+RR+ GE  +S +  RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   ++ RGMERSYS+NVRVTPVLNVP
Subjt:  MVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKQRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLF-SGTAASSSRNHQSSTNRSTR
        VC S+RG S       FGQ F S +++SSS+N+++  N + R
Subjt:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLF-SGTAASSSRNHQSSTNRSTR

AT3G05980.1 unknown protein4.5e-0529.51Show/hide
Query:  LSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVA--MMLPADELFLDGKLVPL-QLSSVKPSVNEFKSTRCDE
        L PRISFS D +DG                 P    E  ++     + V +FEF   + V+   ML ADELF +GKL+P  Q+   +   N    T  +E
Subjt:  LSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVA--MMLPADELFLDGKLVPL-QLSSVKPSVNEFKSTRCDE

Query:  LPETAAKSRRRVEEECST-----------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALK
          E      ++ ++E +            DP   SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+       +S S   S ++S +L+
Subjt:  LPETAAKSRRRVEEECST-----------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALK

AT3G12970.1 unknown protein3.6e-5545.31Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MAS CV NVG SP              + W S ++S +R+               S+P    APA E+E    DP   V +FEF L+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVK-PSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEA--NS
         DGKLVPL+ S V  P      S     +  TA K  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK++     AK +   + SSSS  S +  N 
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVK-PSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEA--NS

Query:  KALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPNGTNNPPRMRMVKPR
        K   +  H+ ++SS S++   S   P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD DNKP              GT N        P 
Subjt:  KALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPNGTNNPPRMRMVKPR

Query:  SKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQ-GESASSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-QRGMERSYSANVRVTPVLNVPVC
        ++S   +     +    R P R TQ  ES  S +  R   V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K   GM RS+SANVR+TPVLNVPV 
Subjt:  SKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQ-GESASSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-QRGMERSYSANVRVTPVLNVPVC

Query:  SSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS
        SSLR   KS     FGQLF+ ++++SS +  SS NR+
Subjt:  SSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGTGTTAACAATGTCGGAATGTCGCCGGAGAACTTTCTCGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCCCCTACGGCTGGCTCAGTCCTCGTATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCACGGATGGCTCCCCCGCCTCCTCTAAGCTCGCCGGAGCTAAATCTAAGCCTAAGCCTGCGCCTGCGCCTGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGG
ATCCTGAACTCTCCGTCTGTGAGTTCGAGTTCCGGCTTCAAGATCCCGTCGCGATGATGCTCCCTGCGGATGAGCTTTTCCTCGATGGAAAGCTGGTGCCGCTCCAGCTC
TCGTCTGTTAAACCATCGGTCAACGAGTTTAAATCCACGAGGTGTGACGAGTTGCCGGAGACTGCTGCTAAATCCCGCCGGAGAGTTGAGGAGGAATGCAGTACGGATCC
GTATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGGCTGAAGAAGGTGTACCAGAGCAGCAGCGCCAAAAATGAAAATCACAAAACGA
CATCGTCATCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATCTTCTTCATTGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCTTCTTCCCTCGATTCCTCGCTGAGCCTT
CCACTTTTGAAGGATTCCGATAGCGAGTCTGTTTCGCTATCTTCATCTCGCGTTTCGCTTTCATCTTCTTCTTCAGGCCACGAACACGAAGATCTCCACAGACTCTCACT
CGATTGCGACAACAAGCCGAACTCAAATCCGATTTTCCTCCATAGGAACCCTAACCCGAACGGCACCAATAATCCGCCGCGCATGAGAATGGTGAAACCGCGGTCTAAAT
CAGAGACAACCAATCCGAGATCAACCGCGGATCATCGAGTAGGACGGAGCCCGATCCGGCGCACGCAAGGGGAATCGGCGAGTAGCAGGTTAGGAATCCGAGGAGTATCC
GTAGACAGTCCCCGAATGAACTCCTCGGGGAAAATCGTATTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCGAGTAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAGCAGAGAGG
AATGGAGCGGTCGTACTCGGCGAACGTGAGAGTGACTCCAGTACTCAACGTTCCAGTCTGTTCTTCCCTGAGAGGATCCTCGAAATCCGCCTCCGTCTTCGGATTCGGGC
AGTTGTTCTCCGGCACCGCCGCAAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAGTAGCACTAACCGCAGTACACGGCTGGATCGAACCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCATGTGTTAACAATGTCGGAATGTCGCCGGAGAACTTTCTCGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCCCCTACGGCTGGCTCAGTCCTCGTATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCACGGATGGCTCCCCCGCCTCCTCTAAGCTCGCCGGAGCTAAATCTAAGCCTAAGCCTGCGCCTGCGCCTGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGG
ATCCTGAACTCTCCGTCTGTGAGTTCGAGTTCCGGCTTCAAGATCCCGTCGCGATGATGCTCCCTGCGGATGAGCTTTTCCTCGATGGAAAGCTGGTGCCGCTCCAGCTC
TCGTCTGTTAAACCATCGGTCAACGAGTTTAAATCCACGAGGTGTGACGAGTTGCCGGAGACTGCTGCTAAATCCCGCCGGAGAGTTGAGGAGGAATGCAGTACGGATCC
GTATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGGCTGAAGAAGGTGTACCAGAGCAGCAGCGCCAAAAATGAAAATCACAAAACGA
CATCGTCATCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATCTTCTTCATTGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCTTCTTCCCTCGATTCCTCGCTGAGCCTT
CCACTTTTGAAGGATTCCGATAGCGAGTCTGTTTCGCTATCTTCATCTCGCGTTTCGCTTTCATCTTCTTCTTCAGGCCACGAACACGAAGATCTCCACAGACTCTCACT
CGATTGCGACAACAAGCCGAACTCAAATCCGATTTTCCTCCATAGGAACCCTAACCCGAACGGCACCAATAATCCGCCGCGCATGAGAATGGTGAAACCGCGGTCTAAAT
CAGAGACAACCAATCCGAGATCAACCGCGGATCATCGAGTAGGACGGAGCCCGATCCGGCGCACGCAAGGGGAATCGGCGAGTAGCAGGTTAGGAATCCGAGGAGTATCC
GTAGACAGTCCCCGAATGAACTCCTCGGGGAAAATCGTATTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCGAGTAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAGCAGAGAGG
AATGGAGCGGTCGTACTCGGCGAACGTGAGAGTGACTCCAGTACTCAACGTTCCAGTCTGTTCTTCCCTGAGAGGATCCTCGAAATCCGCCTCCGTCTTCGGATTCGGGC
AGTTGTTCTCCGGCACCGCCGCAAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAGTAGCACTAACCGCAGTACACGGCTGGATCGAACCTAACTTTGGGGAAAAATCATTCATTAGAAA
AGGGATTTTGGGTAACACCCCTTTCTTGGCTTTCTTCTTCTCTCCTTGATTTTGGCATATACTGTCTCCTCCCCCTGTGAAAGATCGGATTCAACTGCTAATTTTTAACA
CCAAAAAAGAAAAAAAAAATCCAAAACCACATCATGTAAATTTCTTCTGGTTAGTCTAATTTTGAATCTCCTTTCCGATCCATCCATGGTGTCCAGTCCAAATTTGCTTC
TTCTTCCGTTCCTTCTGGCGGATTGGGGATTTTGGTTTTTCGCTGTTCCATCCAAAAGTGGAGGAAGCGCTTGAAGTGCACGCGCGGGGGGCGCGTGCGGGAACTTTAAC
TCTTATTTTCTTGAAGGCTTTTTTCCCGTAATGATGCGTGACATACTTGTTATCTAAAACCCTGTCGCTTTCAAGGATCTCTCCCTTTCACAGCCCTTTTTTCTTTTTAA
TAATTAAAAAACATATATTTTTTTTTCCAATAATTCTGTTTTCTTTTAATTTAAATTTTAATATGGAATTCGTCGTTTCCGTGATTGTTGTCTGTTGTGGTGTTTGGGAA
AAGATGCCAATATTCGAACAGATGTCCTTTTTGGTAAATTACAAAAGCTCTACTTCAAATCATATTTTTATTAATATTAAATAAATTTATTCTCTCTCTCTCTCTCTAAC
ATGGTTAACTCGAGGTTTCGTCTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPAPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELFLDGKLVPLQL
SSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALKYLLHWSSKSSLSSSLDSSLSL
PLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPNGTNNPPRMRMVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVS
VDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRSTRLDRT