; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C003401 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C003401
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN-like
Genome locationchr04:833873..834864
RNA-Seq ExpressionMELO3C003401
SyntenyMELO3C003401
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148508.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucumis sativus]6.2e-13796.92Show/hide
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XP_008465962.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]2.9e-142100Show/hide
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XP_022159587.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Momordica charantia]2.0e-7467.74Show/hide
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        QAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +   P+TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST   + FP ND++HR  
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             T+  + SMEN N     + LDLELRLGHGP ++T  L+ KG +
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XP_022967174.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita maxima]3.2e-7267.76Show/hide
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         HQAP   SNP KPSS+SSS SNSFIIP PDFNGGG LCLLYQFPNPNSINGGIN              SLFSM +HSFN++  ST++S  FP+ND+   
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         L  S +S S +  + S +  ++ LDLELRLGHG P STQN   K
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XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]3.2e-10982.59Show/hide
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        MAAEL LGFQY SSLPHL+E TRDGQNPN +NPMQ PDVVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL H
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        QAP SSSNPMKP   SSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINT PSTLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+ PSSTSLS AFP+ND++  R
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        LETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHGPPSSTQ LMEKG+ K+SN EAACL+KRSSD
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein3.0e-13796.92Show/hide
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-142100Show/hide
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like1.4e-142100Show/hide
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A0A6J1E087 transcriptional regulator SUPERMAN-like9.6e-7567.74Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++    G+N  G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL H
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        QAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +   P+TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST   + FP ND++HR  
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             T+  + SMEN N     + LDLELRLGHGP ++T  L+ KG +
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A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN1.5e-7267.76Show/hide
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        MA +L LGFQ+SSSLP   ET R+G N NG+NPMQTPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL
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         HQAP   SNP KPSS+SSS SNSFIIP PDFNGGG LCLLYQFPNPNSINGGIN              SLFSM +HSFN++  ST++S  FP+ND+   
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         L  S +S S +  + S +  ++ LDLELRLGHG P STQN   K
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 101.6e-1858.06Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL      +  P SSS+P  PS   S N +     T  FN
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN1.1e-1436.11Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL   Q+PSSSS P  P    + + ++     P  +   +L      P+      G+
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          S S  + +          P ++  T  SS  + A     F   D           S  +E    +  ++ LDLELRLG
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.4e-1134.48Show/hide
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        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL  Q+       + PSST  +            + G  + +  +   P
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Query:  NSINGGINTSPSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSAAFPM--------NDNNHRRLETSTYSASM--------ENNNGSSQDEVLDLELRLGH
        N     I  S    N  + S    +   +    T  S   LS  F          + ++ +R +T      M           NG    E LDLELRLG 
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Query:  GPP
         PP
Subjt:  GPP

Q9SLB8 Zinc finger protein 118.2e-1555.41Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L          HH  P ++ NP   SS+SSS + + + P+
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC19.1e-0649.02Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSS
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L  +    + + +   S +S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 101.1e-1958.06Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL      +  P SSS+P  PS   S N +     T  FN
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AT2G42410.1 zinc finger protein 115.8e-1655.41Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L          HH  P ++ NP   SS+SSS + + + P+
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein7.6e-1636.11Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH-HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGI
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL   Q+PSSSS P  P    + + ++     P  +   +L      P+      G+
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Query:  NTSPSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSAA----FPMNDNNHRRLETSTYSASMENNNGSSQDEVLDLELRLG
          S S  + +          P ++  T  SS  + A     F   D           S  +E    +  ++ LDLELRLG
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein3.6e-2642.27Show/hide
Query:  NPNGVNPMQTPDVVVDDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHH------QAPSSSSNPMKPSSTSS
        NPN +  ++      DDD+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R H        A S     +  S    
Subjt:  NPNGVNPMQTPDVVVDDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHH------QAPSSSSNPMKPSSTSS

Query:  SNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSPSTLNAYIHSPSSL-FSMPHHSFNTYPSSTSLSAAFPMNDNNHRRLETSTYS----ASMENN
          + + II +   N  G L   YQ  NP+ I G      +        PS+L FSM +      P                R +E ST       SM+  
Subjt:  SNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSPSTLNAYIHSPSSL-FSMPHHSFNTYPSSTSLSAAFPMNDNNHRRLETSTYS----ASMENN

Query:  NGSSQDEVLDLELRLGHGPP
         G+S DE LDLELRLGH PP
Subjt:  NGSSQDEVLDLELRLGHGPP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.0e-1234.48Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL  Q+       + PSST  +            + G  + +  +   P
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP

Query:  NSINGGINTSPSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSAAFPM--------NDNNHRRLETSTYSASM--------ENNNGSSQDEVLDLELRLGH
        N     I  S    N  + S    +   +    T  S   LS  F          + ++ +R +T      M           NG    E LDLELRLG 
Subjt:  NSINGGINTSPSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSAAFPM--------NDNNHRRLETSTYSASM--------ENNNGSSQDEVLDLELRLGH

Query:  GPP
         PP
Subjt:  GPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTGAGCTTGTGCTTGGATTCCAATACTCTTCTTCTTTGCCTCATCTTTCCGAAACAACTCGAGACGGGCAGAATCCAAACGGTGTAAACCCTATGCAAACGCC
TGATGTTGTTGTTGATGACGATGACTCATGGGAAGTCCGAGCTTTCGCCGAGGACACGGCTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATT
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CTTTCCGAAACAACTCGAGACGGGCAGAATCCAAACGGTGTAAACCCTATGCAAACGCCTGATGTTGTTGTTGATGACGATGACTCATGGGAAGTCCGAGCTTTCGCCGA
GGACACGGCTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATTGTAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCTCAAGCCCTAGGCGGTCATATGAACGTTC
ACCGTCGTGACCGTGCTCGCCTCCACCACCAAGCTCCGTCTTCGTCATCGAATCCCATGAAACCCTCTTCCACTTCTTCCTCTAATTCCAATTCTTTCATCATCCCAACT
CCTGATTTTAATGGTGGAGGAAGCTTGTGCCTTCTTTACCAATTCCCAAACCCTAATAGTATTAATGGTGGAATCAATACCTCTCCTTCCACATTAAATGCTTACATTCA
CTCACCCTCTTCTCTTTTCTCCATGCCACATCATTCCTTCAACACCTACCCGTCCTCAACCTCGTTGTCCGCGGCTTTTCCGATGAACGACAACAACCACCGTCGTCTCG
AAACAAGTACTTACTCGGCCTCCATGGAAAATAATAACGGTAGCAGCCAAGACGAAGTACTTGATCTAGAGCTTAGACTTGGACATGGTCCACCTTCTTCAACTCAAAAT
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GA
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LDLELRLGHGPPSSTQNLMEKGEKKVSNSEAACLKKRSSD