; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC11g1146 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC11g1146
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionRAB GTPASE HOMOLOG B18
Genome locationMC11:9929989..9938575
RNA-Seq ExpressionMC11g1146
SyntenyMC11g1146
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607690.1 Ras-related protein RABC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.26e-14998.12Show/hide
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XP_011657438.1 ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis sativus]2.04e-14897.18Show/hide
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XP_022153719.1 ras-related protein RABC1-like [Momordica charantia]1.10e-152100Show/hide
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XP_022926286.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita moschata]1.23e-14998.12Show/hide
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XP_023525903.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.42e-15198.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KH59 Uncharacterized protein9.89e-14997.18Show/hide
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A0A5A7V1Q4 Ras-related protein RABC1 isoform X12.84e-14896.71Show/hide
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A0A6J1DJX3 ras-related protein RABC1-like5.32e-153100Show/hide
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A0A6J1EEF0 ras-related protein RABC1-like5.96e-15098.12Show/hide
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A0A6J1IUG0 ras-related protein RABC1-like5.96e-15098.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC14.4e-9984.62Show/hide
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         S   CCS
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O49841 Ras-related protein RABC2a4.0e-8470.53Show/hide
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         D+W KEI++YSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP     
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        +  GCCS
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P36862 GTP-binding protein yptV31.5e-5963.13Show/hide
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        DY FK+LL+GDSGVGKS +L RFTS  FE+  + TIGVDFK+K++T  GK+ KL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII VYDVTRR+TF +L   W +
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Query:  EIDMYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG
        E D+YST +  IKM+V NKVD  ++R VS +EG DFAR +GCLF+E SA+  + V Q F+EL+LKILDTP LL   + G
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Q6DHC1 Ras-related protein Rab-18-B1.3e-5556.35Show/hide
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        K+L+IG+SGVGKS+LLLRFT D+F+ +L+ TIGVDFK+K + + G + KLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQG+I+VYDVT+R+TFT L + W  E++ 
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        Y T  D +KMLVGNK+DK++ R V + EG+ FAR++  LF+E SAKTR  V+  F+ELV KIL TP L  + S         +  PQ   + GG CS
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Q9SF92 Ras-related protein RABC2b5.8e-7566.18Show/hide
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        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
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        +DIWAKEI++YSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P   A
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          G CCS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B183.1e-10084.62Show/hide
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         S   CCS
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AT1G43890.2 RAB GTPASE HOMOLOG B183.1e-10084.62Show/hide
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        SDIWAKEID+YSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P Q  +
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         S   CCS
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AT1G43890.3 RAB GTPASE HOMOLOG B183.1e-10084.62Show/hide
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        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
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         S   CCS
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AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B4.1e-7666.18Show/hide
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        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
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Query:  SDIWAKEIDMYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPQANA
        +DIWAKEI++YSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P   A
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          G CCS
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AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A2.8e-8570.53Show/hide
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Query:  SPGGCCS
        +  GCCS
Subjt:  SPGGCCS


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