; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C004567 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C004567
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptioncyclin-dependent kinase F-1
Genome locationchr05:28364071..28367062
RNA-Seq ExpressionMELO3C004567
SyntenyMELO3C004567
Gene Ontology termsGO:0010078 - maintenance of root meristem identity (biological process)
GO:1904031 - positive regulation of cyclin-dependent protein kinase activity (biological process)
GO:0016592 - mediator complex (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
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GO:0019912 - cyclin-dependent protein kinase activating kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000719 - Protein kinase domain
IPR011009 - Protein kinase-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1KFI2 cyclin-dependent kinase F-17.0e-15788.67Show/hide
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A2YCH5 Cyclin-dependent kinase F-11.1e-8253.16Show/hide
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O80345 Cyclin-dependent kinase F-19.5e-9556.27Show/hide
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P51952 Cyclin-dependent kinase 7 (Fragment)4.1e-2940.51Show/hide
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Q03147 Cyclin-dependent kinase 72.4e-2942.07Show/hide
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Q5Z754 Cyclin-dependent kinase F-11.1e-8253.16Show/hide
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Query:  GGVPADDGHGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKP
         G+  ++  G+ TSCVGTRWFRAPELLYGST+YG E+DLWSLGCI AEL  LEP+FPGT+DIDQ+ RI + LGN+TEE++PGCS LPD+  I FN +EKP
Subjt:  GGVPADDGHGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKP

Query:  IGLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDY--NESDSDMDEIGPMNVTTNATGYSIQ
        IGLEACL + S+ E+SI+KRLLCY+P  RA+A +LL D YF +EPLPVP+  L VP +K  +D+DS   W ++   +SDSD DE G M+VT    G+SI+
Subjt:  IGLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDY--NESDSDMDEIGPMNVTTNATGYSIQ

Query:  F
        F
Subjt:  F

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18040.1 cyclin-dependent kinase D1;38.7e-2736.25Show/hide
Query:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLTNCSS
        T  V  RW+RAPELL+G+  YG  +D+W++ CIFAELL   P   G +DIDQ+S+IFA  G    + WP  ++LPD+  + +  +  P  L +     S 
Subjt:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLTNCSS

Query:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYD
        D + ++ ++  Y+P  R +  + L+ +YFT  P P   ++L  P  K  QD  S  G ++
Subjt:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYD

AT1G66750.1 CDK-activating kinase 49.6e-2632.07Show/hide
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        T  V   W+RAPELL+GS  YG  +D+W+ GCIFAELL   P  PG+ +IDQ+ +IF   G      W     LPD+   S+ T   P  L       S 
Subjt:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLTNCSS

Query:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNESDSDMDEIGPMNVTTNATGYS
        D + ++ ++  Y+P  R T  + L  +YF+  P P    +L +P++K    E   +    +  S + +   G M       G++
Subjt:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNESDSDMDEIGPMNVTTNATGYS

AT1G73690.1 cyclin-dependent kinase D1;15.7e-2637.66Show/hide
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        T  V  RW+RAPELL+G+  Y   +D+W+ GCIFAELL   P   G +DIDQ+S+IFA  G    + WP    LPD+  + +  +  P  L + L   S 
Subjt:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLTNCSS

Query:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDS
        D + ++ ++  Y+P +R +  + L+ +YFT  P P     L +P   S QD  S
Subjt:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDS

AT4G28980.1 CDK-activating kinase 1AT6.8e-9656.27Show/hide
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        M  D V S+E  Q  ++   D   +S+P  V+P  E+S R+G+  +E+E +SK+EYFR ++ELKAK    ++ DK++  +DGD SCLATCT S+++DD  
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Query:  KGSSYSYEMEGGVPADDGHGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQ
          +S+SY+ +  V  DD  G +TSCVGTRWFR PELLYGST YGLE+DLWSLGC+FAELL+LEPLFPG +DIDQ+SR+   LGNL EE WPGC +LPD++
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Query:  IISFNTIEKPIGLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNE--SDSDMDEIGPMNV
         ISF  +E P+G+E CL N S D IS++K+L+CY+PA+RAT ME+L DKY ++EPLPVP+SEL+VP T SG DEDSP  W DY E  SDSD D  GPMNV
Subjt:  IISFNTIEKPIGLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNE--SDSDMDEIGPMNV

Query:  TTNATGYSIQF
           ++G++I+F
Subjt:  TTNATGYSIQF

AT4G28980.2 CDK-activating kinase 1AT6.8e-9656.27Show/hide
Query:  MGPDYVESNEISQPCEINSSDQVPSSQPSAVLPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA-NEFDKETCTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPF
        M  D V S+E  Q  ++   D   +S+P  V+P  E+S R+G+  +E+E +SK+EYFR ++ELKAK    ++ DK++  +DGD SCLATCT S+++DD  
Subjt:  MGPDYVESNEISQPCEINSSDQVPSSQPSAVLPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA-NEFDKETCTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPF

Query:  KGSSYSYEMEGGVPADDGHGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWSLGCIFAELLTLEPLFPGTADIDQMSRIFATLGNLTEESWPGCSELPDFQ
          +S+SY+ +  V  DD  G +TSCVGTRWFR PELLYGST YGLE+DLWSLGC+FAELL+LEPLFPG +DIDQ+SR+   LGNL EE WPGC +LPD++
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Query:  IISFNTIEKPIGLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNE--SDSDMDEIGPMNV
         ISF  +E P+G+E CL N S D IS++K+L+CY+PA+RAT ME+L DKY ++EPLPVP+SEL+VP T SG DEDSP  W DY E  SDSD D  GPMNV
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Query:  TTNATGYSIQF
           ++G++I+F
Subjt:  TTNATGYSIQF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCCTGATTATGTTGAATCGAATGAGATCTCTCAACCATGTGAGATCAACTCTTCAGATCAAGTACCTTCTTCTCAACCATCTGCAGTTCTTCCCGGAACA
GAAAGCTCGGTTCGAGAGGGTAATAGAACTGAAGAGCAAGAGCCAATTAGCAAAGAGGAATATTTTAGAGTTTTAGATGAGTTGAAAGCAAAAAATTCAGCAAAT
GAATTTGACAAAGAAACATGTACTTATGATGGAGATACTTCTTGCTTAGCAACATGTACCACAAGTGATCTTGAAGATGATCCATTTAAAGGTTCATCATATTCT
TATGAAATGGAAGGGGGAGTTCCAGCAGATGATGGACATGGTTCTCTCACTTCATGTGTCGGTACTCGCTGGTTCAGAGCCCCTGAATTACTCTATGGCTCTACA
AGCTACGGTTTGGAGATCGATTTGTGGTCATTGGGCTGTATTTTTGCAGAACTTTTAACATTGGAACCCCTTTTTCCAGGAACTGCTGATATAGATCAAATGAGC
AGAATTTTTGCTACTCTAGGCAACTTGACTGAAGAGTCGTGGCCAGGTTGTTCCGAACTTCCTGATTTTCAGATTATTTCATTCAACACAATCGAAAAGCCAATT
GGTTTAGAAGCATGTCTTACCAACTGTTCTTCTGATGAAATTTCTATTGTTAAAAGACTTCTTTGTTACAACCCGGCTAATCGAGCGACTGCTATGGAGTTGCTA
CAAGATAAGTATTTCACCAAGGAGCCACTTCCTGTTCCCTTGTCCGAGCTTCACGTTCCTTCGACCAAAAGTGGGCAGGACGAGGATTCTCCTGCAGGATGGTAC
GACTACAACGAGTCAGATTCTGATATGGATGAAATCGGCCCGATGAATGTTACCACCAATGCCACTGGTTACTCCATACAATTTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAAAATATTAAAATTAAAAAAATTGAAGTGTATTTTTTTAACCTATAAAATAATATCGGCGGCATTGGCAATTGGCATCGTTGGTTCACCGACCGGCGACTAG
TCCTTTTCACCGTCCGGCGAAAATTAACTGTAAACTGTAAAGGAATTTCCATAACCCCTATCTTCAAAAACCCTAGAACGCACACAATCTCCAAATCCTTCGCAA
ATGGAACCTTCATCGGCCAAGAGCTGGAGCATCCACTCTCGGCCAGACATCATCCACAAGTACGAGATCCTCGAGCGCGTCGGATCCGGCGCTTATTCCGATGTC
TACCGTGCACGGCGGCTCTCCGATGGTGTCATCGTCGCCTTGAAGGAGATCCACGATTATCAGTCGGCGTTCCGCGAAATCGAGGCTCTTCAAATCCTTCAAGGT
TCGCCTAATATCGTCGTTTTGCACGAGTACTTTTGGCGGGAGGATGAGGATGCCGTGCTTGTTCTCGAGTTTATGAGAACGGATTTGGCCACCGTTATAGCAGAG
GCAAAGAAGCGAGGATCGGATGGTGTAGAATCTGGGCGTGGGCTTGCGGTGGGGGAGTTGAAGCGATGGATGATCCAGATTCTGAGTGGTCTTGATGCTTGTCAT
AGGAACATGATCGTGCATAGGGATTTGAAACCTAGCAATTTGTTGATCTCTGATGATGGCATGCTCAAGCTTGCCGATTTTGGACAGGAGTCCCTCGATATTGGT
TTCAGTGTTCCTAAAAGAATGAGTTTGATGTTGGTTTCAGGCAAGGATACTCATGGGGCCTGATTATGTTGAATCGAATGAGATCTCTCAACCATGTGAGATCAA
CTCTTCAGATCAAGTACCTTCTTCTCAACCATCTGCAGTTCTTCCCGGAACAGAAAGCTCGGTTCGAGAGGGTAATAGAACTGAAGAGCAAGAGCCAATTAGCAA
AGAGGAATATTTTAGAGTTTTAGATGAGTTGAAAGCAAAAAATTCAGCAAATGAATTTGACAAAGAAACATGTACTTATGATGGAGATACTTCTTGCTTAGCAAC
ATGTACCACAAGTGATCTTGAAGATGATCCATTTAAAGGTTCATCATATTCTTATGAAATGGAAGGGGGAGTTCCAGCAGATGATGGACATGGTTCTCTCACTTC
ATGTGTCGGTACTCGCTGGTTCAGAGCCCCTGAATTACTCTATGGCTCTACAAGCTACGGTTTGGAGATCGATTTGTGGTCATTGGGCTGTATTTTTGCAGAACT
TTTAACATTGGAACCCCTTTTTCCAGGAACTGCTGATATAGATCAAATGAGCAGAATTTTTGCTACTCTAGGCAACTTGACTGAAGAGTCGTGGCCAGGTTGTTC
CGAACTTCCTGATTTTCAGATTATTTCATTCAACACAATCGAAAAGCCAATTGGTTTAGAAGCATGTCTTACCAACTGTTCTTCTGATGAAATTTCTATTGTTAA
AAGACTTCTTTGTTACAACCCGGCTAATCGAGCGACTGCTATGGAGTTGCTACAAGATAAGTATTTCACCAAGGAGCCACTTCCTGTTCCCTTGTCCGAGCTTCA
CGTTCCTTCGACCAAAAGTGGGCAGGACGAGGATTCTCCTGCAGGATGGTACGACTACAACGAGTCAGATTCTGATATGGATGAAATCGGCCCGATGAATGTTAC
CACCAATGCCACTGGTTACTCCATACAATTTGATTGAGCCACAGTGATTCAGGTATTCCTTAATATTTGAAACTATACTTTGTTTCGGTTAGTCCTCATTGCTTG
TAAGGAAAAGCTTCCTTGGTAAATGTTGCATTGTGATCAAGCCATATCTTATCCTACAATGCCATTATCGCTCCCCATACTTGATCTACCAAAAATGTCGGGCCG
GTCATTCCGATACCTTTCTTGAAGAATGTTGTATCTGAATCCCAATTAGGCTATTTATTATCCTACGATACCATAATCCCTCTTCAGTCTTCCTACTTAAAACAC
CAAAAGCTTGGAGAACTCAGATGTCGGAATAGTCATCCCGACGTCCTTCTTGAAGGATGTCTTGTCTGTTAATGTAATTTGTGTATAATTGCACAAACAAAGATG
TGAGTTTGCTCCCCTCCCTTTCTTTTCAAGGACCTCAAGTTTTTGTGTCTGCCAAACTGGCTGCCCACGACTGTGGCTCCTTGTCTTGTGTTTATGTTTATGCTT
TTTCTTGAAAATTGACATATTTTCAAGTTTTTGCTCTATTGTTATTGTTCCTTTCTCCTTATTATCAGGTTGAGAGGGTAAGATAATAGCTTAATTATATGTATG
AATCTTGCCCTTCATGTTTTCTTACGTGATCAATCCGTGTAACTTCCGTTTTTACTTCTCAACAAGTACGACAAGTAAACGTGGCAGGATTAGAGGGTTGTCTTG
ATAGATTGGTCGAAATTTTCACAAGTAAAAGAAGCTTTTTGCTTGCACGTTAGATTGTTGGAGTTGTACACTGAGTGAATAAATTGAGCTCGTTGATTATGTAAA
CTTTCTTATTTTTATCGTGTAACTAATAAACTTTATATGAATTCATAACGGTGGTTAGAGAATCTTTCTTTTGAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGPDYVESNEISQPCEINSSDQVPSSQPSAVLPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSANEFDKETCTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYS
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GLEACLTNCSSDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTKEPLPVPLSELHVPSTKSGQDEDSPAGWYDYNESDSDMDEIGPMNVTTNATGYSIQFD