; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C008083 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C008083
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUPF0301 protein
Genome locationchr03:38986..43915
RNA-Seq ExpressionMELO3C008083
SyntenyMELO3C008083
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003774 - Protein of unknown function UPF0301


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022939197.1 uncharacterized protein LOC111445188 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.6e-9295.4Show/hide
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XP_030934841.1 uncharacterized protein LOC115960205 [Quercus lobata]5.6e-9295.4Show/hide
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XP_038886073.1 uncharacterized protein LOC120076339 [Benincasa hispida]7.8e-9497.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMD9 Uncharacterized protein2.9e-9497.7Show/hide
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A0A1S3B2S1 uncharacterized protein LOC1034853832.4e-96100Show/hide
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A0A5A7T638 UPF0301 protein2.4e-96100Show/hide
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A0A6J1JZ91 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X12.7e-9295.4Show/hide
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A0A7N2MIA1 Uncharacterized protein2.7e-9295.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1BEV6 UPF0301 protein Cpha266_08857.2e-1828.16Show/hide
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         G+++P + RFF+GY+GW   QL EE E   WY+A  S ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
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B3QMC9 UPF0301 protein Cpar_06621.6e-1728.16Show/hide
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        +RTV+L+      H  EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++             +   +EV+PGL +G     ++ + L+ 
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         G+++P + RFF+GYAGW   QL++E E   WY A  S+  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Q3AQ69 UPF0301 protein Cag_16012.9e-1929.21Show/hide
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        M+ +  +RTV+L+      H +EG  G ++NRPL  K++       D+     +  LH GGP++ +           +H  +EV+PG+ +G     DE +
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         L+  G++ P + RF++GYAGW   QL  E E   WY A  + ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Q3B561 UPF0301 protein Plut_06375.5e-1828.16Show/hide
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        +RTV+++      H  +G  G ++NRP+  +++       +    F E    LH GGP++++           + G E+++PGL +G     +E   L+ 
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Q8KEM4 UPF0301 protein CT06632.1e-1729.31Show/hide
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        +RTV+L+      H +EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++     +       + G  EV+PGL +G     ++ + L+ 
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         G++K  + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  SS  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33780.1 Protein of unknown function (DUF179)9.5e-8283.91Show/hide
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AT3G29240.1 Protein of unknown function (DUF179)6.9e-3243.45Show/hide
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        +  +TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +VM GL +G R S+  A
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        A +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW VAACSS ++   S+   S GLW+E+L L+G
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AT3G29240.2 Protein of unknown function (DUF179)6.9e-3243.45Show/hide
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        +  +TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +VM GL +G R S+  A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGTTCGCACTTTTGAGGCGAACTGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCTCAGGAGGGACCGTTTGGTGTCGTGATAAATAGGCCACTCCACAAAAA
GATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGAGTGCTCTCTACATTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAACAGGAG
AAAAATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATGCCAGGCCTCTGCTTTGGTGCTCGAAACAGCCTAGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCT
CAGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAGTTGAGGGAGGAGATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGG
TGGAAGCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGACTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
agtagttagagtgagtaagtaagtagaacaacattccgttagacaatggcatattcggtgtgtatgtgtatcgctctacatcattttcactctcttctctctctgccctt
accttaactgttagctgctcattgtttggctttcaatcttcaatatatatcgcctaaatattctctctattttcttcttctactcctctggattggatcatcgtttccga
cgccttcttcccacaaaaaaatccctttcggatatggatctctttgctgccaatgtcaagaacaccgccgccgccgccgccgccgccactcctccttctcccttttcact
caaacactcctttcctgatagacccatttcttgctctctggcgatgacttcgaggagattcttcttctatcccttggcgctgacttctccgcttgcttgagatccgtgtt
ttcaagcccaagctttcctctcccgctttctcgtgcgagccactgccaagaagatcacgacaattctccatctcctgAAAATGGAGATCACTCTGTTCTGGAGATGACGC
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AGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGATGTGGAAACCCAGACTGCAAATGCTCACGAGTCTAAGGGTCTTGCGCTGAAGTGGGGCACATCCTATTCCTATGCCTGAGACTGG
CTGTGTGCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGGATGGTGTTCGCACTTTTGAGGCGAACTGTCGTCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCTCAGGAGGGACCGTTTGGT
GTCGTGATAAATAGGCCACTCCACAAAAAGATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGAGTGCTCTCTACATTTTGGGGGGCCTCTTGA
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GTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGTGGAAGCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGACTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAG
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AGCTGGCTTTTGAAATTTAGCAGACGGACAGCTACTACCTTTTTATAGCCTACTTCTAAATGTAATTTATGTATATCCTGTTCACATTTGCTTAATTCAATAGTCTTTTT
AGAATATGCCTACATAAATTTTTTACACGAAAGGGTAGTTTTCAGAGATTTATATTCGGTTTGTGAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVFALLRRTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVMPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKP
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