; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C005373 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C005373
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionF-box protein PP2-A13-like
Genome locationchr09:19729634..19731007
RNA-Seq ExpressionMELO3C005373
SyntenyMELO3C005373
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KL73 F-box domain-containing protein5.8e-6991.84Show/hide
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A0A1S3CUB8 LOW QUALITY PROTEIN: F-box protein PP2-A146.9e-78100Show/hide
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A0A6J1DZW7 F-box protein PP2-A13-like4.7e-4265.31Show/hide
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A0A6J1H031 F-box protein PP2-A13-like5.3e-4664.9Show/hide
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A0A6J1K1Y6 F-box protein PP2-A13-like2.6e-4565.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAN4 F-box protein PP2-A114.8e-2842.67Show/hide
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Q9FJ80 F-box protein PP2-A141.6e-3953.59Show/hide
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Q9LEX0 F-box protein PP2-A131.9e-4060Show/hide
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Q9LF92 F-box protein PP2-A152.0e-3455.2Show/hide
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        S++ + ITGI+DRRYWN+IPT+ESR
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Q9LN77 F-box protein PP2-A121.1e-2945.86Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12710.1 phloem protein 2-A128.1e-3145.86Show/hide
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AT3G53000.1 phloem protein 2-A151.4e-3555.2Show/hide
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AT3G61060.1 phloem protein 2-A131.3e-4160Show/hide
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AT3G61060.2 phloem protein 2-A133.3e-4059.52Show/hide
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AT5G52120.1 phloem protein 2-A141.1e-4053.59Show/hide
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         L RP+LFD  TKE WLDK+SG+ F++IS KA+KITGIDDRRYW +I +DESR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGCTTCCTTTGCCAAGGTCTCCACCAATCTCCCACCTTCATCGTCTTCTACCTCTTCTCCTCTAGAAGACATCCCCGAAAATTGTATTTCCATTGTCTTCATGTA
CTTGGACCCTCCCGAGATCTGCAATCTTGCTTCTCTTAACCATGCCTTTCGCTCATCTTCTTCCGCCGATTTCGTTTGGGAATCCAAACTCCCTTCTAATTATATCTTCT
TGCTTCATCGAGTTCTTCAACTTCAACAATTGACCGCCCACCCTAAGAAGGAGATCTTCGCTACGCTTACTCGCCCATCTCTATTCGATCACGCCACTAAGGAGTTTTGG
TTGGATAAAAAATCTGGGGAAAATTTCATTTCGATTTCATCTAAGGCTTTGAAGATTACTGGGATTGATGATAGAAGATATTGGAATTATATTCCAACTGATGAATCAAG
ATGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAGAAAAAAAGCATTGCCCATTATTGTTCATCATCTCTCCCTCTTAATTTCTCTCTACACCATTTACAAATACACAAACACACCCCTTCTAATTAATTAAATCCCTC
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TAAGGAGTTTTGGTTGGATAAAAAATCTGGGGAAAATTTCATTTCGATTTCATCTAAGGCTTTGAAGATTACTGGGATTGATGATAGAAGATATTGGAATTATATTCCAA
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TTTTTTTGTTCTTATATTTTAAATTTTATTGAATTTTGGACCACATATTTTAATTAGATATATTATTTTAGGTAATGAAAAATTAAAAAATATAATAAAATATCACAATG
GGAGGGACCAACAAATTATTATCTTGTAAATATTTTATCCATTTTGAAATAGCCATTTTTTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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