; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC11g0187 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC11g0187
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptiontRNA-processing ribonuclease BN
Genome locationMC11:1399357..1401317
RNA-Seq ExpressionMC11g0187
SyntenyMC11g0187
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591340.1 hypothetical protein SDJN03_13686, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.83e-19782.49Show/hide
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XP_022138611.1 uncharacterized protein LOC111009450 [Momordica charantia]1.07e-242100Show/hide
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XP_022936310.1 uncharacterized protein LOC111442966 [Cucurbita moschata]2.04e-19782.77Show/hide
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XP_022974903.1 uncharacterized protein LOC111473667 [Cucurbita maxima]1.18e-19682.49Show/hide
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XP_038905249.1 uncharacterized protein LOC120091332 [Benincasa hispida]2.02e-20385.3Show/hide
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        TTP+LLEKSGALFAMM+TFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAE Y
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRR4 uncharacterized protein LOC1035039899.91e-19782.71Show/hide
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        M SQSF  GL S L+G QD  +RF ++QLG+ V PRR   +LEF+SK +VLK+KR +FMCVA+SN   +LESSGEE  NHVLYVSRLNGVEPF GK GS+
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        T+PELLEKSGALFAMM+TFQ+LGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAE Y
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A0A5D3E8K1 tRNA-processing ribonuclease BN5.35e-17981.79Show/hide
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        M SQSF  GL S L+G QD  +RF ++QLG+ V PRR   +LEF+SK +VLK+KR +FMCVA+SN   +LESSGEE  NHVLYVSRLNGVEPF GK GS+
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        T+PELLEKSGALFAMM+TFQ+LGV
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A0A6J1CA74 uncharacterized protein LOC1110094505.16e-243100Show/hide
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        TTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY
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A0A6J1FDA5 uncharacterized protein LOC1114429669.86e-19882.77Show/hide
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        FQMRGLP TPELLEKSGA+F+MM+TFQVLGV+CLWSLMTFLLRLFPSRPVAE Y
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A0A6J1IHP8 uncharacterized protein LOC1114736675.69e-19782.49Show/hide
Query:  MQSQSFCHGLPSALVGFQDGGARFRKLQLGSRVGPRRQGQRLEF-------ASKLDVLKKKRGSFMCVADSNGKLKLESSGEEKENHVLYVSRLNGVEPF
        MQSQSF  GLP ALVG QDG +RFR++QLG+R    +QG++LEF       ASK DVLK+K G+FMCVADSNGK +LESSG  KEN VLYVS LNGVEP 
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Query:  RGKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFEVLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQ
        RGK GS+SFHGLTHQLVEEGKLMSAPF E+KGS LWVLAPAVFISSLI PQVFLG LIE +F+ EILVEVVTSLVFEVLFYVGVA FLLVTDRVQ+PYLQ
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Query:  FSSKRWSLITGLRGYLTTAFFISGFKVIAPLFAMYVTWPMIGLPALVAVVPFLVGCIVQLAFETHLDRRGSSSWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLI
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Query:  FQMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY
        FQMRGLP TPELLEKSGA+F+MM+TFQVLGV+CLWSLMTFLLRLFPSRPVAE Y
Subjt:  FQMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48460.1 unknown protein3.1e-9763.18Show/hide
Query:  ESSGEEKENHVLYVSRLNGVEPFRGKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFE
        +S  E+K++     +R    E FRGK GS+SF+GLTHQLVEE KL+SAPF EEKGSFLWVLAP V ISSLI+PQ FL G+IE  F+N+ + E+VTS  FE
Subjt:  ESSGEEKENHVLYVSRLNGVEPFRGKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFE

Query:  VLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQFSSKRWSLITGLRGYLTTAFFISGFKVIAPLFAMYVTWPMIGLPALVAVVPFLVGCIVQLAFETHLDRRGSSSWPLV
         +FY G+A+FL VTDRVQRPYL FSSKRW LITGLRGYLT+AF   G KV+ P+FA+Y+TWP +G+ AL+AV+PFLVGC VQ  FE  L+RRGSS WP+V
Subjt:  VLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQFSSKRWSLITGLRGYLTTAFFISGFKVIAPLFAMYVTWPMIGLPALVAVVPFLVGCIVQLAFETHLDRRGSSSWPLV

Query:  PIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLIFQMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY
        PI+FEVYRLYQ+T+AA F++RL+F M+   TT E+ E+  AL  ++VT Q L V+CLWS +TFL+RLFPSRPV E Y
Subjt:  PIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLIFQMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRLFPSRPVAEKY

AT5G63040.1 unknown protein6.6e-3134.16Show/hide
Query:  GKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFEVLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQF
        GKPG ISF+   ++   E  ++        G  LW++ PAV +SS I+P V+L  ++   F + +L + +     E LFY GVA FLL+ DR ++   + 
Subjt:  GKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFEVLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQF

Query:  SSKRWSLITGLRGYLTTAFFISGFKVIAPLFAMYVTWPMIGLPALVAVVPFLVGCIVQLAFETHLDRRGSSSWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLIF
           R  +     G   ++       ++ P+  M   WP  G  A   + P+LVG +VQ AFE +   R S S P++PIIF+VYRL+QL +AA  +  L F
Subjt:  SSKRWSLITGLRGYLTTAFFISGFKVIAPLFAMYVTWPMIGLPALVAVVPFLVGCIVQLAFETHLDRRGSSSWPLVPIIFEVYRLYQLTKAAHFMERLIF

Query:  QMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRL
         ++G   T   L    +L  ++   QVLGV+ +WS+ +FL+ L
Subjt:  QMRGLPTTPELLEKSGALFAMMVTFQVLGVVCLWSLMTFLLRL

AT5G63040.2 unknown protein6.6e-3134.16Show/hide
Query:  GKPGSISFHGLTHQLVEEGKLMSAPFSEEKGSFLWVLAPAVFISSLIVPQVFLGGLIEDFFRNEILVEVVTSLVFEVLFYVGVAMFLLVTDRVQRPYLQF
        GKPG ISF+   ++   E  ++        G  LW++ PAV +SS I+P V+L  ++   F + +L + +     E LFY GVA FLL+ DR ++   + 
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         ++G   T   L    +L  ++   QVLGV+ +WS+ +FL+ L
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Sequences Show/hide sequences
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