; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC11g1186 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC11g1186
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionExtended Signal Peptide of Type V secretion system family protein
Genome locationMC11:11088740..11089802
RNA-Seq ExpressionMC11g1186
SyntenyMC11g1186
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GCC34992.1 hypothetical protein [Chiloscyllium punctatum]1.69e-1431.21Show/hide
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        Q+ TTT +    QI++TT E +  Q++++  + +  QI+++T + +  QI+S T E    Q+++ T E    QI++T+ E +  Q++TTT E +  Q+ T
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        +T +    QI+T + E    Q++TTT +    Q+++TT E +   + +TT E    QI++TT E +   + +T
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WP_153049789.1 LPXTG cell wall anchor domain-containing protein, partial [Streptococcus suis]1.43e-1430.16Show/hide
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        S+S S+S  ++ +    V  S+S  +S S ST +S S S+S+  + +  V   +ST+    LS      +S +    V+T+T E L   VS  T +S S 
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        S+S+  S    L  S ST V  S + S  V+T+T E L   +S++  E +   VS+S  + L   IS+S  + L   +S++T E L   VST+  E +  
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         +S++  E +   VST+  E +   V TS S+ L   +S ++ E +   VST+  + +    S++  E L   V+++  E +   +S++  E L   V T
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        S ++ V   VS + S
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WP_183121477.1 KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein, partial [Streptococcus iniae]4.26e-1331.01Show/hide
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        LSLS S+S   +T+      VS S  LSLS ST  S STS S   +A++   + +S +            +S +T L  + +      I VS    +S S
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         S S+  S +  +  S S     S + S  ++ +T E L   IS +T E L   +S ST + L   IS ST + L   IS +T E +   +S +T E L 
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          IS ++ E L   +S +T E L   ++ STS+ L   IS ++ E L   +S +T + L   +S +T E L   ++ +T E L   IS +T E L   ++
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         ST++ +   +S + S
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WP_183121738.1 KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein, partial [Streptococcus iniae]2.56e-1430.99Show/hide
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        STS+S+  + +    V  S+ST  S S ST  S STS SL L+ ++      S ++   +S    + LS +T    +T+         S    LS S S 
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        S   ST+     S+ST   +S + S+ V+ +  E +   IS +T E L   +S ST + L   IS ST + L   IS +T E L   +S +T E +   I
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        S ++ E L   +S +T E L   ++ STS+ L   IS ++ E L   +S +T + L   +S +T E L   ++ +T E L   IS +T E L   ++ ST
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        ++ +   +S + S
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WP_183121811.1 KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein, partial [Streptococcus iniae]4.25e-1331.01Show/hide
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        LSLS S+S   +T+      VS S  LSLS ST  S STS S   +A++   + +S +            +S +T L  + +      I VS    +S S
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         S S+  S +  +  S S     S + S  ++ +T E L   IS +T E L   +S ST + L   IS ST + L   IS +T E +   +S +T E L 
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          IS ++ E L   +S +T E L   ++ STS+ L   IS ++ E L   +S +T + L   +S +T E L   ++ +T E L   IS +T E L   ++
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         ST++ +   +S + S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1D7TPJ2 Uncharacterized protein6.24e-1232.67Show/hide
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        ST+S L    +++T   LS + LS STSSSL   L+T+T   +  S ST  S S S  LS STSSSL   L T+TS  +   +ST++   LS       S
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        S+    ++T+T   L   +S+ T       LS STSSSL    ST++   LS S     SS+ S  ++T+T   L   +S++T   L   +S+ST   L 
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          +S+ST   L   +S++T   L   +ST+T   L   +S+++   L   +ST+T   L   + TSTS  L   +ST++   L   +ST+T   L   +S
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        ++T   L   ++++T   L   +S++T   L   + TST+  +   +S++ S
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A0A1E1XNR3 Putative host cell transcription factor hcfc1 (Fragment)1.58e-1140.7Show/hide
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        TT E L   +SSTT E L   VSS+T + L   +SSST + L  ++SS T E L    S+   E L  ++SST+ E L   VS+TT E L   V+ST  +
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         L   +S+ + E L  ++ +TT + L   VSS T E L   ++STT E L   +SSTT E L   ++STT G
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A0A2N5SYB7 Uncharacterized protein1.31e-1131.21Show/hide
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        Q++T++  RL  Q+S+++   ++ Q+SSS+  RL  Q+SSS+   L  Q+SS++   L  Q+S+++   L  Q+SS+S   L  Q+S+++   L  Q++S
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Query:  TSQG--LRVQISTASQEXLRVQVSTTTQKGLXVQVSSTTHEGLRLXVASTTXEGLRVQISSTTXERLRIXVTS
        +S    +  Q+S++S   L  Q+S ++   L  Q+SS++   L   ++S++   L  Q+SS++  RL   ++S
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A0A674BM85 Uncharacterized protein5.97e-1230.18Show/hide
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        +TTSL  +Q T++T  L          S+ +  ATT+    QV+++T  SL+S+   + +TS +S+ +TA  TS   VQ++T +  L S       +S  
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Query:  GLQVTTTTKERLXIQVSSPTCLSFSTSSSLLFSTTSRLLLSSSTDVPLSSTTSIQVTTTTKERLXIQISSTTQEGLRIQVSSSTXKRLXVQISSSTXKGL
         +QVTT T     +QVS+ T    ++ +S   +T +  L S+      +S  S QVTT T      Q+++ T      QV+++T      Q++++T    
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Query:  XVQISSATKEGLXIQVSTATQEGLRVQISSTSXEGLXVQVSTTTQEGLRVQVTSTSQGLR-VQISTASQEXLRVQVSTTTQKGLXVQVSSTTHEGLRLXV
         VQ+++AT     +QV+TAT     VQ+++ +     VQVST T      QVT+ +  L  VQ++TA+      QV+T T     VQV++ T       V
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Query:  ASTTXEGLRVQISSTTXERLRIXVTSTT
         + T   + VQ+++ T   + + VT+ T
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A0A6J0D278 mucin-208.19e-1334.02Show/hide
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        DVPL ++T    T+ T   L IQ +S T   L IQ +S T   L +Q +S T   L +Q +S T   L  Q ++ T   L +Q +S +   L +Q ++ T
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Query:  QEGLRVQVTS-TSQGLRVQISTASQEXLRVQVSTTTQKGLXVQVSSTTHEGLRLXVASTTXEGLRVQISSTTXERLRIXVTS-TTQGVQVQVSS
           L +Q TS TS  L +QI++ +   L +Q ++ T   L +Q +S T   L +   S T   L +Q +S T   L I  TS TT  ++ Q SS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTTGCCATCGGTGATGGCTACTGACTACGTCTACTCTTCTCCACCACCTCCTTACTATGCATACAATTCACCTCCACCACACATTTATTACTCTCCTCCACCTGTTTATC
ACTCTCCACCTCCTCCAGCTTATTACTCGCCACCACCACCTAAGTATGAGTACAAGTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCTCCA
CCTCCTCCAGTTTATTACTCACCGCCACCAGCTAAGTATGAGTACAAATCTCCACCACCTCCTGTTTATTACTCTCCTCCCCCACCTGTATACTACTCTCCTCCACCACC
GGTTTACAAGTCACCACCACCACCAAAGAAAGACTATGAATACAAGTCTCCTCCCCCACCTGTTTATCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTATTATTCTCCACCACCTCCCG
TTTATTACTCTCCTCCTCCACCGATGTACCACTCTCCTCCACCACCAGTATACAAGTCACCACCACCACCAAAGAACGACTATGAATACAAATCTCCTCCACCACCCAAG
AAGGACTACGAATACAAGTCTCCTCCTCCACCTAAAAAAGACTATGAGTACAAATCTCCTCCTCCACCTAAAAAGGACTATGAGTACAAATCTCCTCCGCCACCAAAGAA
GGACTATGAATACAAGTCTCCACCGCTACCCAAGAAGGTCTACGAGTACAAATCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAGAAGG
ACTACGAGTACAAGTCACCTCCACCTCCCAAGGACTACGAGTACAAATCTCCACCGCCTCCCAAGAATGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAAAAGGACTAT
GAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCATGAAGGACTACGACTATAAGTCGCCTCCACCACCTAAGAAGGATTACGAGTACAAATCTCCTCCACCACCTAAGAAAGACTACGA
ATATAAGTCACCTCCACCACCCAAGGAGTACAAGTACAAGTCTCCTCCACCCCCAGTTAAGATGCCGTCACCG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGCCATCGGTGATGGCTACTGACTACGTCTACTCTTCTCCACCACCTCCTTACTATGCATACAATTCACCTCCACCACACATTTATTACTCTCCTCCACCTGTTTATCA
CTCTCCACCTCCTCCAGCTTATTACTCGCCACCACCACCTAAGTATGAGTACAAGTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCACTCTCCAC
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GTTTACAAGTCACCACCACCACCAAAGAAAGACTATGAATACAAGTCTCCTCCCCCACCTGTTTATCATTCTCCACCTCCTCCAGTTTATTATTCTCCACCACCTCCCGT
TTATTACTCTCCTCCTCCACCGATGTACCACTCTCCTCCACCACCAGTATACAAGTCACCACCACCACCAAAGAACGACTATGAATACAAATCTCCTCCACCACCCAAGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
FAIGDGYULRLLFSTTSLLCIQFTSTTHLLLSSTCLSLSTSSSLLLATTTUVUVQVSSSTCLSLSSSTCLSLSTSSSLLLTATSUVUVQISTTSCLLLSSPTCILLSSTT
GLQVTTTTKERLUIQVSSPTCLSFSTSSSLLFSTTSRLLLSSSTDVPLSSTTSIQVTTTTKERLUIQISSTTQEGLRIQVSSSTUKRLUVQISSSTUKGLUVQISSATKE
GLUIQVSTATQEGLRVQISSTSUEGLUVQVSTTTQEGLRVQVTSTSQGLRVQISTASQEULRVQVSTTTQKGLUVQVSSTTHEGLRLUVASTTUEGLRVQISSTTUERLR
IUVTSTTQGVQVQVSSTPSUDAVT