; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC11g1124 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC11g1124
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionsyntaxin-81-like
Genome locationMC11:9709048..9710796
RNA-Seq ExpressionMC11g1124
SyntenyMC11g1124
Gene Ontology termsGO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133683.1 syntaxin-81 [Momordica charantia]1.49e-8785.64Show/hide
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XP_022153711.1 syntaxin-81-like [Momordica charantia]1.03e-9789.08Show/hide
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        MSYRFVLWSGRWCPGYRKASKAPIPSSKKRKNNKILLTLVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTF
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        EHEPVRAQQQLLDDETRTS                 VQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQ +K
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XP_022961294.1 syntaxin-81-like isoform X1 [Cucurbita moschata]5.07e-8884.44Show/hide
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        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQV KPRSA+ P YNN EL+E   FEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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XP_022990738.1 syntaxin-81-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.66e-8683.33Show/hide
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        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQV KPRSA+ P YNN EL+E   FEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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        E ETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAV+ TKNVE GNKEL+ AIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
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XP_023520591.1 syntaxin-81-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.84e-8985Show/hide
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        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQV KPRSA+ P YNN EL+E  TFEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BZU2 syntaxin-817.22e-8885.64Show/hide
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        +VLILSERLHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKP SA+T EY+NTEL+E   FEHEPVRAQQQ LLDDETR   V       EL SLLDAV
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        QETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAV+ TKNVE GNKELSQAIQRNSSSRTFL+LFLFVLTFSILFLDWYS
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A0A6J1DLI1 syntaxin-81-like4.96e-9889.08Show/hide
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        MSYRFVLWSGRWCPGYRKASKAPIPSSKKRKNNKILLTLVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTF
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Query:  EHEPVRAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVK
        EHEPVRAQQQLLDDETRTS                 VQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQ +K
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A0A6J1HDQ6 syntaxin-81-like isoform X12.45e-8884.44Show/hide
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        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQV KPRSA+ P YNN EL+E   FEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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        ETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAV+ TKNVE GNKEL+QAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
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A0A6J1JU56 syntaxin-81-like isoform X18.04e-8783.33Show/hide
Query:  LVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVRAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQ
        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDIINKAVPRRKPNQV KPRSA+ P YNN EL+E   FEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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Query:  ETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
        E ETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAV+ TKNVE GNKEL+ AIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
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A0A6J1K136 syntaxin-81-like1.62e-8683.33Show/hide
Query:  LVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVRAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQ
        +VLILSE+LHSVTSQFDK+RAIRFQDII+KAVPRRKPNQ+ KPRSA+T  YN TEL+E   FEH+PVRAQQQLLDDETR   V       EL SLLDAVQ
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Query:  ETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
        ETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAV+ TKNVE GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSI+FLDWYS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59277 Syntaxin-819.8e-5468.51Show/hide
Query:  LVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVR-AQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAV
        +VLILSE+LHSVT+QFD++RA RFQDIIN+A+PRRKP +V K  +       N+E  E    + +P R  QQQLLDDET       Q   VEL +LLD  
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Query:  QETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
        ++TETKMVEMSALNHLM+THVLQQAQQIEFLY+QAV+ TKNVE GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLF FVLTFS+LFLDWYS
Subjt:  QETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS

Q4VBI7 Syntaxin-188.9e-1531.64Show/hide
Query:  ILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVRAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQET
        ++   L  V   + + RA+R + +++ K + R +P Q+   +     E N+  + +      E  R +  L  +E +      Q  + E+ SLLD V++ 
Subjt:  ILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVRAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQET

Query:  ETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWY
        E K+VE+S L  + S  VLQQ  +I+ +++  V  T+NV EGN+++ +AI+ N+  R ++L FL + +FS+LFLDWY
Subjt:  ETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWY

Q5REB4 Syntaxin-181.0e-1029.59Show/hide
Query:  LSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPR------------SADTPEYNNTELK-ETTTFEHEPV-------RAQQQLLDDETRTSGV
        + + L  V   + + RAIR + +++ K + + +P   TK R            S D+ E   TE + E    E +P        + + +L  +E +    
Subjt:  LSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPR------------SADTPEYNNTELK-ETTTFEHEPV-------RAQQQLLDDETRTSGV

Query:  FFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWY
          Q  + E+ SL D V++ E ++VE+S L  + +  VLQQ  +I+ +++  V  T+N+ EGN+++ +AI+ N+  R ++L FL + +FS+LFLDWY
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Q8VDS8 Syntaxin-181.7e-1028.05Show/hide
Query:  RKASKAPIPSSKKRKNNKILLTLVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTK---------PRSADTPEYNN---TELKETTTFEHE
        R  +   I S + +++   +L  V    + L  V   + + RAIR + +++ K + + +P   TK         P++A           EL E    E +
Subjt:  RKASKAPIPSSKKRKNNKILLTLVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTK---------PRSADTPEYNN---TELKETTTFEHE

Query:  PV-------RAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSS
        P        + + +L  +E +      Q  + E+ SL D V++ E K+VE+S L  + +  VLQQ  +I+ +++  V  T+N+ EGN+++ +AI+ N+  
Subjt:  PV-------RAQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSS

Query:  RTFLLLFLFVLTFSILFLDWY
        R ++L FL + +FS+LFLDWY
Subjt:  RTFLLLFLFVLTFSILFLDWY

Q9P2W9 Syntaxin-181.0e-1029.59Show/hide
Query:  LSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPR------------SADTPEYNNTELK-ETTTFEHEPV-------RAQQQLLDDETRTSGV
        + + L  V   + + RAIR + +++ K + + +P   TK R            S D+ E   TE + E    E +P        + + +L  +E +    
Subjt:  LSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIIN-KAVPRRKPNQVTKPR------------SADTPEYNNTELK-ETTTFEHEPV-------RAQQQLLDDETRTSGV

Query:  FFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWY
          Q  + E+ SL D V++ E ++VE+S L  + +  VLQQ  +I+ +++  V  T+N+ EGN+++ +AI+ N+  R ++L FL + +FS+LFLDWY
Subjt:  FFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNV-EGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51740.1 syntaxin of plants 816.9e-5568.51Show/hide
Query:  LVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVR-AQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAV
        +VLILSE+LHSVT+QFD++RA RFQDIIN+A+PRRKP +V K  +       N+E  E    + +P R  QQQLLDDET       Q   VEL +LLD  
Subjt:  LVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVR-AQQQLLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAV

Query:  QETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS
        ++TETKMVEMSALNHLM+THVLQQAQQIEFLY+QAV+ TKNVE GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLF FVLTFS+LFLDWYS
Subjt:  QETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVE-GNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTACAGGTTCGTGCTTTGGAGCGGGCGCTGGTGTCCTGGGTATAGGAAAGCAAGCAAAGCTCCGATTCCTAGTTCTAAAAAAAGAAAGAATAATAAAATTCTTTT
AACATTGGTACTAATTTTGAGTGAGAGGCTCCATTCGGTAACATCACAATTTGATAAGATAAGAGCCATTCGATTTCAAGATATCATAAACAAAGCAGTACCAAGAAGAA
AACCAAACCAGGTAACTAAACCTCGTTCTGCAGATACCCCTGAATATAATAATACGGAGCTGAAGGAAACTACTACTTTTGAGCATGAACCTGTCCGAGCCCAACAGCAA
CTGTTGGATGATGAAACTCGCACTTCAGGTGTTTTCTTCCAAATTTTTCTGGTTGAGTTGATTAGTCTTCTTGATGCAGTCCAAGAAACAGAAACTAAGATGGTTGAGAT
GTCTGCTTTGAATCACCTTATGTCTACCCACGTTTTGCAACAAGCACAACAGATTGAATTTCTTTATGAACAGGCTGTTAAAACTACGAAGAATGTTGAGGGTAATAAAG
AACTTTCCCAAGCAATTCAGCGGAATAGCAGCAGCAGAACGTTCCTTCTTCTTTTTCTATTTGTGCTCACCTTTTCAATTCTTTTTCTTGATTGGTATAGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGATAGAAATTTTATTAAAGCAAAAGACCGCTATGGGTTAAAGTTCCATAATTCATTCAAGCCATTTATGCTTTTTTGAATTTAATATTCAGCTTCGTCAAGAAGGGAA
TGGCAAAATTCAAGGATAGGACTGAAGATGTTGTGCGGCATTGTGCTGTTTCATTAGGGTATAATGAGCAAGAACTACGGGTGTAGATTCCGTGCTGCTTGCTTGAGCTA
TTTGAGTTAAATCTTTAACATTGATGTCTCCAAGTGGCAGTACAGTTGACAAGAGTTTCCAAGTGGCAGTACAAGTTGGCAAGAACTTTGGGTCTCTCGGTCATACTGGT
TTGTCTCAAGTTTGAACTTTCTAGTAAGCTGAATACTAAAAACCCTTGATGTCTTACAGGTTCGTGCTTTGGAGCGGGCGCTGGTGTCCTGGGTATAGGAAAGCAAGCAA
AGCTCCGATTCCTAGTTCTAAAAAAAGAAAGAATAATAAAATTCTTTTAACATTGGTACTAATTTTGAGTGAGAGGCTCCATTCGGTAACATCACAATTTGATAAGATAA
GAGCCATTCGATTTCAAGATATCATAAACAAAGCAGTACCAAGAAGAAAACCAAACCAGGTAACTAAACCTCGTTCTGCAGATACCCCTGAATATAATAATACGGAGCTG
AAGGAAACTACTACTTTTGAGCATGAACCTGTCCGAGCCCAACAGCAACTGTTGGATGATGAAACTCGCACTTCAGGTGTTTTCTTCCAAATTTTTCTGGTTGAGTTGAT
TAGTCTTCTTGATGCAGTCCAAGAAACAGAAACTAAGATGGTTGAGATGTCTGCTTTGAATCACCTTATGTCTACCCACGTTTTGCAACAAGCACAACAGATTGAATTTC
TTTATGAACAGGCTGTTAAAACTACGAAGAATGTTGAGGGTAATAAAGAACTTTCCCAAGCAATTCAGCGGAATAGCAGCAGCAGAACGTTCCTTCTTCTTTTTCTATTT
GTGCTCACCTTTTCAATTCTTTTTCTTGATTGGTATAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSYRFVLWSGRWCPGYRKASKAPIPSSKKRKNNKILLTLVLILSERLHSVTSQFDKIRAIRFQDIINKAVPRRKPNQVTKPRSADTPEYNNTELKETTTFEHEPVRAQQQ
LLDDETRTSGVFFQIFLVELISLLDAVQETETKMVEMSALNHLMSTHVLQQAQQIEFLYEQAVKTTKNVEGNKELSQAIQRNSSSRTFLLLFLFVLTFSILFLDWYS