; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C003076 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C003076
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionthylakoid membrane protein TERC, chloroplastic
Genome locationchr08:30442314..30448382
RNA-Seq ExpressionMELO3C003076
SyntenyMELO3C003076
Gene Ontology termsGO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process)
GO:0090351 - seedling development (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005496 - Integral membrane protein TerC
IPR022369 - Integral membrane protein TerC, riboswitch-linked


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142102.1 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic [Cucumis sativus]2.2e-18093.09Show/hide
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XP_008447276.1 PREDICTED: thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic [Cucumis melo]2.7e-19198.07Show/hide
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XP_022143941.1 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic isoform X3 [Momordica charantia]1.1e-16083.7Show/hide
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XP_038883780.1 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]3.2e-17993.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L220 Uncharacterized protein1.1e-18093.09Show/hide
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A0A1S3BGI3 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic1.3e-19198.07Show/hide
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A0A5A7TWH1 Thylakoid membrane protein TERC1.3e-19198.07Show/hide
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A0A6J1CQT8 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic isoform X16.9e-16483.11Show/hide
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A0A6J1CRT5 thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic isoform X35.5e-16183.7Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JZG9 Thylakoid membrane protein TERC, chloroplastic1.5e-11562.47Show/hide
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        + S+IH+G+   +K D  +  +    P F  R W ++  + +  P  +S   N   S  P + CS  I++E +        P   + N T+S   +    
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Query:  -----IEGPESKVSSIRNVALCVATAVAFGIGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGT
              +  E+  +S + VALCV TAVAFGIG+GLK+GVGKASEFFAGY+LEQSLSVDNLFVFVL+FKYFKVP  YQN+VLTYGI+GAI FR T+ILLGT
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        PFIV +SN FAILGLRSL+ L+++GM ELEYLQPSI VVL FIG KMILDFFGFH+ TEASLG VA+SLSTGVLLSL  K+
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P42601 Putative membrane-bound redox modulator Alx3.8e-4242.22Show/hide
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        +A  F  GYL+E+SL+VDN+FV++++F YF VP   Q RVL YG+ GAI  R  +I  G+  + +F+ +  +  A LLF+  ++ A   ED+  + D  +
Subjt:  KASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV

Query:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL
        V+  +  + +T T D   F         ATPL+L + ++ELSD+ FAVDSIPA+F VT DPFIV +SN FAILGLR+++ L+A        L+  + V+L
Subjt:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL

Query:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV
         FIG KM++  F +H+P   SLG V
Subjt:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV

P96554 Uncharacterized membrane protein STKORF3194.6e-4842.53Show/hide
Query:  ALCVATAVAFGIGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLF
        AL V+ A+ FG GV  K G     +F  GYL+E+SLSVDN+FVFV+IF   ++P  YQ+RVL +GI  A+  R  +I  G A L RF  +  +    L+ 
Subjt:  ALCVATAVAFGIGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLF

Query:  SSFQLFASDEEDDGDLSDNFVVKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLF
        +  +LF    ++D    +  +++  ++ IP T  +DG+ F T       ATPLL+ + ++E SDI FA+DSIPA+F VT DPFIVF+SN FAILGLRS+F
Subjt:  SSFQLFASDEEDDGDLSDNFVVKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLF

Query:  ILVADGMSELEYLQPSIGVVLAFIGSKM-ILDFFGFHVPTEASLGFVAISLSTGVLLSLLK
         ++A  + +  YL+  +  VL F+G+KM I+DF    +P E SL  +A  L   ++ SL+K
Subjt:  ILVADGMSELEYLQPSIGVVLAFIGSKM-ILDFFGFHVPTEASLGFVAISLSTGVLLSLLK

Q8FDE1 Putative membrane-bound redox modulator Alx3.8e-4242.22Show/hide
Query:  KASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV
        +A  F  GYL+E+SL+VDN+FV++++F YF VP   Q RVL YG+ GAI  R  +I  G+  + +F+ +  +  A LLF+  ++ A   ED+  + D  +
Subjt:  KASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV

Query:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL
        V+  +  + +T T D   F         ATPL+L + ++ELSD+ FAVDSIPA+F VT DPFIV +SN FAILGLR+++ L+A        L+  + V+L
Subjt:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL

Query:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV
         FIG KM++  F +H+P   SLG V
Subjt:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV

Q8XAJ0 Putative membrane-bound redox modulator Alx3.8e-4242.22Show/hide
Query:  KASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV
        +A  F  GYL+E+SL+VDN+FV++++F YF VP   Q RVL YG+ GAI  R  +I  G+  + +F+ +  +  A LLF+  ++ A   ED+  + D  +
Subjt:  KASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV

Query:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL
        V+  +  + +T T D   F         ATPL+L + ++ELSD+ FAVDSIPA+F VT DPFIV +SN FAILGLR+++ L+A        L+  + V+L
Subjt:  VKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRDPFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVL

Query:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV
         FIG KM++  F +H+P   SLG V
Subjt:  AFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G12130.1 integral membrane TerC family protein1.1e-11662.47Show/hide
Query:  MTSIIHNGVQISSKLDSPWPKVSSH-PHFHPRTWIETVHNHV--PQFSSVILNCHPSPRPLVRCSSRIEREGD--------PSTAEANRTSSVRGT----
        + S+IH+G+   +K D  +  +    P F  R W ++  + +  P  +S   N   S  P + CS  I++E +        P   + N T+S   +    
Subjt:  MTSIIHNGVQISSKLDSPWPKVSSH-PHFHPRTWIETVHNHV--PQFSSVILNCHPSPRPLVRCSSRIEREGD--------PSTAEANRTSSVRGT----

Query:  -----IEGPESKVSSIRNVALCVATAVAFGIGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGT
              +  E+  +S + VALCV TAVAFGIG+GLK+GVGKASEFFAGY+LEQSLSVDNLFVFVL+FKYFKVP  YQN+VLTYGI+GAI FR T+ILLGT
Subjt:  -----IEGPESKVSSIRNVALCVATAVAFGIGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGT

Query:  ATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFVVKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRD
        ATLQ+FEAVNLLLAA+LL+SSF+LFAS EEDD DLSDNF+VKTCQ+ IPVT++YDGNRF T  +   +ATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRD
Subjt:  ATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFVVKTCQKLIPVTATYDGNRFLTGLEHFGQATPLLLTVAVIELSDIAFAVDSIPAVFGVTRD

Query:  PFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVLAFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFVAISLSTGVLLSLLKKA
        PFIV +SN FAILGLRSL+ L+++GM ELEYLQPSI VVL FIG KMILDFFGFH+ TEASLG VA+SLSTGVLLSL  K+
Subjt:  PFIVFSSNFFAILGLRSLFILVADGMSELEYLQPSIGVVLAFIGSKMILDFFGFHVPTEASLGFVAISLSTGVLLSLLKKA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTCAATCATCCACAACGGCGTTCAAATTTCTTCGAAGCTCGATTCTCCATGGCCTAAGGTTTCATCACACCCTCATTTTCATCCTCGAACATGGATCGAGACTGT
CCACAATCACGTTCCTCAATTTTCCTCAGTTATCCTCAACTGCCATCCTTCTCCGCGCCCTTTGGTTCGATGCTCCAGTCGAATCGAGAGGGAGGGCGATCCATCTACTG
CAGAAGCCAATAGGACGTCTTCCGTTCGAGGAACGATTGAGGGGCCTGAAAGTAAAGTTTCTTCTATTAGAAATGTTGCTCTATGTGTTGCTACTGCCGTGGCATTTGGT
ATTGGGGTGGGTTTGAAAGATGGAGTTGGCAAGGCATCTGAATTTTTTGCTGGGTATCTTCTGGAGCAAAGTTTGTCAGTTGACAATCTTTTTGTCTTTGTTTTGATTTT
CAAGTACTTTAAAGTGCCAACGGAGTATCAGAATCGGGTGCTTACTTATGGTATTTCTGGTGCAATTTTCTTTCGTCTAACAATCATACTTCTGGGAACAGCCACTCTGC
AGAGATTTGAGGCTGTGAACCTGCTTCTGGCTGCTATACTTCTATTCTCATCATTTCAGCTGTTTGCAAGTGATGAAGAGGATGACGGCGATCTATCAGACAACTTTGTA
GTAAAGACATGCCAAAAATTAATTCCTGTTACAGCAACCTATGATGGGAATCGATTTCTAACAGGTCTCGAACATTTTGGACAGGCAACACCTTTACTGCTCACCGTAGC
TGTAATTGAGCTCAGTGATATAGCATTTGCAGTTGATTCAATACCTGCCGTTTTTGGTGTTACAAGGGACCCTTTCATAGTGTTTTCGTCTAATTTTTTTGCCATTTTAG
GTTTGCGGTCCCTATTCATTCTTGTAGCTGATGGGATGTCAGAATTGGAGTACTTACAGCCTTCCATTGGCGTTGTTTTAGCATTTATTGGGAGCAAGATGATCCTTGAT
TTCTTCGGATTCCACGTTCCAACTGAGGCATCTCTTGGATTTGTCGCAATAAGTCTGAGCACTGGTGTCCTCTTGAGTCTGCTGAAGAAGGCTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAGTTCATTTATTATTTGATTGCTCTTTTTTTTTGTAAAACTATCCGGGAGACATGCTTTTGGGAAAAAGAAAATATTGTATAGAATCTTGTATTAGGATACAAATCTC
ATTTGGGTTTGCATTTTTGGTATCACGAATTGATTGAAGGTGGCTCGATGGTTTCTCCCGAGGAAATCACTTATGCTTTGAAGCGCACATACGGATACGATACTACGTAC
GTACCACATACTGCAAGAGACTGCTGACAAAACTGATTCGACATGTCGGCTTAATTGACCTCTTACGACGACAATTCAGCATCACGTTGAAGTTTAAACGAAACTCCAAA
GAACAAAAAAGTAGAGATAAGATATAGTGAGTCCTCAGTCTCCGCTATTCGAAGCGGTGGAAATGACTTCAATCATCCACAACGGCGTTCAAATTTCTTCGAAGCTCGAT
TCTCCATGGCCTAAGGTTTCATCACACCCTCATTTTCATCCTCGAACATGGATCGAGACTGTCCACAATCACGTTCCTCAATTTTCCTCAGTTATCCTCAACTGCCATCC
TTCTCCGCGCCCTTTGGTTCGATGCTCCAGTCGAATCGAGAGGGAGGGCGATCCATCTACTGCAGAAGCCAATAGGACGTCTTCCGTTCGAGGAACGATTGAGGGGCCTG
AAAGTAAAGTTTCTTCTATTAGAAATGTTGCTCTATGTGTTGCTACTGCCGTGGCATTTGGTATTGGGGTGGGTTTGAAAGATGGAGTTGGCAAGGCATCTGAATTTTTT
GCTGGGTATCTTCTGGAGCAAAGTTTGTCAGTTGACAATCTTTTTGTCTTTGTTTTGATTTTCAAGTACTTTAAAGTGCCAACGGAGTATCAGAATCGGGTGCTTACTTA
TGGTATTTCTGGTGCAATTTTCTTTCGTCTAACAATCATACTTCTGGGAACAGCCACTCTGCAGAGATTTGAGGCTGTGAACCTGCTTCTGGCTGCTATACTTCTATTCT
CATCATTTCAGCTGTTTGCAAGTGATGAAGAGGATGACGGCGATCTATCAGACAACTTTGTAGTAAAGACATGCCAAAAATTAATTCCTGTTACAGCAACCTATGATGGG
AATCGATTTCTAACAGGTCTCGAACATTTTGGACAGGCAACACCTTTACTGCTCACCGTAGCTGTAATTGAGCTCAGTGATATAGCATTTGCAGTTGATTCAATACCTGC
CGTTTTTGGTGTTACAAGGGACCCTTTCATAGTGTTTTCGTCTAATTTTTTTGCCATTTTAGGTTTGCGGTCCCTATTCATTCTTGTAGCTGATGGGATGTCAGAATTGG
AGTACTTACAGCCTTCCATTGGCGTTGTTTTAGCATTTATTGGGAGCAAGATGATCCTTGATTTCTTCGGATTCCACGTTCCAACTGAGGCATCTCTTGGATTTGTCGCA
ATAAGTCTGAGCACTGGTGTCCTCTTGAGTCTGCTGAAGAAGGCTGATTGATCACAAAAACAGAAATAGAGGGTGTTTGGCTTTAATTGAAGTAAGTTATTGCCTCTTCA
TTTTGGTAAAAAAGAAAAGGCCTAGATTCAAGCTTCTAATTGAAAAATTAACAATCGAAGTACCGTTTTAAGCTTCAGAATCGAAAACTTAGGTCTGTTTGGTAACCATT
TGACTTTTAGTTTTTGAAAAGTAATTCTATAGACACCCCTTATTTTTTTTTTTTTTATCAATGTTTTAGAAAACCAAAGCCATAATTTAAAAACTAATTTGAAAACTATG
ACTTGTTTGGTAATCATTTCATTTTTCATTTTTTTAAAACTAAAGCCTATATTTCCTCAGTTTCTTGTCCATGTTTTTCCTTTTTCATAAGTATAAGAGTCGAATTCTTA
GTTAAAATCTAAAAACAAAAATAAGCTTTTAAAACATAGTTTTCTTAATTTTCAAATTTTAGTCTGGTTTTTTAAAAAATATGTCGAAAGTACCTGACGAAACGAGAAAC
TTAGGGGTGGAAGGAGTGTTTGTAAGCTTAAAACTAAAAACCAAAAATCAAGGGTACAAAACGGGGCCTATAAAGTTAGTTGTTAAAACATTTTTCTTTTCTTTGAATTT
GGTGTATTTAACTCTTATATTCAAGCCTCAAGATACGAGGAAGGGAGGCGTAGAAATCATATGCAAACCATAGTAAGAACATTTGAGGAAACAGGGTTAACTTTTCGGAA
CTCAACCGCTCTTGAATGTGAATTGGTAGAGTAGGGAGGCAGAGAAATTTGAAAGTGAAATTTCCGATTCTCTCATCCTCAAAAGGTGGGAGTTAAAATAAACTAGAATA
AAATTTAAAGCAAGGGTCCATAATTAGGTTCTTTCTAATTAGTTTTGCTGGACAGTAATTGACATGACCCACCATCTAGAGATAGAAAGTCTGATCTCTTATCTCAACTA
ATGTCCTTTCTTTTAAATGTTAGAATTTTCCTACTTTCTAATCGTTACAGAATTGTTTGTTTAAAATTGTCATGTAACTATTGACTGGAGCCACGGTTGTACTCGGGAAG
AAAAAGGATGATAGAACCGTTGTGCTGTCTACAAATCGTGGAGGTTAGAAGAACCATTCTTTTAACAGCTCGTTGGTTGTTGTGCTGAGATGACGAATTTATTCTCGTTG
TTATTTTGTTCTTTTCAAGTAATTCCAAATCTCTCTCAGAACCTTTCTGTTGTAGATAAATGATTAGTAGCTCTAAATCTCTGCTTTTCAACATTACATTCTTATGTCAA
AGGTGAGTTATTGTCGTTCCTTTCTGCTACCCCCACCCCACTTCTCCCCCAAAAAATATACATATACTGGTTCTTGATATTTGAAATTAATGTTTATTTGATTCATGAGG
TTTCAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSIIHNGVQISSKLDSPWPKVSSHPHFHPRTWIETVHNHVPQFSSVILNCHPSPRPLVRCSSRIEREGDPSTAEANRTSSVRGTIEGPESKVSSIRNVALCVATAVAFG
IGVGLKDGVGKASEFFAGYLLEQSLSVDNLFVFVLIFKYFKVPTEYQNRVLTYGISGAIFFRLTIILLGTATLQRFEAVNLLLAAILLFSSFQLFASDEEDDGDLSDNFV
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FFGFHVPTEASLGFVAISLSTGVLLSLLKKAD