; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C005384 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C005384
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionDNA polymerase delta subunit 4
Genome locationchr09:19844252..19846246
RNA-Seq ExpressionMELO3C005384
SyntenyMELO3C005384
Gene Ontology termsGO:0000731 - DNA synthesis involved in DNA repair (biological process)
GO:0006261 - DNA-dependent DNA replication (biological process)
GO:0043625 - delta DNA polymerase complex (cellular component)
GO:0003887 - DNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007218 - DNA polymerase delta, subunit 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605696.1 DNA polymerase delta subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-4780.8Show/hide
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XP_022957680.1 uncharacterized protein LOC111459143 [Cucurbita moschata]1.6e-4780.8Show/hide
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XP_038875328.1 DNA polymerase delta subunit 4 [Benincasa hispida]1.1e-5490.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KND6 Uncharacterized protein1.2e-5996.8Show/hide
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A0A1S3CT23 DNA polymerase delta subunit 41.9e-62100Show/hide
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A0A5A7UNL0 DNA polymerase delta subunit 41.9e-62100Show/hide
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A0A6J1H180 uncharacterized protein LOC1114591437.9e-4880.8Show/hide
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A0A6J1K4T3 uncharacterized protein LOC1114911821.9e-4679.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59835 DNA polymerase delta subunit 41.9e-0653.49Show/hide
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        E +L  FD    YGP LGMTRM RW+RA +  LNPP+ +G +L
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Q3T0X9 DNA polymerase delta subunit 41.7e-0739.29Show/hide
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        S G +  + A  +    L L  D  E E +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +L++  G  + +C LW
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Q9CWP8 DNA polymerase delta subunit 42.2e-0753.49Show/hide
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Q9HCU8 DNA polymerase delta subunit 41.3e-0742.19Show/hide
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        +D+      +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +LK   G  + +C LW
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09815.1 polymerase delta 48.1e-3760.8Show/hide
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        MA+T   LK FYKQ KS+       SKPSSRK  +P ++A+ GS+  QPAAL+SHGS+DL +DY + E MLRQFDMN+ YGPCLGMTR+ RWERA  LG+
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        NPP +I  LLK GKVQ +CLW  RV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGGCCACATCGAATTAGACCTCCAAAAGCAACACCAAGAACAAATTTGAAATTTGAAATTCCGAACTCGATCGATCGCAGAGAAGGAGCAAAATCAAAGATGGCGTCAAC
GCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAAGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGCCAACTCTGCAT
CTTTGGGCTCCAATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGAGTCTGAGAATATGCTGAGGCAATTTGATATGAAC
ATGGCATATGGACCATGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTCTTAAAGGCTGGAAA
AGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGGCCACATCGAATTAGACCTCCAAAAGCAACACCAAGAACAAATTTGAAATTTGAAATTCCGAACTCGATCGATCGCAGAGAAGGAGCAAAATCAAAGATGGCGTCA
ACGCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAAGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGCCAACTCTGC
ATCTTTGGGCTCCAATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGAGTCTGAGAATATGCTGAGGCAATTTGATATGA
ACATGGCATATGGACCATGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTCTTAAAGGCTGGA
AAAGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAGTTTAAACTTCTAAGCTTGGTGTGTTATTTTTGTTTAATGTATGAAGTGTACGCTGTGCTTATGCTTTTGGACAAAA
TGGTTCAGCCCCTAGCTGAAACGATGATCACTTTTCCTGTGATATGAATGGGCTTAGAATGTTTGCTGATGACAGCTCCCTTAGTTATTTACTTCTTACTTATGTTGAAA
ACTTATAACAAGTAGTTGTATAGTTAAATTTGGTGATATTTTCCTTTCCTAGTGTTACACTTGAACTTGATATGATGTGTGAATCCGTGACTCAAGACACCTTTCGATTC
CCACTAATTGAAGAGGAAGGGATATTTGTGTACATAGTAGCATTTCAAATTTTTGTCAATGTGATAATGGGTGGGATTCCCAAATTTTTGTCAAAGATTTATTGCAGACA
TTGCGAGATTGTTAATAAGTGAAAGAGTTGAGTTGTGAAACTGATTGAAAATGGAATCTCATTTTTGCTTTTTTGAAAGTGTAGAAGGCAGAGATTGTAGAGGGGAGGGA
TAATACTCAGAACTAACTGAATTTAACAGGAAGGACGAGGTTTAAATACTATTTGATCGTTGCACTTTTAGTTTTGGTTCATTTTTTCATGCAATTGTAACACTGGAAGT
TTGTGAAGGATTTTAGCAGTAAGTGGTGAGGTCAATGAGAAATGGAAGCTTTTAGTTTTGTTGAGTCCGTCCTTTCAAATATGGAGTTCGTTATTAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
RPHRIRPPKATPRTNLKFEIPNSIDRREGAKSKMASTRGGLKDFYKQRKSSGISKAKASKPSSRKTKSPANSASLGSNAVQPAALVSHGSLDLQDDYGESENMLRQFDMN
MAYGPCLGMTRMARWERACSLGLNPPKDIGTLLKAGKVQLECLWDSRV