; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C007907 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C007907
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr08:6133631..6134203
RNA-Seq ExpressionMELO3C007907
SyntenyMELO3C007907
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025673.1 RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-106100Show/hide
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KAG6603909.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.1e-7374.61Show/hide
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XP_008440820.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL72-like [Cucumis melo]9.3e-106100Show/hide
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XP_011658497.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B [Cucumis sativus]1.6e-10297.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KKP7 RING-type domain-containing protein7.9e-10397.89Show/hide
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A0A1S3B2S4 RING-H2 finger protein ATL72-like4.5e-106100Show/hide
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A0A5D3CLV8 RING-H2 finger protein ATL72-like4.5e-106100Show/hide
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A0A6J1GEN4 RING-H2 finger protein ATL74-like3.8e-7374.61Show/hide
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A0A6J1IJG4 RING-H2 finger protein ATL74-like7.2e-7273.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL641.8e-1140.86Show/hide
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Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL472.0e-1041.89Show/hide
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Q8H7N9 E3 ubiquitin-protein ligase Os03g01882002.0e-1032.59Show/hide
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL51.2e-1041.57Show/hide
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Q9SJJ7 RING-H2 finger protein ATL579.0e-1137.5Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23980.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-1141.89Show/hide
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AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein4.9e-1240.26Show/hide
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.3e-1240.86Show/hide
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AT3G62690.1 AtL58.3e-1241.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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