; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C007601 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C007601
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionlysine-rich arabinogalactan protein 18-like
Genome locationchr08:3969655..3971736
RNA-Seq ExpressionMELO3C007601
SyntenyMELO3C007601
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604150.1 hypothetical protein SDJN03_04759, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-3782.86Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTT P AT P AAKY PPAASP+SPPTN SP AAPQKP TPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPA----------ASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPA          ASVP SSPPAA+VPA SPPVPVP S
Subjt:  SSPPA----------ASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
KAG7034312.1 Lysine-rich arabinogalactan protein 18 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.2e-3883.57Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTT P AT P AAKY PPAASP+SPPTN SP AAPQKP TPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPA----------ASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPA          ASVP SSPPAA+VPASSPPVPVP S
Subjt:  SSPPA----------ASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
NP_001267612.1 arabinogalactan protein precursor [Cucumis sativus]4.0e-4596.92Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAA YPPPAASPVS PTN SPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
TYK12844.1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-48100Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
XP_008440341.2 PREDICTED: lysine-rich arabinogalactan protein 18-like [Cucumis melo]3.9e-48100Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B0X7 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like1.9e-48100Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
A0A5D3CP79 Lysine-rich arabinogalactan protein 18-like1.9e-48100Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
A0A6J1HFT1 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like2.2e-3688.46Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPA   PVAAK PPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVST     PPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVP SSPP ATVPASSPPVPVP S
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
A0A6J1KVL2 lysine-rich arabinogalactan protein 18-like2.5e-3787.69Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPA   PVAAKYPPPAASPV PPTNSSPAAAPQKP TPAPVST     PPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVP SSPPAA+VPASSPP  VP S
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Q9XIV1 Arabinogalactan protein1.9e-4596.92Show/hide
Query:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
        MGRQSVIALVLICAVVA VGGQSPAAAPTTTPAATPPVAA YPPPAASPVS PTN SPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA
Subjt:  MGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPASTPPTASVPA

Query:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
        SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
Subjt:  SSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVS
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGCCTCGGGCTGCGAAATATTCACTTCATCATCTACTACTCACTCACACGGTAGAAATGGGTAGACAATCCGTAATCGCACTCGTTCTCATCTGCGCCGTCGTCGC
TGTTGTCGGTGGCCAGTCTCCGGCTGCTGCTCCCACTACTACTCCCGCCGCTACTCCGCCAGTAGCAGCGAAGTATCCACCTCCAGCCGCATCTCCTGTATCTCCACCGA
CAAATTCATCTCCCGCCGCCGCTCCTCAAAAGCCGGCCACTCCAGCACCGGTCTCCACGCCGCCTGCATCGGCGCCACCAGCAGTCGCTCCAGTAGCTTCTCCACCAGCC
AGCACTCCTCCGACTGCGTCCGTTCCTGCTAGCTCTCCTCCGGCTGCTTCCGTTCCACCTAGCTCTCCACCAGCTGCTACCGTTCCGGCAAGCTCTCCGCCTGTTCCAGT
TCCGGTTAGTTTCTCCACCAGTTCCAGTACCTGTGAGCTCTCCCTCCAGTACCAACTCCACGGAATCTCCTCCCGCTCCCGAAAGTTCTCCTCCTGCCCCAGTCGCGTCG
CCTCCTGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCTTTGTTTGGACAGTCTGTTTAAATCTCCAATATTATACCGTTCTTTTGTTCGATTCCGTTCGTGGGCCCTTTTCTCTCTCCCCAACGGCTAGTACAGGCCCATTAAT
AGTGGGCCCATTCCATCATTTTTATTATTATTTTTATTTAAAATAAAAAACTCCTTCGAGGCGTTATTTACTGGTCTATATATACACTATGACGCCTCGGGCTGCGAAAT
ATTCACTTCATCATCTACTACTCACTCACACGGTAGAAATGGGTAGACAATCCGTAATCGCACTCGTTCTCATCTGCGCCGTCGTCGCTGTTGTCGGTGGCCAGTCTCCG
GCTGCTGCTCCCACTACTACTCCCGCCGCTACTCCGCCAGTAGCAGCGAAGTATCCACCTCCAGCCGCATCTCCTGTATCTCCACCGACAAATTCATCTCCCGCCGCCGC
TCCTCAAAAGCCGGCCACTCCAGCACCGGTCTCCACGCCGCCTGCATCGGCGCCACCAGCAGTCGCTCCAGTAGCTTCTCCACCAGCCAGCACTCCTCCGACTGCGTCCG
TTCCTGCTAGCTCTCCTCCGGCTGCTTCCGTTCCACCTAGCTCTCCACCAGCTGCTACCGTTCCGGCAAGCTCTCCGCCTGTTCCAGTTCCGGTTAGTTTCTCCACCAGT
TCCAGTACCTGTGAGCTCTCCCTCCAGTACCAACTCCACGGAATCTCCTCCCGCTCCCGAAAGTTCTCCTCCTGCCCCAGTCGCGTCGCCTCCTGCTGAGGTTCCGGCCC
CGGCACCTAGCAAGAAGTCAAAGAAGCACAGAGCACCAGCTCCTTCTCCAGCGTTGCTCGGTCCACCTGCGCCTCCTTCTGAAGCTCCTGCAGGAAGCGAGGAAGGTCCT
TCGCCCAGTCCTTCACTGGAGGACAAGAGTGGAGCAGAAGCATTGATGAAGGTGGCCGGAAGTTTGGCTTTGGGATGGGCTGCCGTCGCCGTTAGCATTATCTTTTAGAG
AGAGAGAGAGAGAGATTTGATCGTGCTTCATTTATTTATATTTAATCTCTTTTATTTATTTTTGGTTAAAAATTTTCCCCCATTGTGTACTCCGTATCATAAGAGGTGCT
TTATTGATTGAATTGATTCGATGAAATTTGTTTTAGAAATTTGAGCACTTTGTTGGGTATTTGCTTTGATGTGATGATGAACATTTTGGATCGGAGTATATGATTTGTTG
TAATTCTTTCTGTGGAGGACATGAGAGTGGGGAAAGATCTTTTATTACATTTGGATCCTTTTGTGTTAGGTAAATTATTTAATTCTCCTTCATTTCTGTTCCACTACATT
TTTGTCAATTTACTTTTTACTTCCATCAAATAATACCGTGTCCTACTTAATCATTACATTAAGTTTCTAAATTTGAGTTTACGATAGTTATTTTATCAATAATTACCACA
CTCGAACTCTTCATCAAAGGGTTAGAACACTCGAACTCAACATGTACGGAGATCTTGCGTTAGGTCAGAAAAACAAAATTTAGCGAAAATCACG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTPRAAKYSLHHLLLTHTVEMGRQSVIALVLICAVVAVVGGQSPAAAPTTTPAATPPVAAKYPPPAASPVSPPTNSSPAAAPQKPATPAPVSTPPASAPPAVAPVASPPA
STPPTASVPASSPPAASVPPSSPPAATVPASSPPVPVPVSFSTSSSTCELSLQYQLHGISSRSRKFSSCPSRVASC