; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C000175 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C000175
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionPMD domain-containing protein
Genome locationchr11:10747928..10748666
RNA-Seq ExpressionMELO3C000175
SyntenyMELO3C000175
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0047478.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G00950 [Cucumis melo var. makuwa]8.6e-3591.86Show/hide
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TYK00336.1 hypothetical protein E5676_scaffold1923G00140 [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-41100Show/hide
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TYK06278.1 hypothetical protein E5676_scaffold157G00620 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-3388.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SQC9 PMD domain-containing protein1.6e-3490.7Show/hide
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A0A5A7T019 PMD domain-containing protein1.3e-3691.86Show/hide
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A0A5A7TX42 Uncharacterized protein4.2e-3591.86Show/hide
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A0A5A7TZZ9 PMD domain-containing protein1.3e-3388.37Show/hide
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A0A5D3BQ12 PMD domain-containing protein1.8e-41100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCATAATCTTGAGGAAGAGGTAAAGGTCCGTAAAGATGAGAGCGATAGAAGCAAATGTGATCGTCATTGGAAGAGGGCTTTGAAGAAAGCGAAGGTATCA
GGTGATCATCCCGACGGAAGGGGTTTAAGTGCTTTAGAAGTTTTTGATGTTCCACCACTGTCACCATTGAACGATCATCTTGAAGGACTTATAGGGCCAGACAGT
GATGAATCTTTGACGGGACCTCACGCAGTTGATTCGGCCTTTGAGGAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGTTCTTGCTACTTGTCCTCTCGTTGCGAAAATACCTGAATCATAACATCATACAGTCCATATCGATTTGGACAACAGTTTGGCTTTTACCAGGACCTCCCT
AATGATATAGGGGGCATGCCACCTGCGATCACGCTGGATAATATATTATATCACTGGAGAATATGTATGAGGCGTAACACTTTATCCGAGCTATACTTACCCGCA
CGTTTGTTAGAGCCTTGCAAGCATGTGACTCAACGATTTACAGACTGGTGGACCACGAAGCACGGGACCTATTTTGAGGATAACAGACACCATTTGGTGAGTAGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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