; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC11g0500 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC11g0500
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1218)
Genome locationMC11:3899746..3902753
RNA-Seq ExpressionMC11g0500
SyntenyMC11g0500
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR009606 - Modifying wall lignin-1/2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]1.55e-11387.83Show/hide
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        A+FTTGLAITLLVWPTVTEQ+HL RNVHHNLE  CPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYF+EIEE G + EALK++A
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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]1.33e-11487.3Show/hide
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        MA SVK MSLIVA  GVISFIFGV+AENKKPA+GTPIPGKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGA+F+SSSFS FFN+
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        A+FTTGLAITLL+WPTVTEQLHL RNVHHN+ET CPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYF+EI EKG N E+LKSSA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHD9 Uncharacterized protein1.07e-11387.3Show/hide
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        MAVSVK MSLIVA  GV SFIFGV+AENKKPA+GTPIPGKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASS AGY SLFYPYQGKSVPRGA+F+SSSFS FFN+
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        A+FTTGLAITLLVWPTVTEQLHL RNVHHN+ET CPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYF+EI EKGSN E+LKSSA
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A0A6J1CPU8 uncharacterized protein LOC1110131968.62e-129100Show/hide
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A0A6J1CQA0 uncharacterized protein LOC1110131663.78e-12395.24Show/hide
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A0A6J1CQA7 uncharacterized protein LOC1110131775.36e-12394.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)3.8e-7370.65Show/hide
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        A+ T+GLA++LL+WPT+TEQLHL RNVH NLET CPTAKTGLLGGGAF+SLDS LFWLVALMLA NARED+F+E+E +  +G +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGTTTCTGTCAAGTCCATGTCTCTCATTGTCGCAACTTTTGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCGTAGCTGAAAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCAT
CCCTGGCAAGGGCCTTGTTATCTGTAAATATCCGGGCGATCCAACTGTGGCGTTGGGATATCTTTCGGTTCTGTTTCTTCTTGCTTCGTCGATTGCAGGATACTTTTCCT
TGTTCTATCCTTACCAAGGAAAATCTGTTCCTCGAGGTGCCATATTTAGGAGCAGCAGTTTCTCTATTTTCTTCAACGTTGCTGTGTTCACAACTGGTTTAGCTATAACA
TTGCTCGTATGGCCCACGGTCACAGAGCAACTTCACTTGATGCGCAACGTTCATCACAATCTCGAGACGGAGTGCCCGACCGCTAAGACCGGTCTTCTAGGTGGTGGTGC
TTTCTTGTCCCTGGATTCGTCCCTCTTCTGGTTGGTTGCCTTGATGCTGGCTGGGAATGCTCGAGAGGACTACTTCGAAGAAATCGAGGAAAAGGGAAGCAACGGTGAAG
CTCTTAAGAGCAGCGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGCACTATAAATATCCGAATGTTGACTCATCCCTTCAGTCTTCTCTAAAAATCCGGAGTGGGAAAACGAGAAGAGCAATAATCGGAACTCTTTCTCCTCTCTACAATCT
AAGGTCGCTGGTAACATTTATCTAAAGAGCAATGGCTGTTTCTGTCAAGTCCATGTCTCTCATTGTCGCAACTTTTGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCGTAGCTG
AAAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCATCCCTGGCAAGGGCCTTGTTATCTGTAAATATCCGGGCGATCCAACTGTGGCGTTGGGATATCTTTCGGTTCTGTTTCTT
CTTGCTTCGTCGATTGCAGGATACTTTTCCTTGTTCTATCCTTACCAAGGAAAATCTGTTCCTCGAGGTGCCATATTTAGGAGCAGCAGTTTCTCTATTTTCTTCAACGT
TGCTGTGTTCACAACTGGTTTAGCTATAACATTGCTCGTATGGCCCACGGTCACAGAGCAACTTCACTTGATGCGCAACGTTCATCACAATCTCGAGACGGAGTGCCCGA
CCGCTAAGACCGGTCTTCTAGGTGGTGGTGCTTTCTTGTCCCTGGATTCGTCCCTCTTCTGGTTGGTTGCCTTGATGCTGGCTGGGAATGCTCGAGAGGACTACTTCGAA
GAAATCGAGGAAAAGGGAAGCAACGGTGAAGCTCTTAAGAGCAGCGCATGAAGGCTCTTTATTTACGTTTAGTGACAATAAAAATTTGGTTTCTCTTTACTATTGGATTT
ACTTGTAGATATGGAATTGGACTGGATAGTCTTTGTGGTATCGTCTCAAGCATCAATTGTTATATAACCAAATTTCTATTTTATAGGATATCTATATATATAAAGTATAA
AGGTTTCTCCCTCCCTCTAAAACAGGC
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LLVWPTVTEQLHLMRNVHHNLETECPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYFEEIEEKGSNGEALKSSA