; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C007974 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C007974
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionRWP-RK domain-containing protein
Genome locationchr08:6494858..6495930
RNA-Seq ExpressionMELO3C007974
SyntenyMELO3C007974
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003035 - RWP-RK domain
IPR044607 - Transcription factor RKD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038882834.1 protein RKD5 isoform X2 [Benincasa hispida]4.1e-6496.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGY8 RWP-RK domain-containing protein1.5e-6792.72Show/hide
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A0A1S4DTD9 protein RKD52.9e-7196.69Show/hide
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A0A5A7SHH9 Protein RKD52.9e-7196.69Show/hide
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A0A6J1BWV1 protein RKD58.3e-6387.42Show/hide
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A0A6J1GEC7 protein RKD5-like isoform X11.9e-5991.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81791 Protein RKD51.1e-3254.68Show/hide
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Q9CA66 Protein RKD29.6e-1639.39Show/hide
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         + +TKR RQ  F+  H   K R+L+S    V
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Q9FGD1 Protein RKD31.6e-1538.69Show/hide
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Q9LVU8 Protein RKD41.3e-1538.1Show/hide
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Q9M9U9 Protein RKD15.1e-1737.59Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18790.1 RWP-RK domain-containing protein3.6e-1837.59Show/hide
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        E++ IE+ P  + E +TKR RQ  F+  HK +     S  +
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AT1G74480.1 RWP-RK domain-containing protein6.8e-1739.39Show/hide
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AT4G35590.1 RWP-RK domain-containing protein8.0e-3454.68Show/hide
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AT5G53040.1 RWP-RK domain-containing protein8.9e-1738.1Show/hide
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AT5G66990.1 RWP-RK domain-containing protein1.2e-1638.69Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTAAAAATTTTGGTGTTCCGATCACAGAAGCTTCAAGAAATCTAAATGTTGGATTAACAGTACTGAAAAGAAAATGCAGAGAATTTGGCATTCATCGCTGGCCG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGAGTCCTGTGATGAATCAGGTGGGGAATTGATAGGTATTGCAGAAAAGAAAAGGAGGGCAACAAGTGAGCACATTGCTGGAATTACTTTATCCGATCTG
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AATCTCATCATGACATACCCGACAAGAAGGTCTTGTAAGACCTGTACCAGCAATTTTCATATGGAACTTTCTGTTTTTTTTCAATGAATATTGTGTTTAAATAAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEESCDESGGELIGIAEKKRRATSEHIAGITLSDLAKNFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQ
MMLQNERERIERTPFRELESETKRFRQDVFRRKHKARALESQSPSV