; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C006034 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C006034
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionchitinase domain-containing protein 1
Genome locationchr06:679904..684554
RNA-Seq ExpressionMELO3C006034
SyntenyMELO3C006034
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008061 - chitin binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
GO:0070492 - oligosaccharide binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001223 - Glycoside hydrolase family 18, catalytic domain
IPR017853 - Glycoside hydrolase superfamily
IPR029070 - Chitinase insertion domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048901.1 chitinase domain-containing protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-13898.79Show/hide
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TYK17667.1 hypothetical protein E5676_scaffold434G005390 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-13898.79Show/hide
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XP_038896583.1 chitinase domain-containing protein 1 [Benincasa hispida]5.3e-13391.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L363 Glyco_18 domain-containing protein4.5e-13895.62Show/hide
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A0A1S3AV86 chitinase domain-containing protein 12.5e-144100Show/hide
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A0A5A7U5N2 Chitinase domain-containing protein 17.0e-13998.79Show/hide
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A0A5D3D168 Rhodanese domain-containing protein7.0e-13998.79Show/hide
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A0A6J1EEB7 chitinase domain-containing protein 1-like isoform X13.1e-12385.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0JPQ9 Chitinase domain-containing protein 13.5e-3937.66Show/hide
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Q5RFF6 Chitinase domain-containing protein 11.1e-4038.24Show/hide
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Q66IL0 Chitinase domain-containing protein 13.8e-4140.17Show/hide
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Q68EX9 Chitinase domain-containing protein 12.6e-4240.34Show/hide
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Q9BWS9 Chitinase domain-containing protein 11.1e-4038.24Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G01040.1 Glycosyl hydrolase superfamily protein6.7e-9462.99Show/hide
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         L  +VDGFSLMTYD+S   NPGPNAPV WI  TL+LLLG+ + ++  + A K+ LGINFYGNDF     SGGGGAITGRDYL+LL+K+KP  +W+  S 
Subjt:  SLTGAVDGFSLMTYDYSGAHNPGPNAPVNWIRSTLRLLLGTKDISLVQHKAIKIFLGINFYGNDFSF---SGGGGAITGRDYLSLLEKYKPVLQWEGVSS

Query:  EHFFLYADYNQNKHAVFYPSLKSILIRLEEAQSFGTGISIWEIGQGLDYFFDLL
        EH F+Y D    KHAVFYP+L SIL+RLE A+ +G GISIWEIGQGLDYFFDLL
Subjt:  EHFFLYADYNQNKHAVFYPSLKSILIRLEEAQSFGTGISIWEIGQGLDYFFDLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGGTGGGTAGCGTATGGAATACTGCGTGATCCAGACATGAGGAATTTGGCATTGCAATTTATAAAGCAGCTTGGAAATGCCCTGCATTCAGAGCTCGAGAGTACG
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GCTGTGGATGGTTTCTCACTCATGACCTACGATTACTCTGGTGCTCATAATCCAGGCCCCAATGCTCCAGTGAATTGGATTCGTTCAACATTACGGCTATTGCTC
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AAGCACGCAGTTTTCTATCCATCACTGAAATCAATCCTCATACGTCTTGAGGAAGCTCAATCCTTCGGTACCGGTATCTCCATATGGGAAATCGGGCAAGGTTTG
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ATATTGCCCAGAGTGGCTGTTGAAGCACCTCCTATGGATCTGCTTAGAAAGAAGAAGCTGAAGGACAAAGCTATTAATCTAATCGTAACAGAATGCAAGGAAATG
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AATTGGATTCGTTCAACATTACGGCTATTGCTCGGTACCAAGGACATTAGCCTTGTTCAGCACAAGGCTATCAAGATATTTCTTGGAATCAACTTCTACGGCAAT
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CATTTCTTCTTATACGCCGATTACAATCAAAACAAGCACGCAGTTTTCTATCCATCACTGAAATCAATCCTCATACGTCTTGAGGAAGCTCAATCCTTCGGTACC
GGTATCTCCATATGGGAAATCGGGCAAGGTTTGGATTACTTTTTTGATCTACTATGAAAATTTTCAAATTTGCAGCGTTTCTTTACCTGTCTTTGTGCCAACCAC
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ATCGTGAACGAGTTCCCCAGTCTTCAACACCCACCAGAGAAGAGGGAAAATCATTCACATGTTTTGATGTAGTTTTGTTTTCAATGTTCTAGAATAAATTGTAAG
GAACTATTATAATTATCAATCCAGATTGTCTTTTTTATTTTAAATCATAGAGTTTTTTTCTTTCTTAACCCTTTTCTTTAAGAAGTAAGAGTTCAATTCTATTTG
CTAACATTCTGTATTAGTAGGCACAATTATGATTATTTGGTTAAATAACAATTTTTATTAATGAACTTTTAAGTATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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