| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7024550.1 putative RNA-binding protein ARP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.04e-130 | 77.82 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPPPVVYSPYGYP+Y+PDYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F + P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYP--AAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
QSH RV P Y+YYP AAA + AQFE S S+ PPPL+RHRF+STDSQTSQQTP EAEAEA
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYP--AAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
|
|
| XP_004136431.1 RNA-binding protein 38 [Cucumis sativus] | 3.41e-135 | 78.44 | Show/hide |
Query: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT++M+ YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRDPESARRACANPNP+IDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Subjt: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Query: GRAQGGINPYQGSTMQA--TPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHP--QAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
GR Q +NPYQGSTMQA TPSY GVP+PLNQPP+PP PPP PPVVYSPYGYP+YSPDYGYH QAVYNPQVQQPQ Y Q+PY YGYS + TF N
Subjt: GRAQGGINPYQGSTMQA--TPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHP--QAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
Query: PPQSHHHR---VPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP---LLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
P QSH H +PPSY+YYP P P QFEPSS NYPP P ++RHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
Subjt: PPQSHHHR---VPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP---LLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
|
|
| XP_022152706.1 RNA-binding protein 38 [Momordica charantia] | 1.38e-196 | 100 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
Subjt: QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
|
|
| XP_022936617.1 RNA-binding protein 38-like [Cucurbita moschata] | 2.89e-130 | 78.11 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPPPVVYSPYGYP+Y+ DYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F + P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
QSH RV P Y+YYP AA + AQFE S S YPPPPL+RHRF+STDSQTSQQTP EAEAEA
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
|
|
| XP_038897135.1 RNA-binding protein 38 [Benincasa hispida] | 2.47e-139 | 80.3 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+ MR YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACAN NP+IDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQ--ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSN
PRGR Q +NPYQGSTMQ ATPSY GVP+PLNQPPLPP PPPPPP+VYSPYGYP+YSPDYGY H QAVYNPQVQQPQ Y QSPY YGYS+QSPR TF N
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQ--ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSN
Query: APPQSHHHRV--PPSYLYYPAAAPSPHA---QFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
P QSHH R+ PPSY+YYP +P+ A QFE +S NYPP L+RHRFSSTDSQTSQQTPTE EA
Subjt: APPQSHHHRV--PPSYLYYPAAAPSPHA---QFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LGV2 RRM domain-containing protein | 1.65e-135 | 78.44 | Show/hide |
Query: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT++M+ YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRDPESARRACANPNP+IDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Subjt: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Query: GRAQGGINPYQGSTMQA--TPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHP--QAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
GR Q +NPYQGSTMQA TPSY GVP+PLNQPP+PP PPP PPVVYSPYGYP+YSPDYGYH QAVYNPQVQQPQ Y Q+PY YGYS + TF N
Subjt: GRAQGGINPYQGSTMQA--TPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHP--QAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
Query: PPQSHHHR---VPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP---LLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
P QSH H +PPSY+YYP P P QFEPSS NYPP P ++RHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
Subjt: PPQSHHHR---VPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP---LLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEA
|
|
| A0A6J1AEH8 RNA-binding protein 24 | 1.76e-120 | 71.13 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRS FGDTT TKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTF DPESARRAC +PNPVIDGRRANCNIA+LGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ----------SPYLYGYSVQS
PRGR QG +PYQG Q PSYSGV AP+ PP PPPPPPV+Y PYGYP+YSPDYGYH QA+YNPQ+QQPQYYHQ SPY YGYS+Q+
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ----------SPYLYGYSVQS
Query: PRATFSNAPPQSHHHRVP-PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP--LLRHRF-SSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
PR TFS PQ+ R+P PSYLYYP Q E SFS YPPPP L RH F SSTDSQT QQT TE EA G +TSESP T
Subjt: PRATFSNAPPQSHHHRVP-PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPP--LLRHRF-SSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
|
|
| A0A6J1DIJ5 RNA-binding protein 38 | 6.70e-197 | 100 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
Subjt: QSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSESPST
|
|
| A0A6J1F8X9 RNA-binding protein 38-like | 1.40e-130 | 78.11 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPPPVVYSPYGYP+Y+ DYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F + P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
QSH RV P Y+YYP AA + AQFE S S YPPPPL+RHRF+STDSQTSQQTP EAEAEA
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
|
|
| A0A6J1IJV9 RNA-binding protein 38-like | 1.03e-129 | 77.27 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTT TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPPVVYSPYGYP+Y+PDYGYH ++ QQP Y +PY YGYSVQSPR F P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
QSH RV P Y+YYP A + AQ+E S S+ PPPPL+RHRF+STDSQTSQQTPTEAEAEA
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q62176 RNA-binding protein 38 | 5.5e-25 | 44.95 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG S G A G +
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
Query: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
+P T TP Y PA + P P P P + SPY Y SP Y +P A Y+ Q P Y SP YGY P+A + AP
Subjt: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
|
|
| Q6DIV4 RNA-binding protein 38 | 1.5e-22 | 34.68 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG + PR N
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
Query: YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSY
T+ + PA + +P +G PQ +Y P + QP +P S+QSP + NA Q+ H +Y
Subjt: YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSY
Query: LYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEA
YP AA P++ + Y ++ S+T + + P A
Subjt: LYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEA
|
|
| Q7T3I7 RNA-binding protein 38 | 7.1e-25 | 43.35 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ TAKS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG +P + G+
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
Query: YQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSP---YL-YGYS--VQSPRATFSNAPP
+ +Q TP Y P + QP + P P P + SPY Y + + Y ++ A Y Q P Y SP Y+ YGY+ VQ P +T + APP
Subjt: YQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSP---YL-YGYS--VQSPRATFSNAPP
Query: QSH
++
Subjt: QSH
|
|
| Q9H0Z9 RNA-binding protein 38 | 2.1e-24 | 44.44 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG S G A G +
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
Query: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
+P T TP Y PA + P P P P + SPY Y SP Y +P A Y+ Q P Y SP Y Y P+A + AP
Subjt: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 2.3e-23 | 40.08 | Show/hide |
Query: FGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAAL-GRPRPSPPRGRAQGG
FGDT TKVFVGGLAW+T E M +F ++G+ILEAVII+DK T +SKGYGFVTF+D ++A RAC + P+I+GRRANCN+A+L GR R SP Q G
Subjt: FGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAAL-GRPRPSPPRGRAQGG
Query: INPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPP-------------------LPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQ-QPQYYHQSPYLYGYSV
P G+ +ATP + G + P P A P GY + GY+ Q PQ Q QPQYYH ++YG
Subjt: INPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPP-------------------LPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQ-QPQYYHQSPYLYGYSV
Query: QSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYP
R A P + V P + P P F SFS P
Subjt: QSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G20880.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.8e-38 | 46.27 | Show/hide |
Query: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRP-----
HY S FGDTTFTKVFVGGLAWET +E +RR+F+Q+G+ILEAV+ITDKNT +SKGYGFVTFRDPE+ARRAC +P P+IDGRRANCN+A+LGR RP
Subjt: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRP-----
Query: ----SPPRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP
+P R R +PY GS + G P +Q PP VVY PYG Y PDY Y Q Y P + Q QY +YG +V SP
Subjt: ----SPPRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP
Query: RATF---SNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHR
+ S+ P +H + Y + + A S+ S YP P H+
Subjt: RATF---SNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHR
|
|
| AT1G22330.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.7e-53 | 48.06 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT TKVFVGGLAWETPT+EMRRYF+QFGEILEAVIITDK T KSKGYGFVTFRD +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPS PRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQGGI-NPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ------------------SPYLY
R QGG + YQG SY+G+ AP+ Q ++Y YGY +Y+ +YGYH QA+YN Q+QQ QYY Q SPY Y
Subjt: RAQGGI-NPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ------------------SPYLY
Query: GYSVQSPRATFSNAPPQSHHH----------RVP--PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQT--------PTEAEAEAE
SPR + +HH R+P SYL YP+ +P P+S PL SST+S QQ PT+A
Subjt: GYSVQSPRATFSNAPPQSHHH----------RVP--PSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSSTDSQTSQQT--------PTEAEAEAE
Query: AEAGAVTSES
+TS S
Subjt: AEAGAVTSES
|
|
| AT1G76460.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.4e-39 | 49.77 | Show/hide |
Query: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
HY S FGDTTFTKVFVGGLAWET +E +R++FEQ+GEILEAV+I DKNT +SKGYGFVTFRDPE+ARRACA+P P+IDGRRANCN+A+LGRPRP P
Subjt: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPL-----NQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP---R
I G A+P V P N P P P V PYG +Y P+Y Y Q +Y+P + Q QY +YG +V SP
Subjt: RAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPL-----NQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP---R
Query: ATFSNAPPQSHHHRVPPSY
S P H + Y
Subjt: ATFSNAPPQSHHHRVPPSY
|
|
| AT1G78260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-61 | 52.51 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT+TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPSPPRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
R Q G + YQ +Y+G+ A PLPPA P ++Y YGY +Y+PD +GYH QA+YN Q+QQ QYY Q S
Subjt: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
Query: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYP-----PPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSES
PY YGYS+Q+PR P HHH +P Y H Q S SF YP PPL SST+S+ Q AE EA A +T+ +
Subjt: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPAAAPSPHAQFEPSSSFSNYP-----PPPLLRHRFSSTDSQTSQQTPTEAEAEAEAEAGAVTSES
|
|
| AT1G78260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.3e-61 | 55.3 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT+TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPSPPRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
R Q G + YQ +Y+G+ A PLPPA P ++Y YGY +Y+PD +GYH QA+YN Q+QQ QYY Q S
Subjt: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
Query: PYLYGYSVQSPRATFSN-------APPQSHHHR--VPPSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNY
PY YGYS+Q+PR + + PQ HHH+ PS+L YP+ ++ +P Q SSS Y
Subjt: PYLYGYSVQSPRATFSN-------APPQSHHHR--VPPSYLYYPA-AAPSPHAQFEPSSSFSNY
|
|
