; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C005391 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C005391
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionYcf20-like protein isoform X1
Genome locationchr09:19898254..19901165
RNA-Seq ExpressionMELO3C005391
SyntenyMELO3C005391
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007572 - Uncharacterised protein family Ycf20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6579671.1 hypothetical protein SDJN03_24119, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-5589.06Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQS SLV TGLLNY F+ + N+SYWRYDM+KSRPS PRS  +KAVQDTGGPRRLVDIIRLVPE+SRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
XP_004143642.1 uncharacterized protein ycf20 [Cucumis sativus]3.2e-6196.09Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQS SLVHT LLNYGF+ KMN SYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
XP_008467245.1 PREDICTED: uncharacterized protein ycf20 isoform X1 [Cucumis melo]3.1e-64100Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
XP_008467247.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504644 isoform X2 [Cucumis melo]1.4e-77100Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
XP_008467248.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504644 isoform X3 [Cucumis melo]1.2e-6893.33Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK          QIQIWVLALSTR
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KPS1 Uncharacterized protein1.6e-6196.09Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQS SLVHT LLNYGF+ KMN SYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
A0A1S3CT33 uncharacterized protein ycf20 isoform X11.5e-64100Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
A0A1S3CTA6 uncharacterized protein LOC103504644 isoform X27.0e-78100Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
A0A1S3CUD8 uncharacterized protein LOC103504644 isoform X35.9e-6993.33Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK          QIQIWVLALSTR
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR
A0A6J1I440 uncharacterized protein ycf203.7e-5589.06Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
        MAQS SLV TGLLNY F+ + N+SYWRYD++KSRPS PRS  +KAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGA

Query:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
        LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
Subjt:  LGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSRPK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G43050.1 Protein of unknown function (DUF565)5.5e-3563.85Show/hide
Query:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSF--RVKAVQDTGG--PRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISL
        MA S S + T L +   +     S+  +  V S     R F   ++A+Q+T G  PRRL+DIIR VPE+SRNYF+ PSRR LFGGISLLGGFYVAQTISL
Subjt:  MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSF--RVKAVQDTGG--PRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISL

Query:  SFGALGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSR
        SFGALGVNDVIAAV+CVLLTEYVTRFYYSR
Subjt:  SFGALGVNDVIAAVVCVLLTEYVTRFYYSR

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACAATCTACAAGTTTAGTCCATACTGGCCTCTTAAATTATGGTTTTAGTCTCAAAATGAATTCTTCATATTGGAGATATGATATGGTTAAATCACGACCTTCCCC
TCCTCGTAGCTTTCGTGTCAAAGCTGTACAAGATACCGGGGGTCCTCGTAGGTTAGTTGATATCATTAGACTTGTGCCTGAGCTCTCGAGAAATTACTTTCGGAGTCCTT
CGAGGAGGGCCCTTTTTGGAGGAATCTCATTGTTGGGTGGCTTTTATGTGGCACAGACTATCTCATTGTCATTTGGAGCTTTAGGAGTAAATGATGTTATTGCTGCTGTG
GTATGCGTTCTCCTTACCGAGTATGTTACTCGATTTTATTACAGTCGACCAAAGCCTCCGTGCCTTTCAAATATTGTACAACAGCAGATACAAATTTGGGTGCTGGCCCT
GAGTACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAATACTTTTGGGGGCAAAATAGTATTTTCACTAAATTTTGTAATCTCAATTTCCAAATTCGTGATTCTCTTCGCTCCGTCAAACAGGAAGCTCTCCTCTTGCTCCT
CACTCGCAAAGCGGAACCTGGGAATCGAATTCAAGGTTCTCAACATTTTATCCGAGGAAGTGAAACTTTGAATGGCACAATCTACAAGTTTAGTCCATACTGGCCTCTTA
AATTATGGTTTTAGTCTCAAAATGAATTCTTCATATTGGAGATATGATATGGTTAAATCACGACCTTCCCCTCCTCGTAGCTTTCGTGTCAAAGCTGTACAAGATACCGG
GGGTCCTCGTAGGTTAGTTGATATCATTAGACTTGTGCCTGAGCTCTCGAGAAATTACTTTCGGAGTCCTTCGAGGAGGGCCCTTTTTGGAGGAATCTCATTGTTGGGTG
GCTTTTATGTGGCACAGACTATCTCATTGTCATTTGGAGCTTTAGGAGTAAATGATGTTATTGCTGCTGTGGTATGCGTTCTCCTTACCGAGTATGTTACTCGATTTTAT
TACAGTCGACCAAAGCCTCCGTGCCTTTCAAATATTGTACAACAGCAGATACAAATTTGGGTGCTGGCCCTGAGTACAAGATGAACATATTGTTTGGATTGGATTCTCTC
AACTTGCAAAAAGAGAGGAAATAACCGCACAGAATTTTCCTATGTAACACTGTTATTACGTCAAGTATTCGGTCTCTTAAGAGACCGTTCGAGGGAAGGATTAAGTTAGG
TTATAGAGGGAGGGAAAGACTAGGTTAAGTTATGGAGGGTTAGTGTTATGATAAAATTAGTGTTATAATAAATCTAATATTATTATGATAATATGTGTTTAGAGAAAGGA
TTATGTAGGTAATATTATGATAATGTTATGATAATATATGTTTGGGGAAAGAGTTAGGTACTTATGAGGGGAAGGGTTATGTAGGTAGTGTTTTGGAATTTATTTTTTTA
TACATTTTTTAAAAATTTGTATTCTAAATTCAATGTACAAGTTTTCTATATTTAATTTACCAAATTGTCTTATTTTGGTAAAACAATTTTCAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQSTSLVHTGLLNYGFSLKMNSSYWRYDMVKSRPSPPRSFRVKAVQDTGGPRRLVDIIRLVPELSRNYFRSPSRRALFGGISLLGGFYVAQTISLSFGALGVNDVIAAV
VCVLLTEYVTRFYYSRPKPPCLSNIVQQQIQIWVLALSTR