; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C002235 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C002235
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationchr12:24012290..24015393
RNA-Seq ExpressionMELO3C002235
SyntenyMELO3C002235
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055202.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-28699.4Show/hide
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XP_004152457.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucumis sativus]6.3e-27795.22Show/hide
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XP_008437964.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucumis melo]3.8e-290100Show/hide
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XP_023000741.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Cucurbita maxima]2.8e-25684.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU18 Uncharacterized protein3.1e-27795.22Show/hide
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A0A1S3AV83 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial1.8e-290100Show/hide
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A0A5A7UH90 Pentatricopeptide repeat-containing protein9.5e-28799.4Show/hide
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A0A5D3BHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.8e-290100Show/hide
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Query:  AYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVV
        AYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVV
Subjt:  AYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVV

Query:  GEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIR
        GEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIR
Subjt:  GEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIR

Query:  YFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLPRQF
        YFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLPRQF
Subjt:  YFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLPRQF

Query:  KL
        KL
Subjt:  KL

A0A6J1KGP2 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial1.3e-25684.77Show/hide
Query:  KIGGKIKGKREKDVSISCKRNTIFDMFQRNINRRVTKTKTKTVFLHLCPPIHSFFLSYRNFTA----QSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHG
        K  GK +G  +K+VSI CKR T F MF RNIN  V K KTK VFLHLC P  S  LS R+FT     QS SALD  A A DIA LVLES PKSLRG LHG
Subjt:  KIGGKIKGKREKDVSISCKRNTIFDMFQRNINRRVTKTKTKTVFLHLCPPIHSFFLSYRNFTA----QSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHG

Query:  LPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFL
          +QFTPELV+KVLKRLWFHGPKALQFFK LEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYK+VWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAI+VFL
Subjt:  LPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFL

Query:  SMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEA
        SMREHGC QDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALE+LKEMV+RGLTPTITTYNI+LKGYFRAGQI EA
Subjt:  SMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEA

Query:  WEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAG
        W FFLQMK+REVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVF+EMVGEG+LPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAV++FE+M+ +GYVPNLTTYNV+IRGL HAG
Subjt:  WEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAG

Query:  NMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQ-GSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV
        NMD+AMEF+ERMKTDGCEPNVQTYNV IRYFCDAGD+EKGLS+FEKMG  G LPNLDTYN++ISAMFVRK+S+DLVVAGKLL+EMID+GF+PRKFTFNRV
Subjt:  NMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQ-GSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV

Query:  LNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLPRQFKL
        LNGLLLTGNQAFA EILR QS+CGRLPR+FKL
Subjt:  LNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLPRQFKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3ECK2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62680, mitochondrial1.3e-5131.12Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR
        +++ +M      P   T   +   F    +   A+ +   M E G   D+ ++N I+D LCK+KRV  A++   ++ R   + +VV+Y  + NG C   R
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR

Query:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL
           A  +L +M+++ +TP + TY+ LL  + + G++ EA E F +M +  ++ D+VTY+++++G  +   I  A ++F+ MV +G L    +YN +I   
Subjt:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL

Query:  CKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNI
        CK   VE+ + +F EM ++G V N  TYN +I+G F AG++D+A EF  +M   G  P++ TYN+ +   CD G++EK L +FE M +  +  ++ TY  
Subjt:  CKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNI

Query:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG
        +I  M    K E+   A  L   +  +G  P   T+  +++GL   G
Subjt:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG

Q9C9A2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g71060, mitochondrial4.7e-5729.64Show/hide
Query:  IFDMFQR----NINRRVTK--TKTKTVFLHLCPPIH--SFFLSYRNFTAQS----TSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVL
        +F  F R    N++RRV    + + +  L   P IH  S F  Y +F A S     SA D +  A  I  ++ +     +   L+   ++ +P L+++VL
Subjt:  IFDMFQR----NINRRVTK--TKTKTVFLHLCPPIH--SFFLSYRNFTAQS----TSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVL

Query:  KRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSF
        K+L   G  AL  FK  E    + H++S+++  I+  G+++ +K +W+LV  M+A+++  S +TFA+I+ R+  A K   AI  F  M E G   +   F
Subjt:  KRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSF

Query:  NTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEI
        N +LD L KS+ V  A     K+ + +F+ D+ SY I+  GW       +  EV +EM + G  P +  Y I++  + +A + +EA  FF +M++R  + 
Subjt:  NTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEI

Query:  DVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKT
            + ++++G G   ++  A + F      G      TYNA++   C    +E+A    +EM  KG  PN  TY+++   L H   M R+ E  E  +T
Subjt:  DVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKT

Query:  DGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ
          CEP V TY + +R FC+   ++  + ++++M G+G LP +  ++ LI+A+    K ++   A +   EM+D G  P    F+R+   LL  G +
Subjt:  DGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ

Q9FVX2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g77360, mitochondrial1.4e-5630.54Show/hide
Query:  FLSYRNFTAQSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYK
        FLS R +++ S    D A  A +I+ +++ S    L  +L    L+ + E+V+ VL R    G    +FF+  E    Y HS  ++   I+   ++R YK
Subjt:  FLSYRNFTAQSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYK

Query:  TVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCL
         +W L+  MR +++  + +TF I+  ++  A K D AI  F  M ++  P +L +FN +L  LCKSK V  A   +F+ +R +F  D  +Y+I+  GW  
Subjt:  TVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCL

Query:  IKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMI
            PKA EV +EM++ G  P I TY+I++    +AG++ EA      M     +     Y+ +VH +G    ++ A   F EM   G+    A +N++I
Subjt:  IKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMI

Query:  QVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDT
           CK + ++N   + +EM  KG  PN  + N+++R L   G  D A +   +M    CEP+  TY + I+ FC+  ++E    +++ M  +G  P++ T
Subjt:  QVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDT

Query:  YNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV
        +++LI+ +   + ++   V   LL EMI+ G  P   TF R+
Subjt:  YNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV

Q9S7R4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial1.1e-18369.41Show/hide
Query:  AAAADIATLVLESDPKSLRGS---LHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRI
        A +A IA L+L S   + +     L      +TP LV+ VLKRLW HGPKALQFF  L+ +H  Y H +SSFD AIDIA R+  + TVW+L+ RMR+ RI
Subjt:  AAAADIATLVLESDPKSLRGS---LHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLE-YHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRI

Query:  GPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEM
        GPS KTFAI+AER+  AGKPD+A+++FL+M EHGC QDL SFNTILD+LCKSKRVE AY  LF+ LRG+F  D V+YN+I NGWCLIKRTPKALEVLKEM
Subjt:  GPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEM

Query:  VERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVL
        VERG+ P +TTYN +LKG+FRAGQI+ AWEFFL+MKKR+ EIDVVTYTT+VHGFGV GEIKRAR VF+EM+ EG+LPS ATYNAMIQVLCKKD+VENAV+
Subjt:  VERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVL

Query:  MFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNILISAMFVRKKS
        MFEEM+++GY PN+TTYNV+IRGLFHAG   R  E ++RM+ +GCEPN QTYN+ IRY+ +  +VEK L +FEKMG G  LPNLDTYNILIS MFVRK+S
Subjt:  MFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNILISAMFVRKKS

Query:  EDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCG-RLPRQFKL
        ED+VVAGKLLLEM++RGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILR QSK G RL R+F+L
Subjt:  EDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCG-RLPRQFKL

Q9SXD1 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62670, mitochondrial2.0e-5231.06Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK
        AL+ RM A+   P   T+ ++       G  D A  +   M +      +  +NTI+D LCK K ++ A N LFK +  K  + +VV+Y+ + +  C   
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK

Query:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV
        R   A  +L +M+ER + P + T++ L+  + + G++ EA + + +M KR ++  +VTY+++++GF +   +  A+++F  MV +   P   TYN +I+ 
Subjt:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV

Query:  LCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN
         CK   VE  + +F EM ++G V N  TYN++I+GLF AG+ D A E  + M +DG  PN+ TYN  +   C  G +EK + +FE + +  + P + TYN
Subjt:  LCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN

Query:  ILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLP
        I+I  M    K ED      L   +  +G  P    +N +++G    G++  A  + ++  + G LP
Subjt:  ILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62670.1 rna processing factor 21.4e-5331.06Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK
        AL+ RM A+   P   T+ ++       G  D A  +   M +      +  +NTI+D LCK K ++ A N LFK +  K  + +VV+Y+ + +  C   
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGK-FKADVVSYNIIANGWCLIK

Query:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV
        R   A  +L +M+ER + P + T++ L+  + + G++ EA + + +M KR ++  +VTY+++++GF +   +  A+++F  MV +   P   TYN +I+ 
Subjt:  RTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQV

Query:  LCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN
         CK   VE  + +F EM ++G V N  TYN++I+GLF AG+ D A E  + M +DG  PN+ TYN  +   C  G +EK + +FE + +  + P + TYN
Subjt:  LCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSL-PNLDTYN

Query:  ILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLP
        I+I  M    K ED      L   +  +G  P    +N +++G    G++  A  + ++  + G LP
Subjt:  ILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCGRLP

AT1G62680.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein9.4e-5331.12Show/hide
Query:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR
        +++ +M      P   T   +   F    +   A+ +   M E G   D+ ++N I+D LCK+KRV  A++   ++ R   + +VV+Y  + NG C   R
Subjt:  ALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKR

Query:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL
           A  +L +M+++ +TP + TY+ LL  + + G++ EA E F +M +  ++ D+VTY+++++G  +   I  A ++F+ MV +G L    +YN +I   
Subjt:  TPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVL

Query:  CKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNI
        CK   VE+ + +F EM ++G V N  TYN +I+G F AG++D+A EF  +M   G  P++ TYN+ +   CD G++EK L +FE M +  +  ++ TY  
Subjt:  CKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLP-NLDTYNI

Query:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG
        +I  M    K E+   A  L   +  +G  P   T+  +++GL   G
Subjt:  LISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTG

AT1G71060.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.3e-5829.64Show/hide
Query:  IFDMFQR----NINRRVTK--TKTKTVFLHLCPPIH--SFFLSYRNFTAQS----TSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVL
        +F  F R    N++RRV    + + +  L   P IH  S F  Y +F A S     SA D +  A  I  ++ +     +   L+   ++ +P L+++VL
Subjt:  IFDMFQR----NINRRVTK--TKTKTVFLHLCPPIH--SFFLSYRNFTAQS----TSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVL

Query:  KRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSF
        K+L   G  AL  FK  E    + H++S+++  I+  G+++ +K +W+LV  M+A+++  S +TFA+I+ R+  A K   AI  F  M E G   +   F
Subjt:  KRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSF

Query:  NTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEI
        N +LD L KS+ V  A     K+ + +F+ D+ SY I+  GW       +  EV +EM + G  P +  Y I++  + +A + +EA  FF +M++R  + 
Subjt:  NTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEI

Query:  DVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKT
            + ++++G G   ++  A + F      G      TYNA++   C    +E+A    +EM  KG  PN  TY+++   L H   M R+ E  E  +T
Subjt:  DVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKT

Query:  DGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ
          CEP V TY + +R FC+   ++  + ++++M G+G LP +  ++ LI+A+    K ++   A +   EM+D G  P    F+R+   LL  G +
Subjt:  DGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQ

AT1G74900.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.0e-16363.56Show/hide
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        A +A IA L+L S   + +     L      +TP LV+ VLKRLW HGPKALQFF  L+ +H  Y H +SSFD AIDIA R+  + TVW+L+ RMR+ RI
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Query:  GPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEM
        GPS KTFAI+AER+  AGKPD+A+++FL+M EHGC QDL SFNTILD+LCKSKRVE AY  LF+ LRG+F  D V+YN+I NGWCLIKRTPKALEVLKEM
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Query:  VERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVL
        VERG+ P +TTYN +LKG+FRAGQI+ AWEFFL+MKKR+ EIDVVTYTT+VHGFGV GEIKRAR VF+EM+ EG+LPS ATYNAMIQVLCKKD+VENAV+
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Query:  MFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNILISAMFVRKKS
        MFEEM+++GY PN+TTYNV+IRGLFHAG   R  E ++RM+ +GCEPN QTYN+ IRY+ +  +VEK L +FEKMG G  LPNLDTYNILIS MFVRK+S
Subjt:  MFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGS-LPNLDTYNILISAMFVRKKS

Query:  EDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSKCG-RLPRQFKL
        ED+VVA                             GNQAFAKEILR QSK G RL R+F+L
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AT1G77360.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein9.7e-5830.54Show/hide
Query:  FLSYRNFTAQSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYK
        FLS R +++ S    D A  A +I+ +++ S    L  +L    L+ + E+V+ VL R    G    +FF+  E    Y HS  ++   I+   ++R YK
Subjt:  FLSYRNFTAQSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGLPLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYK

Query:  TVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHGCPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCL
         +W L+  MR +++  + +TF I+  ++  A K D AI  F  M ++  P +L +FN +L  LCKSK V  A   +F+ +R +F  D  +Y+I+  GW  
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Query:  IKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMI
            PKA EV +EM++ G  P I TY+I++    +AG++ EA      M     +     Y+ +VH +G    ++ A   F EM   G+    A +N++I
Subjt:  IKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKREVEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMI

Query:  QVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDT
           CK + ++N   + +EM  KG  PN  + N+++R L   G  D A +   +M    CEP+  TY + I+ FC+  ++E    +++ M  +G  P++ T
Subjt:  QVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDGCEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKM-GQGSLPNLDT

Query:  YNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV
        +++LI+ +   + ++   V   LL EMI+ G  P   TF R+
Subjt:  YNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AACTTGTTTTGTTTGGGCAGAGAGAAAATAGGAGGGAAAATCAAGGGGAAGAGGGAAAAAGATGTTTCAATCAGCTGCAAACGGAACACTATTTTCGATATGTTT
CAAAGAAACATCAACCGAAGAGTAACCAAGACGAAGACGAAGACTGTTTTTCTCCATCTTTGCCCACCAATACATAGCTTCTTCCTCTCATATCGCAACTTCACT
GCCCAATCTACATCCGCCCTAGACACCGCCGCCGCCGCTGCGGATATCGCCACTCTTGTTCTCGAGTCCGACCCCAAAAGCTTGAGGGGATCCCTCCATGGATTA
CCACTTCAATTTACCCCTGAACTTGTCGACAAGGTTCTCAAACGCCTATGGTTCCACGGACCGAAAGCGCTACAATTCTTCAAACACCTTGAGTACCATCCATCT
TATGCCCATTCTTCATCTTCCTTCGACCACGCCATCGACATTGCAGGTCGTATGCGTGACTACAAGACCGTATGGGCTCTAGTAGCTCGAATGCGAGCTCGCCGG
ATTGGACCCAGTTCAAAAACCTTCGCAATTATAGCTGAGAGGTTCGTAGGCGCGGGAAAACCAGATAGAGCGATCAGGGTTTTCTTGTCGATGCGGGAGCATGGG
TGTCCTCAGGATCTGCATTCGTTTAACACCATTCTCGACATTCTCTGTAAGTCAAAACGTGTAGAAATGGCTTATAACCATCTGTTCAAGGTTTTGAGAGGAAAA
TTTAAGGCTGACGTTGTTAGTTATAACATAATTGCAAATGGATGGTGTTTGATTAAGCGTACACCCAAAGCGTTGGAGGTTTTGAAGGAGATGGTGGAAAGAGGT
TTAACTCCAACTATTACTACTTACAATATACTTTTAAAAGGGTATTTTAGAGCTGGTCAGATTAAGGAAGCTTGGGAATTCTTTTTGCAAATGAAAAAGAGGGAA
GTTGAAATTGATGTTGTTACTTATACTACTATGGTTCATGGGTTTGGTGTTGTGGGTGAAATAAAAAGGGCTCGAAAGGTTTTCAATGAAATGGTTGGTGAAGGG
ATTCTTCCTTCAACAGCAACTTACAATGCTATGATACAGGTTCTGTGTAAGAAAGATAGTGTGGAGAATGCAGTATTGATGTTTGAGGAGATGATAAAGAAGGGT
TATGTGCCGAATTTGACCACTTATAACGTGGTTATAAGAGGATTGTTTCATGCAGGGAATATGGATAGGGCTATGGAGTTTATTGAGAGAATGAAAACTGATGGG
TGTGAACCAAATGTTCAGACATATAACGTTGCCATTCGATACTTTTGTGATGCTGGTGACGTTGAAAAGGGGTTGAGTATGTTTGAGAAGATGGGGCAGGGGAGT
TTACCAAATTTGGATACGTATAATATTTTGATTAGTGCAATGTTTGTGAGGAAGAAGTCTGAAGATTTAGTGGTTGCTGGGAAGCTGTTGCTTGAGATGATTGAT
AGAGGATTCATTCCTAGGAAGTTCACTTTCAATCGGGTTCTCAACGGGCTTTTGCTGACGGGTAATCAAGCTTTTGCAAAGGAGATTTTGAGACAGCAGAGCAAA
TGTGGCCGTCTTCCTCGCCAATTTAAGTTATGA
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GCCCAATCTACATCCGCCCTAGACACCGCCGCCGCCGCTGCGGATATCGCCACTCTTGTTCTCGAGTCCGACCCCAAAAGCTTGAGGGGATCCCTCCATGGATTA
CCACTTCAATTTACCCCTGAACTTGTCGACAAGGTTCTCAAACGCCTATGGTTCCACGGACCGAAAGCGCTACAATTCTTCAAACACCTTGAGTACCATCCATCT
TATGCCCATTCTTCATCTTCCTTCGACCACGCCATCGACATTGCAGGTCGTATGCGTGACTACAAGACCGTATGGGCTCTAGTAGCTCGAATGCGAGCTCGCCGG
ATTGGACCCAGTTCAAAAACCTTCGCAATTATAGCTGAGAGGTTCGTAGGCGCGGGAAAACCAGATAGAGCGATCAGGGTTTTCTTGTCGATGCGGGAGCATGGG
TGTCCTCAGGATCTGCATTCGTTTAACACCATTCTCGACATTCTCTGTAAGTCAAAACGTGTAGAAATGGCTTATAACCATCTGTTCAAGGTTTTGAGAGGAAAA
TTTAAGGCTGACGTTGTTAGTTATAACATAATTGCAAATGGATGGTGTTTGATTAAGCGTACACCCAAAGCGTTGGAGGTTTTGAAGGAGATGGTGGAAAGAGGT
TTAACTCCAACTATTACTACTTACAATATACTTTTAAAAGGGTATTTTAGAGCTGGTCAGATTAAGGAAGCTTGGGAATTCTTTTTGCAAATGAAAAAGAGGGAA
GTTGAAATTGATGTTGTTACTTATACTACTATGGTTCATGGGTTTGGTGTTGTGGGTGAAATAAAAAGGGCTCGAAAGGTTTTCAATGAAATGGTTGGTGAAGGG
ATTCTTCCTTCAACAGCAACTTACAATGCTATGATACAGGTTCTGTGTAAGAAAGATAGTGTGGAGAATGCAGTATTGATGTTTGAGGAGATGATAAAGAAGGGT
TATGTGCCGAATTTGACCACTTATAACGTGGTTATAAGAGGATTGTTTCATGCAGGGAATATGGATAGGGCTATGGAGTTTATTGAGAGAATGAAAACTGATGGG
TGTGAACCAAATGTTCAGACATATAACGTTGCCATTCGATACTTTTGTGATGCTGGTGACGTTGAAAAGGGGTTGAGTATGTTTGAGAAGATGGGGCAGGGGAGT
TTACCAAATTTGGATACGTATAATATTTTGATTAGTGCAATGTTTGTGAGGAAGAAGTCTGAAGATTTAGTGGTTGCTGGGAAGCTGTTGCTTGAGATGATTGAT
AGAGGATTCATTCCTAGGAAGTTCACTTTCAATCGGGTTCTCAACGGGCTTTTGCTGACGGGTAATCAAGCTTTTGCAAAGGAGATTTTGAGACAGCAGAGCAAA
TGTGGCCGTCTTCCTCGCCAATTTAAGTTATGAAGCTGGCATCGATTATAAATGATGTAAGTTTCAGTGCCTTCATTTGACCTTGTTGTGAAGCTGGCACTTCAG
AACCAGTTCCATTCTACCTGAAGACGACAAACAAGATTCTGAACTATATTTATGGATCCGGAAGTGTTTGAATCGTTTATGGATGGACAAGTTAATTAGTCTCCT
TGATCCCCTGGTTAAGAGATAGAATGAAGCTGATATCTTGAAGCTTCCATCACGACCATTTGGTAACCATTAGTTTTTTGTTTTTGAAAATCAAGTCTACTTTTC
TTTTTTAGTTTATTCTATGGTTTGCAAATTTTTCTGGCAAAAGAGTTAAATTCTTAGCCAAATTAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAATTTTAAAGTTTAAAAA
ACTGACTTGATTTTTGAAAGCATCGGTAATAAGAAGATTACGTTGCTAATCATTTAGAGGTGATATTAGTGTTTGTGGACTTAATTTTCAAAAACTAAAAATAAA
AAACCAAATGGTTACCAAAAAGGCTCAACAATGCATTTTTCCTTTTAGAGATTTCAGGTGCAGAGTACAAAGCAGCAGATATCAGTGGTCACTTGAGTTCATTTG
TTTCAAGTTTGCTTGCTAGTTGCTAGATCATATCAGGATATCCATACTGATAATGTTGGAAACTTTCAGAAGCAGAACAGTCGAATGCCAGTCTTCACATTAAAC
ATCCTCCACATTGACTCTTGCCTATAAATAAAAAAGAGCATCCATGTAGACATACTTTGTCACATCTCCCATTGTCAGAAATTTGATGGCAGAGTTCTTATTGCC
ATCCGTAAGCTCAATGCCGCCAAATTTATACAGGAATACAACACCATTGACTTGACAAGGCTAGGTTGTATTCTGGTTTTGTAAGTGTTAAAAAAAGTGTAAGCC
CTTAGAAATTCAATACAAACCACCCCAATTATAATATCCAAGGCTATTGCTCTGTTGATGGTTTGGAGTGGGCAATCAGTGTAGAGTTCTACTGATTCTGTTTGG
GTTTGTGGCTGTAACTTAGTCCTTTGATATTGTATTTACTATAAATCTAAAGCTGCCTGGTTTCTAATTTGATATTGGACTTAATAACTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NLFCLGREKIGGKIKGKREKDVSISCKRNTIFDMFQRNINRRVTKTKTKTVFLHLCPPIHSFFLSYRNFTAQSTSALDTAAAAADIATLVLESDPKSLRGSLHGL
PLQFTPELVDKVLKRLWFHGPKALQFFKHLEYHPSYAHSSSSFDHAIDIAGRMRDYKTVWALVARMRARRIGPSSKTFAIIAERFVGAGKPDRAIRVFLSMREHG
CPQDLHSFNTILDILCKSKRVEMAYNHLFKVLRGKFKADVVSYNIIANGWCLIKRTPKALEVLKEMVERGLTPTITTYNILLKGYFRAGQIKEAWEFFLQMKKRE
VEIDVVTYTTMVHGFGVVGEIKRARKVFNEMVGEGILPSTATYNAMIQVLCKKDSVENAVLMFEEMIKKGYVPNLTTYNVVIRGLFHAGNMDRAMEFIERMKTDG
CEPNVQTYNVAIRYFCDAGDVEKGLSMFEKMGQGSLPNLDTYNILISAMFVRKKSEDLVVAGKLLLEMIDRGFIPRKFTFNRVLNGLLLTGNQAFAKEILRQQSK
CGRLPRQFKL