| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0054091.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.34e-100 | 91.3 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
+VKAPRQRPAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTL GYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+ TRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQ+LEDMLRA
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Query: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRS VCWG+VGEQRMLGPELV
Subjt: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| KAA0054799.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.89e-99 | 76.38 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQRPAG LQPLSVPGWKWESVSM+FI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| KAA0063083.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.78e-100 | 76.38 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| KAA0066468.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.28e-101 | 91.93 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVD+LTKSA+FVPGKSTYTA+ TRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Query: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| TYK18679.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.07e-100 | 75.88 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQT+RLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7UKL5 Pol protein | 1.62e-100 | 91.3 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
+VKAPRQRPAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTL GYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+ TRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQ+LEDMLRA
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Query: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRS VCWG+VGEQRMLGPELV
Subjt: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| A0A5A7UMV9 Pol protein | 9.17e-100 | 76.38 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQRPAG LQPLSVPGWKWESVSM+FI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| A0A5A7V4U5 Pol protein | 1.34e-100 | 76.38 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| A0A5A7VFG3 Pol protein | 4.01e-101 | 91.93 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVD+LTKSA+FVPGKSTYTA+ TRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRA
Query: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: CVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| A0A5D3D562 Pol protein | 2.45e-100 | 75.88 | Show/hide |
Query: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
+VKAPRQ PAG LQPLSVPGWKWESVSMDFI GL KTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTA+
Subjt: RVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTAT---------------------------------
Query: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
+LGTRLDFSTAFHPQTDGQT+RLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQAT MAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
Subjt: -----SLGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSPVCWGEVGEQRMLGPELV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 2.5e-18 | 32.37 | Show/hide |
Query: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
K+ +P G LQP+ WES+SMDFI L ++ GY ++VVVDR +K A VP + TA D
Subjt: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
Query: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
FS + PQTDGQTER NQ +E +LR +W H+ L++ +YNN+ + T M PFE ++
Subjt: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
|
|
| P0CT35 Transposon Tf2-2 polyprotein | 2.5e-18 | 32.37 | Show/hide |
Query: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
K+ +P G LQP+ WES+SMDFI L ++ GY ++VVVDR +K A VP + TA D
Subjt: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
Query: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
FS + PQTDGQTER NQ +E +LR +W H+ L++ +YNN+ + T M PFE ++
Subjt: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 2.5e-18 | 32.37 | Show/hide |
Query: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
K+ +P G LQP+ WES+SMDFI L ++ GY ++VVVDR +K A VP + TA D
Subjt: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
Query: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
FS + PQTDGQTER NQ +E +LR +W H+ L++ +YNN+ + T M PFE ++
Subjt: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.1e-18 | 32.16 | Show/hide |
Query: KMNHNA---IRSFIYLFRVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATS---------------
K+ H+ IR+ + +K+ R R G LQPL + +W +SMDF+ GL T +I VVVDR +K AHF+ + T AT
Subjt: KMNHNA---IRSFIYLFRVKAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATS---------------
Query: -----------------------LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSP
LG + S+A HPQTDGQ+ER Q L +LRA V +W +L +EF YN++ T +PFE G +P
Subjt: -----------------------LGTRLDFSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALYGKCCRSP
|
|
| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 2.5e-18 | 32.37 | Show/hide |
Query: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
K+ +P G LQP+ WES+SMDFI L ++ GY ++VVVDR +K A VP + TA D
Subjt: KAPRQRPAGRLQPLSVPGWKWESVSMDFIIGLSKTLKGYTVIWVVVDRLTKSAHFVPGKSTYTATSLGTRLD----------------------------
Query: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
FS + PQTDGQTER NQ +E +LR +W H+ L++ +YNN+ + T M PFE ++
Subjt: ----------FSTAFHPQTDGQTERLNQILEDMLRACVLEFSGSWDSHLHLMEFAYNNSYQATTDMAPFEALY
|
|
