; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO.jh024018.1 (gene) of Melon (Harukei-3) v1.41 genome

Gene IDMELO.jh024018.1
OrganismCucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Genome locationchr11:8590621..8594186
RNA-Seq ExpressionMELO.jh024018.1
SyntenyMELO.jh024018.1
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0009228 - thiamine biosynthetic process (biological process)
GO:0009791 - post-embryonic development (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
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GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
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GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR025525 - hAT-like transposase, RNase-H fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066354.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]8.23e-232100Show/hide
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A0A5D3DIL8 Putative transposase4.23e-21795.33Show/hide
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A0A5D3DZY7 Putative transposase6.35e-21895.33Show/hide
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B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 13.5e-3128.31Show/hide
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P08770 Putative AC transposase1.0e-2729.52Show/hide
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Q0JMB2 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 48.8e-2729.43Show/hide
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        T+T++H   +  + +  L+    G   L+  G+   VRC A+ILN +        ++ I  IR  ++FI++  A   KF +     KI   + +CLDV +
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Query:  RWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGS--LYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMAN
         WN+TY+ML AA+ + + F  LE    +Y    ST  +DW        FLK+ Y  TL I  +   + T+NM FH   V+Q  ++    + + ++ G+  
Subjt:  RWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGS--LYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMAN

Query:  NMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHE
         +  KF+KYW   +  N++L + + +DPR K++ V F    ++GP  A     +V+     L+ E
Subjt:  NMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHE

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 23.5e-3128.83Show/hide
Query:  TLTVDHASLNDTVVAYLLKRF---NKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPT
        T+T+D+   +  + +  L+ +      L+  G+   VRC AHILN +  D     +  I  IR  ++FI++SP+R  KF +     +I     +CLDV T
Subjt:  TLTVDHASLNDTVVAYLLKRF---NKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPT

Query:  RWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMANNM
        +WN+TY+ML AA+ +++AF  LE  D +Y    + + +DW        +LK+ YD    I  +   TSN+ FH+   +Q  +    G+ + +   +A +M
Subjt:  RWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMANNM

Query:  KAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHECST-----------TRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGL
          +F+KYW   +  NL+L + +V+DPR K++ V F    ++G E A+ +  VV+     L+ E                 G+    S   T +T   +G 
Subjt:  KAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHECST-----------TRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGL

Query:  DANIDFDSN-ENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTP
        D  +DFD     +       + +E++ D+S TP
Subjt:  DANIDFDSN-ENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTP

Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 31.8e-2728.86Show/hide
Query:  TLTVD-----HASLNDTVVAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDV
        T+T+D     H   +  ++ YL  +    ++  G+   VRC AHILN +  D     +  I  IR  ++FI++S     KF +     +I     +CLDV
Subjt:  TLTVD-----HASLNDTVVAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDV

Query:  PTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMAN
         T+WN+TY+ML AA+ +++ F  LE  D  Y    ST  +DW        +L + YD    I  +   TSN+ FH+   +Q+ +     + + +    A 
Subjt:  PTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMAN

Query:  NMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHECSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFD
         M  +F+KYW   +  NL+L + +V+DPR K++ V F    +   E A+ +  VV+     L+ E +T    +R    + ++ +    +G D  +DFD
Subjt:  NMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHECSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain1.5e-2125.57Show/hide
Query:  LTVDHASLNDTV--VAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRW
        +T +H + N  V  +   L   N G+L  G+ +   C A     +  D  ++  D I  IR  V+ +++S +   +F +  E  ++  +  + LD  T+W
Subjt:  LTVDHASLNDTV--VAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRW

Query:  NSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMANNMKA
        N+TYMML AA + ++ F  L+  D  Y+   S   +DW +   L  FLK  ++    +  +   ++   FH++   Q+ +       +  + G+A  M+ 
Subjt:  NSTYMMLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMANNMKA

Query:  KFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHEC--------STTRSGSRQGCSS-----TSTTSTQTVSGL
        K +KYW      +L+L + +V+DPR K++ V F    +FG +  +++   V+     LF E         +T+  G   G S        TT     S L
Subjt:  KFEKYWGNNEKNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHEC--------STTRSGSRQGCSS-----TSTTSTQTVSGL

Query:  DANID
        D  +D
Subjt:  DANID


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTTGACGGTTGATCATGCAAGTTTGAATGACACTGTTGTTGCTTATCTTTTAAAGAGATTCAATAAAGGATTATTGTTTGGTGGGAAATTTCTGCATGTT
CGTTGTTGTGCCCATATATTGAATCTTATAGTAACTGATGCTTTTAAGGAACATAATGATTGTATTGATAGGATTCGATATGTTGTGCGATTTATAAGGTCTTCT
CCTGCTCGTTTTTTGAAATTTAAAAAGTGCATTGAACTTGAAAAAATTGCTTGTAAGAGTTATGTGTGTCTTGATGTTCCTACAAGATGGAACTCCACATATATG
ATGCTTGAAGCTGCTGTTAAGTTTGAAAAAGCTTTTGATAGATTAGAAGATGAAGATGCCTCGTATAGACATGATATGTCAACGAATAAGAAAGATTGGACAAAT
GCTTGGATGTTAATACGATTTTTAAAAGTATTTTATGATGTCACATTAAAGATTTCGGGTTCTTTGTATACTACTTCGAACATGGTTTTCCATCAGATTACAGTG
GTTCAGAATTGTATACGTTTGAATGCGGGTAATGCAAATGCATTGTTAGTTGGAATGGCTAATAACATGAAGGCAAAGTTCGAGAAATATTGGGGAAACAATGAA
AAGAATAATTTGTTGTTGTATGTTGTTATTGTGTTGGATCCTCGAAAGAAATTAAGATTTGTATCTTTTTGTTTGAAAAATGTTTTTGGTCCCGAGGTTGCTGAA
TCCATGGGAAATGTAGTGGAACAATGTTGTAGACATCTCTTTCATGAGTGTAGTACTACTCGAAGTGGGAGTAGACAAGGATGTAGTAGTACTAGTACAACTAGT
ACACAAACTGTTTCAGGCTTGGATGCTAATATTGATTTTGATTCGAATGAAAATGTGGGTGAAGATTTTGTCTACGACACGATTGTTGAGGAATTTGAAGATGAT
TCTACTACACCTTTCGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCATTCCTCGCGTCGTGACCCATTCTTTCTCGTTTTCGCAATCGCCGCCGTCCGCACGCCATCAGCCGCAATCGCCGCCGCTCGCACGCCGTCCGCACACCTAA
CCCAATACCCGTTCGCTCAGCCGCACGCCCAATTCATTATTTGTTAAATCAAATGGATTCAACGGATATGGAGTTAGAGTGTGATGGGAGTTGTGAAGCTTCAAA
AATCGCAAGGGACGAAGATACAGATGGCAAGGGTAAAACCATTGATGTTGATCTTGATTCATATGGCAGAGAAGATGTTCCAAATCCCCCAAAAATAAGGAAGAA
TGTCAAACAATCAATGGTTTGGGACCACTTTGAGAGGCTTAAAGGTGATCCTAATGACCCTCGTGCTAAATGTAAATATTGTGGAGTTGTTTATGCATGTCATTC
TAAACGTAATGATACTGGAACTATCAAGCATCATTTAGAAAATTGCAAAAAGTACCCTTACCCAAAAAAGAGTGCCCAAACTCAAATGACATTAGCTTTTAAACC
TAAAGACAAAGTTGGAGATAATTCTTCACAACTTGTATGTGAATCATTTAGTTTAGATGGTTGTCGGGATGCTTTAGTTGAGATGATAATAGTTGATGAATTGCC
CTTTAAGTTTGTGGAGGGTAAGGGATTTAAGAAGTTTGTGGATAAATTAACATGTGGAAATCATACTAGATTTGTTGTTCCATCTTGATTTACTGTGGCTGGAGA
TGTGCTTAAGTTGTATGTTAATGAGAAGAATTGTTTGAGAGACATGTTTGTAAAAAATAAGTATAGAGTTTCTCTCACCACTGATTGTTGGACATCGGGACAAAA
TATTAATTACATGGTCCTAAAAGCCCATTTCATTGATTCTGATTGTTACATAAGAGAATACTTAGTTTTTCTCTAATTGAGAATCGTAAAGGTGATACTATCGGT
AAAACCATTGAAAAGAATTTGAAGGATTGGGGCATTGAGAGGGTAATGACTTTGACGGTTGATCATGCAAGTTTGAATGACACTGTTGTTGCTTATCTTTTAAAG
AGATTCAATAAAGGATTATTGTTTGGTGGGAAATTTCTGCATGTTCGTTGTTGTGCCCATATATTGAATCTTATAGTAACTGATGCTTTTAAGGAACATAATGAT
TGTATTGATAGGATTCGATATGTTGTGCGATTTATAAGGTCTTCTCCTGCTCGTTTTTTGAAATTTAAAAAGTGCATTGAACTTGAAAAAATTGCTTGTAAGAGT
TATGTGTGTCTTGATGTTCCTACAAGATGGAACTCCACATATATGATGCTTGAAGCTGCTGTTAAGTTTGAAAAAGCTTTTGATAGATTAGAAGATGAAGATGCC
TCGTATAGACATGATATGTCAACGAATAAGAAAGATTGGACAAATGCTTGGATGTTAATACGATTTTTAAAAGTATTTTATGATGTCACATTAAAGATTTCGGGT
TCTTTGTATACTACTTCGAACATGGTTTTCCATCAGATTACAGTGGTTCAGAATTGTATACGTTTGAATGCGGGTAATGCAAATGCATTGTTAGTTGGAATGGCT
AATAACATGAAGGCAAAGTTCGAGAAATATTGGGGAAACAATGAAAAGAATAATTTGTTGTTGTATGTTGTTATTGTGTTGGATCCTCGAAAGAAATTAAGATTT
GTATCTTTTTGTTTGAAAAATGTTTTTGGTCCCGAGGTTGCTGAATCCATGGGAAATGTAGTGGAACAATGTTGTAGACATCTCTTTCATGAGTGTAGTACTACT
CGAAGTGGGAGTAGACAAGGATGTAGTAGTACTAGTACAACTAGTACACAAACTGTTTCAGGCTTGGATGCTAATATTGATTTTGATTCGAATGAAAATGTGGGT
GAAGATTTTGTCTACGACACGATTGTTGAGGAATTTGAAGATGATTCTACTACACCTTTCGAATAAGGATCATCGAAGATTGATATCTATTTGTTGGAAGCCAAT
GTTAGGACCGAAGGTGATTTTGACATACTACAGTGGTGGAAGATGAACAGTGATCGATTTGAGGTTCTTGGTCAAATGGCTAGAGATATTTTGGCTATTCCAGTT
TCTATTGTAGTGTCTGAGTCGACTTTTAGTACTGGAGGACGTGTTGTTGACTCATCACGCTGCTCATTGGCTCCTAAAACAGTGGAGGCTCTCATATGTACTCAA
AATTGGCTAAATTCTGATCCAATACATCTTCAATTTCAACATGAATTGGAAGAGGCTTCAAAATTTGAAGAAGGATTTCGGGTGGTTATGGAGAATGAAAAGGAG
CCTGAAGACCTTACAGATTTTGATAAGTTGTCAATTACCGATTATTAACTAATTCTGATCCAAGACTTGTAATATTTCTATTGACTAAATTATCATAGTGTTTTT
GTTTCATACTTTGGTTGTATTTGTGACTATTAATAGTAATGTGGTGAACTGAATTGAACTTGGATGTTTCTAACCCTATAATATTTGATATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTLTVDHASLNDTVVAYLLKRFNKGLLFGGKFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRIRYVVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYM
MLEAAVKFEKAFDRLEDEDASYRHDMSTNKKDWTNAWMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNMVFHQITVVQNCIRLNAGNANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNE
KNNLLLYVVIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFGPEVAESMGNVVEQCCRHLFHECSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDANIDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDD
STTPFE