; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C004524 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C004524
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationchr05:27986346..27988221
RNA-Seq ExpressionMELO3C004524
SyntenyMELO3C004524
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599412.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.6e-17886.8Show/hide
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KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-17886.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein5.0e-19995.51Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like9.7e-20397.47Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like9.7e-20397.47Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like6.3e-17887.08Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like5.0e-17585.67Show/hide
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Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 288.9e-2032.87Show/hide
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        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        W
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        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SE+ T      E E +      L   + G+V T    V P + +   SS++T         P G    +  KWK
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        GP KI+R+Y DW+DD+
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 311.7e-1033.33Show/hide
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         C FGDKCHFAHG+ E+
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 561.4e-4434.22Show/hide
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        N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    +CNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+       +    +                         K + C
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        +KFY  E CPYGD C FLH       D+  + RES AIS+    +P + G         + A + S S A       +PS WKT++C KWE+TG+CPFG 
Subjt:  RKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGD

Query:  KCHFAHGQSEM------LTDTNESEL-------QLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD
        KCHFAHG +E+      L D +  +        Q  +  +    TAA +   L  A      +       +    GQ +  + KWKGP KI+RIY DW+D
Subjt:  KCHFAHGQSEM------LTDTNESEL-------QLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLD

Query:  D
        +
Subjt:  D

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 123.0e-4433.07Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---D
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +E+      
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---D

Query:  TNESELQLYIGREGEVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
          E E +  +    +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  TNESELQLYIGREGEVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 391.2e-7749.28Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLTDTNESELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTT
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ         +EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T 
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLTDTNESELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTT

Query:  SVLPSSAL-PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
            SS L  EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  SVLPSSAL-PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein2.2e-4533.07Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---D
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +E+      
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---D

Query:  TNESELQLYIGREGEVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL
          E E +  +    +      N K L          V   A +S  T V    A      KP +    KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  TNESELQLYIGREGEVSTAALNVKPLI---------VAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSL---LKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G66810.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein9.8e-0631.31Show/hide
Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEM
        R++  R     +IS+ + G   +N    +S ++ S+ +S SVS +     ++  G          R    KT+LC KW+ TG C +GD C FAHG  E+
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEM

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein2.2e-0526.17Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R    + +                       K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein6.3e-2132.87Show/hide
Query:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW
        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        W
Subjt:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW

Query:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---DTNESELQ------LYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK
        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SE+ T      E E +      L   + G+V T    V P + +   SS++T         P G    +  KWK
Subjt:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLT---DTNESELQ------LYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWK

Query:  GPKKINRIYADWLDDL
        GP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  GPKKINRIYADWLDDL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein8.7e-7949.28Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLTDTNESELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTT
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ         +EL   +GR EGE   + A++N + ++ A E  A   +T 
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLTDTNESELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAME--ASSSLTT

Query:  SVLPSSAL-PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME
            SS L  EG+ K  LLKW   KKINRIY DW+DDLP+   ST  +E
Subjt:  SVLPSSAL-PEGQAKPSLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTA
GGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATT
CTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGT
TCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGATGCTGACTGATACTAATGAATCAGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTAAATGTAAAGC
CTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGACAACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTTACCGGAGGGCCAGGCAAAGCCAAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCC
AAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGATTGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAAGCAAAATGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTGTTTCCGTCTTTTGACTAACTCGCCTACAAAAATTCCCTTGTGTCGATTCAGAAGATTCCATGGTTTTGGCCTTCCTCAATCCTCCGATTTTCATTAGGGTTTTC
GTTTCTCCTTGGCGGCTAGGGTTTTGATTCTTCATTCACTTTGTTGTTTTTCTTTTCGACCTCTTCATTATAAATATATAACTACAACTCTTTCACTTTCGCCATTGTTT
TGATTCCTTCTTCCATTGATCTTCATTCCGCTGTTTTCTTTTTATTGATATTTCAAAAAACCTTTTGTTTATTTATCCAAACTCAACTTTAATTTGCCTACTTTTCTTGT
TTTCTTGTTTTCTTGTTTTCTTTTTCTTCTTGCCAATTGTTGGTATAAGGGAGGATGATCACGTCGATTGATTGAAATTTCTATTGGGTGGATTCGTTGTTCGTTGTTGA
TTCATTGTTTTGATTGATTAAAGAGAACTGGGTTTTGTTTTAGAAGATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATG
GCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATTTGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAA
AACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTAGGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGAT
GTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGTAACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTA
TAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAAGATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGAT
AGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATTCTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGG
AAGTGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGTTCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTAT
GCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGATGCTGACTGATACTAATGAATCAGAGTTACAACTATAT
ATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTAAATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGACAACCAGTGTACTTCCATCCTCTGCCTT
ACCGGAGGGCCAGGCAAAGCCAAGTTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGATAAATCGGATCTATGCCGATTGGCTCGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAACAA
GCAAAATGGAGGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRGSVIPPPLHSYGSNGDASGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSC
SVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSEMLTDTNESELQLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEASSSLTTSVLPSSALPEGQAKPSLLKWKGP
KKINRIYADWLDDLPLSPSSTSKMEG