; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC10g1028 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC10g1028
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationMC10:9928013..9929079
RNA-Seq ExpressionMC10g1028
SyntenyMC10g1028
Gene Ontology termsGO:0010089 - xylem development (biological process)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600765.1 hypothetical protein SDJN03_05998, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.40e-3350.62Show/hide
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KAG7031402.1 hypothetical protein SDJN02_05442, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.41e-3351.25Show/hide
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XP_022151000.1 uncharacterized protein LOC111019020 [Momordica charantia]7.96e-8683.75Show/hide
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XP_022941575.1 uncharacterized protein LOC111446888 [Cucurbita moschata]1.09e-3351.25Show/hide
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XP_022989755.1 uncharacterized protein LOC111486825 [Cucurbita maxima]3.83e-3450.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L2F7 Uncharacterized protein5.64e-2744.94Show/hide
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        PSI +                      KG+  E+ GE+EDRI EVGFVGRDN   +CSTGLK+IGLCLVPV+M +NYF
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A0A5D3BKS2 Putative CTD small phosphatase-like protein 22.29e-2345.76Show/hide
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        MENSA SRIC+H +E    AT     S S +SSMDDL+MFD  +T  ++S +++   +  SS+      +S +++        AD DL+DTATS PHPSI
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Query:  PA-----------------------GKGSECEECGEIEDRI-EVGFVGRDN-KN-CSTGLKHIGLCLVPVTMVVNYF
         +                       GKGSE  + GE+EDRI +VG VGRDN KN CSTGLK+IGLCLVPV+M +NYF
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A0A6J1DA11 uncharacterized protein LOC1110190203.85e-8683.75Show/hide
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A0A6J1FU25 uncharacterized protein LOC1114468885.29e-3451.25Show/hide
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A0A6J1JN91 uncharacterized protein LOC1114868251.86e-3450.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAACTCGGCCACCTCCAGAATCTGCGCCCACGATCAGGAAGCGACGTCGTTTAGTTGTAGTTGGACTTCCTCCATGGACGATCTCATCATGTTTGACACTACAGC
AGCAACAACATCAGACGACTACTACAATCGCGGGATCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTTGAACAATTATTGTTCTCCGGAGGCCGATGGTGATCTTGATGACACTG
CAACTTCTTCTCCTCATCCTTCCATTCCCGCGGGAAAAGGAAGTGAATGTGAAGAATGTGGGGAGATTGAAGATAGAATTGAAGTGGGTTTTGTAGGGAGGGATAATAAG
AACTGCAGCACAGGACTTAAGCATATAGGCCTTTGTTTAGTTCCTGTCACCATGGTTGTCAATTATTTTGGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAACTCGGCCACCTCCAGAATCTGCGCCCACGATCAGGAAGCGACGTCGTTTAGTTGTAGTTGGACTTCCTCCATGGACGATCTCATCATGTTTGACACTACAGC
AGCAACAACATCAGACGACTACTACAATCGCGGGATCTTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTTGAACAATTATTGTTCTCCGGAGGCCGATGGTGATCTTGATGACACTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENSATSRICAHDQEATSFSCSWTSSMDDLIMFDTTAATTSDDYYNRGIFSSSSFSSLNNYCSPEADGDLDDTATSSPHPSIPAGKGSECEECGEIEDRIEVGFVGRDNK
NCSTGLKHIGLCLVPVTMVVNYFG