; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C008155 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C008155
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionDipeptide epimerase
Genome locationchr03:1270336..1273660
RNA-Seq ExpressionMELO3C008155
SyntenyMELO3C008155
Gene Ontology termsGO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0016853 - isomerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013341 - Mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, N-terminal domain
IPR029017 - Enolase-like, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031915.1 MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-10791.63Show/hide
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TYK06693.1 L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-10791.63Show/hide
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XP_004138632.3 L-Ala-D/L-amino acid epimerase isoform X1 [Cucumis sativus]8.6e-9583.86Show/hide
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XP_008441266.1 PREDICTED: L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like [Cucumis melo]1.5e-10791.63Show/hide
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XP_038884241.1 L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like [Benincasa hispida]7.8e-8877.53Show/hide
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        +SLLSA L PSSS    L   IPRTT SKL+I+S H +NVELIADP  PS+QR+SFGF+NVADTFWVNVQRAEGRPLSIGLNSPLHFGNSKLET++NVA+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQR8 MR_MLE domain-containing protein3.8e-9682.98Show/hide
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A0A1S3B326 L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like7.3e-10891.63Show/hide
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A0A5A7SRY5 MuDRA-like transposase7.3e-10891.63Show/hide
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        IT P   P           N GF+ L+
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A0A5D3C439 L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like7.3e-10891.63Show/hide
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A0A6J1BXC6 L-Ala-D/L-amino acid epimerase-like2.5e-7675.88Show/hide
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        LSAALLPSSS  L  R+PR+T S+L I S H   VEL+AD   P +QR+SFGF+N+ADTFWV+VQRAEGRPLS+GLNSPLH G +KLE +DNVA+RVELS
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        NGCVGWGEVQVLP VTDV+LE AL KA+++C++LRRTPP TL+SVF+D+ GLLSPREFAPIRAGVEMALIDAVANSI+VPLWRLFGGVTSTLTT IT P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A9B055 Aromatic dipeptide epimerase6.0e-0625Show/hide
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        +Q      +++ L  P    +       NV ++V+L++G +G GE    P+V+  +     A  + + + L           +  +  +L  +  E A  
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        R G+EMA++DA+    ++PL   FGGV+  L T +T
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B5EFW2 Hydrophobic dipeptide epimerase4.3e-0424.41Show/hide
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        +Q A    +   L SP      + + L+NV +++   +G  G+GE  V   +T  ++   LA  Q     LR        S         +        A
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         +EMAL+D  +    +P +RLF  V +
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B9I2J6 L-Ala-D/L-amino acid epimerase1.0e-3746.82Show/hide
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        I  ++AT     ++P     Q  +F F+++ +TF V+V+RAE RPL++ L +P    +S+L+ ++NVA+R+ELS+GCVGWGE  +LP VT      A+ K
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        A+E C  L+ +    L  V   V+ +L   EFA +RAGVEMALIDAVA SINVPLW LFGG + ++TT IT P
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O34508 L-Ala-D/L-Glu epimerase8.3e-0826.06Show/hide
Query:  VNVQRAEGRPLSIGLNSPLHFGNSKLETLDNVAMRVELSNGCVGWGEVQVLPSVTDVSLEMALAKAQEVCN-FLRRTPPATLSSVFNDVTGLLSPREFAP
        + + R E   +++ L  P       + T ++V +R+   +G VGWGE      +T  S++   +    V    L     A   ++ +D+  LL+    A 
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         +A VEMAL D  A    +PL+++ GG   TL T  T   + P          L  GF+ L+ ++
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Q607C7 L-Lys-D/L-Arg epimerase9.5e-0425.83Show/hide
Query:  LNSPLHFGNSKLETLDNVAMRVELSNGCVGWGEVQVLPSVTDVSLEMA-LAKAQEVCNFLRRTPPATLSSVFNDVTGLLSPREFAPIRAGVEMALIDAVA
        L  P       +E +DN+ + +  ++G +G G       VT  +LE    A   +   +L      TL  +  ++   L     A  RA ++MAL D VA
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Query:  NSINVPLWRLFGGVTSTLTTGIT-------GPNSFPRGGLNLGFKVLQSRI
          + +PL  + G    +L T +T          +  R  L LGF+VL+ ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G18270.1 cytochrome P450, family 77, subfamily A, polypeptide 5 pseudogene9.7e-3647.62Show/hide
Query:  FQNVADTFWVNVQRAEGRPLSIGLNSPLHFGNSKLETLDNVAMRVELSNGCVGWGEVQVLPSVTDVSLEMALAKAQEVCNFLRRTPPATLSSVFNDVTGL
        F+ + + F V V +AE R L++ L SP    +S+L+++ NVA+R+EL++G VGWGE  +LPSVT     MA+ KA+E   FLR  P   L +V  ++   
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Query:  LSPREFAPIRAGVEMALIDAVANSINVPLWRLFGGVTSTLTTGITGP
        L   +FA +RAG+EMA+IDA A S+ VPLW+LFGG +ST+TT IT P
Subjt:  LSPREFAPIRAGVEMALIDAVANSINVPLWRLFGGVTSTLTTGITGP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCACTTCTTTCAGCCGCTCTTCTCCCTTCTTCTTCCTTTGGTCTCCACCTCCGCATTCCCAGAACTACTTCTTCCAAGCTCCGAATCCTTTCCATCCATGC
CACCAATGTCGAGCTAATTGCAGATCCACCTACCCCTTCTTCCCAAAGGCTAAGTTTTGGCTTCCAAAATGTGGCGGATACTTTTTGGGTCAATGTACAGCGGGCTGAGG
GTAGGCCATTGAGTATTGGGCTTAATTCCCCATTGCATTTTGGGAACTCCAAGCTTGAAACTCTGGACAATGTTGCTATGAGAGTTGAACTTAGTAATGGTTGTGTTGGT
TGGGGGGAAGTTCAAGTGCTTCCTTCTGTTACTGACGTTAGTCTTGAAATGGCTCTTGCTAAGGCTCAGGAGGTTTGCAACTTCCTCCGTCGTACTCCGCCGGCCACTCT
GAGTTCGGTGTTTAATGATGTTACTGGCCTTCTTTCCCCTCGAGAGTTCGCTCCGATCAGGGCTGGGGTAGAGATGGCACTGATTGATGCAGTTGCAAATAGCATCAATG
TTCCACTCTGGAGATTATTTGGTGGCGTGACAAGTACATTAACAACCGGAATAACAGGTCCCAATTCTTTCCCCAGAGGAGGCCTCAATCTTGGCTTCAAAGTTTTGCAA
TCAAGGATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCCACTCTCACAATCCATGGCTTCTTCACTTCTTTCAGCCGCTCTTCTCCCTTCTTCTTCCTTTGGTCTCCACCTCCGCATTCCCAGAACTACTTCTTCCAAGCTCCGA
ATCCTTTCCATCCATGCCACCAATGTCGAGCTAATTGCAGATCCACCTACCCCTTCTTCCCAAAGGCTAAGTTTTGGCTTCCAAAATGTGGCGGATACTTTTTGGGTCAA
TGTACAGCGGGCTGAGGGTAGGCCATTGAGTATTGGGCTTAATTCCCCATTGCATTTTGGGAACTCCAAGCTTGAAACTCTGGACAATGTTGCTATGAGAGTTGAACTTA
GTAATGGTTGTGTTGGTTGGGGGGAAGTTCAAGTGCTTCCTTCTGTTACTGACGTTAGTCTTGAAATGGCTCTTGCTAAGGCTCAGGAGGTTTGCAACTTCCTCCGTCGT
ACTCCGCCGGCCACTCTGAGTTCGGTGTTTAATGATGTTACTGGCCTTCTTTCCCCTCGAGAGTTCGCTCCGATCAGGGCTGGGGTAGAGATGGCACTGATTGATGCAGT
TGCAAATAGCATCAATGTTCCACTCTGGAGATTATTTGGTGGCGTGACAAGTACATTAACAACCGGAATAACAGGTCCCAATTCTTTCCCCAGAGGAGGCCTCAATCTTG
GCTTCAAAGTTTTGCAATCAAGGATTTGAAACTCTTAAGCTTGTTGTTGGGAAAAACTTTGCTGCAGAAATTGCAGCTATTGAGGCCATTCATGCAGCTCAGCCCTGCTG
CTCGTTCATGTTTGATGCAAATGAAGGATACACACCCGACGAAGCAATTAAGTTTCTTGAGAAATTGAAGGATGTGGGAATAGTGCCTCTTGTTTTTGAGCAACCTGTAG
ACAGAGATGACTGGAAAGGTCTTCAAGAAGTCAGTAACGTCGCTAGAATGCATGGGATACCTGTTGCTGTGGATGAGAGTTGTCGGAGCTTGACAGATGTTTGTAAGATA
ATCGACGAAAATCTTGTGGATGCCATAAACATTAAGTTGCCCAAATTTGGAGTCCTTGGAGCTCTTGAAATAATAAATCTAGCAAGAAAATCAGGCTTGATTCTTATGGT
TGACAGCATGGCCGAGACGAGACTCGGAACCGGCTTTGCAGGCCATTTGGCTGCTGGAGTTGGTTGCTTCAAGTACATTGTTCTTGATACACCACTTTTATTAGCAGAAG
ACCCTGTTGTTGGAGGTTATGAAGCTTCTGGTGCTGTTTACAAGTTCAATAATGCTAGAGGACAAGGAGGCTTCTTGAATTGGAATCTTCTTCCCTGGTGAGATAATATG
TTGTAATGTTTTCTTTCTATATCATCTATTTCAGTCTTATTGGCAGTCACTGCCTTGTTTAAATCCATTTGAATATGGTGGATTGTTAAAGTAAGTATGCTTCTTCTTAA
GCCCCTTTGGTAACCACTTACATCTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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WGEVQVLPSVTDVSLEMALAKAQEVCNFLRRTPPATLSSVFNDVTGLLSPREFAPIRAGVEMALIDAVANSINVPLWRLFGGVTSTLTTGITGPNSFPRGGLNLGFKVLQ
SRI