CuGenDBv2

Gene ID	MELO3C005608
Organism	Cucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description	nudix hydrolase 14, chloroplastic
Genome location	chr09:21590454..21593306
RNA-Seq Expression	MELO3C005608
Synteny	MELO3C005608
Gene Ontology terms	GO:0006753 - nucleoside phosphate metabolic process (biological process) GO:0019693 - ribose phosphate metabolic process (biological process) GO:0080041 - ADP-ribose pyrophosphohydrolase activity (molecular function) GO:0080042 - ADP-glucose pyrophosphohydrolase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000086 - NUDIX hydrolase domain IPR015797 - NUDIX hydrolase-like domain superfamily

Homology

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A0A0A0KR12 Nudix hydrolase domain-containing protein

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A0A1S3ATD5 nudix hydrolase 14, chloroplastic

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A0A5A7TN73 Nudix hydrolase 14

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A0A6J1E7S8 nudix hydrolase 14, chloroplastic

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A0A6J1I286 nudix hydrolase 14, chloroplastic

3.8e-134

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        DFVGTAVREVEEEIGI+L+LEDMVDLTGFLD STGCRVFPSP                                                          
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                                            GGCDEGIGLFLYRGSASKETIAELQGKETGLRDHGELIKVHVVPYEKLWRVTADAKALMAI LY
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        EMA+KEGLLPSLK
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9SZ63 Nudix hydrolase 14, chloroplastic

1.2e-97

52.65

Show/hide

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        C+MS+ S   TQSIT+P Q ++P+ + A  G+S SDFR+AIDSSLF+ WL NL+SESGIL  G+M+LK+VLIQGVDMFG +IGFLKFKAD++DK+TG+KV
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        PGIVFARGPAVAVLILL  +GETYAVLTEQ            VP GK++LELPAGMLDDDKGDFVGTAVREVEEEIGI+L+ EDMVDLT FLD STG R+
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        FPSP                                                                                              GG
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        CDE + +FLYRG   KETI +LQGKETGLR+HGE IKV ++PY +LWR TADAK LM+I LYEMAQ+EGL+ S  LKP
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G11980.1 nudix hydrolase homolog 14

8.8e-99

52.65

Show/hide

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        CDE + +FLYRG   KETI +LQGKETGLR+HGE IKV ++PY +LWR TADAK LM+I LYEMAQ+EGL+ S  LKP
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CTCGTGTCAAATGTCGGCCGATTCTCCAATTCGGACTCAATCCATCACCATCCCTTGCCAACTCGACCAACCTATTCAGATTCTCGCCGCACCTGGTGTCTCTGATTCGG
ACTTCCGTAATGCTATCGATTCATCGTTGTTCAAACAATGGCTGATGAACTTGCAAAGTGAGAGTGGGATTTTGACCAAGGGAGCCATGTCCCTGAAGCGTGTTCTTATT
CAGGGAGTTGATATGTTCGGAAACAAAATTGGATTTCTCAAATTTAAAGCTGATGTCTATGATAAGCAAACCGGGAAGAAGGTTCCAGGTATTGTTTTTGCAAGAGGACC
TGCTGTTGCTGTTCTTATCCTTCTGAGTTGTGAAGGAGAAACTTATGCTGTCCTGACTGAGCAGTTCATTGGTTTTATTGAGATTAAAGTGTTCGCCATAGTTCCTGTTG
GGAAGCTCATGCTGGAATTGCCTGCTGGTATGTTGGATGATGATAAGGGGGATTTTGTTGGCACTGCAGTTCGAGAGGTTGAAGAAGAAATTGGCATTCAGTTAAGGCTT
GAGGACATGGTTGATCTTACTGGCTTCTTGGACCAATCAACTGGATGCAGAGTCTTTCCTTCTCCTTTTCCAGCCAAAGAGAATTATATTAAGGAAATAAAAGCAGGCAA
TGCCGATTACAACTTCCAAGTTCCCTCACCAGCCTATGATACTCAAACCTCACTCTCCCTACCGAGTATTACCGAACAAGTTTCATCTTTTCCAACTCACTCAATTGTGA
CTTACCCTTTTTGCAACAATTGTGTACGTCTCAACACTTGGAGGCTTATCACAGTTCTAAGGAAATCATCATACAAAAGCCACATCCAACACAACATCTTAGGTTTAGCC
TTTAGGCATCGTATTTTTGGAGGATGTGATGAGGGAATCGGTCTCTTCTTGTATCGAGGATCTGCTAGTAAAGAGACAATAGCAGAGCTGCAAGGAAAGGAAACCGGTCT
CAGGGATCATGGTGAGCTTATTAAGGTTCATGTTGTTCCTTATGAAAAATTATGGCGAGTTACAGCAGATGCAAAGGCTCTAATGGCCATTGCACTCTATGAAATGGCTC
AGAAGGAAGGGCTTTTGCCTTCTTTAAAACCATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAATACATAAGATGTGGCCCAATTAATTTGCACCACGTAACTGGATGCCTAGCCTGCACCTAAGTTTGAGTCACGTCACCAATGGAAGTCGTCATCTTTCTTCATCCTC
TGCCATTTCAGTCCCACTTTAAGAAATAAGTCAGCGTAATCTGATTAAAAAATGACTCACTTTCTTCATCCCTCTAGTTCTCTTCGTTCGTTGGGCAAAGGGTTTCTATT
TCCCTCTTCTTCCTCTTTCCTTCAGTCTAATTCAATCGCATTGCGATCCTTCTCGTGTCAAATGTCGGCCGATTCTCCAATTCGGACTCAATCCATCACCATCCCTTGCC
AACTCGACCAACCTATTCAGATTCTCGCCGCACCTGGTGTCTCTGATTCGGACTTCCGTAATGCTATCGATTCATCGTTGTTCAAACAATGGCTGATGAACTTGCAAAGT
GAGAGTGGGATTTTGACCAAGGGAGCCATGTCCCTGAAGCGTGTTCTTATTCAGGGAGTTGATATGTTCGGAAACAAAATTGGATTTCTCAAATTTAAAGCTGATGTCTA
TGATAAGCAAACCGGGAAGAAGGTTCCAGGTATTGTTTTTGCAAGAGGACCTGCTGTTGCTGTTCTTATCCTTCTGAGTTGTGAAGGAGAAACTTATGCTGTCCTGACTG
AGCAGTTCATTGGTTTTATTGAGATTAAAGTGTTCGCCATAGTTCCTGTTGGGAAGCTCATGCTGGAATTGCCTGCTGGTATGTTGGATGATGATAAGGGGGATTTTGTT
GGCACTGCAGTTCGAGAGGTTGAAGAAGAAATTGGCATTCAGTTAAGGCTTGAGGACATGGTTGATCTTACTGGCTTCTTGGACCAATCAACTGGATGCAGAGTCTTTCC
TTCTCCTTTTCCAGCCAAAGAGAATTATATTAAGGAAATAAAAGCAGGCAATGCCGATTACAACTTCCAAGTTCCCTCACCAGCCTATGATACTCAAACCTCACTCTCCC
TACCGAGTATTACCGAACAAGTTTCATCTTTTCCAACTCACTCAATTGTGACTTACCCTTTTTGCAACAATTGTGTACGTCTCAACACTTGGAGGCTTATCACAGTTCTA
AGGAAATCATCATACAAAAGCCACATCCAACACAACATCTTAGGTTTAGCCTTTAGGCATCGTATTTTTGGAGGATGTGATGAGGGAATCGGTCTCTTCTTGTATCGAGG
ATCTGCTAGTAAAGAGACAATAGCAGAGCTGCAAGGAAAGGAAACCGGTCTCAGGGATCATGGTGAGCTTATTAAGGTTCATGTTGTTCCTTATGAAAAATTATGGCGAG
TTACAGCAGATGCAAAGGCTCTAATGGCCATTGCACTCTATGAAATGGCTCAGAAGGAAGGGCTTTTGCCTTCTTTAAAACCATGATAGTGTGTTTTCTATTCACCCTAT
ATATGATCTTTCACCTTGAACCTTGGCAAACGTTTTCTTTCTTCAGTTCCAACTTTTGCTGGGTTATGTAAAAGGGTAACAAGTTCCTTAACACACTTGTCTCAAGACAA
GATCAATAACGAACTACCTTGCATT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MTHFLHPSSSLRSLGKGFLFPSSSSFLQSNSIALRSFSCQMSADSPIRTQSITIPCQLDQPIQILAAPGVSDSDFRNAIDSSLFKQWLMNLQSESGILTKGAMSLKRVLI
QGVDMFGNKIGFLKFKADVYDKQTGKKVPGIVFARGPAVAVLILLSCEGETYAVLTEQFIGFIEIKVFAIVPVGKLMLELPAGMLDDDKGDFVGTAVREVEEEIGIQLRL
EDMVDLTGFLDQSTGCRVFPSPFPAKENYIKEIKAGNADYNFQVPSPAYDTQTSLSLPSITEQVSSFPTHSIVTYPFCNNCVRLNTWRLITVLRKSSYKSHIQHNILGLA
FRHRIFGGCDEGIGLFLYRGSASKETIAELQGKETGLRDHGELIKVHVVPYEKLWRVTADAKALMAIALYEMAQKEGLLPSLKP

MELO3C005608 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome