; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C009929 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C009929
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionBAH domain ;TFIIS helical bundle-like domain
Genome locationchr04:26886517..26897040
RNA-Seq ExpressionMELO3C009929
SyntenyMELO3C009929
Gene Ontology termsGO:0006325 - chromatin organization (biological process)
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InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053699.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold135G00730 [Cucumis melo var. makuwa]4.7e-27198.14Show/hide
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        PTITSHLLGPAGVAPTPYSRPFIMSY +GS  VGPEIGKWGSQGLDLNAGHGIIDKER DEKLP   RQLS PS+QP      + F+
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A0A6J1J583 uncharacterized protein LOC1114818656.9e-23685.63Show/hide
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        MH ESPAIPLPE+DQ EKLSL++PE  GTKDHVT AN S SAPRSD+VVKLDFDLNEGCS D+ TQD++IG +SSVQLP+  PFSIPSASE+FPVS+TVA
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        SAAKGSVVPP NSLAN+VELGWKGSAATSAFRRAEPRKNLE+PLSLSDVPLVTTTSKEGR PLDFDLNVPDQRLLEEV L SN+P KASV+ G  DRGGG
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        LDLDLNK DESHDVGPCS+ + RLELP+SSRPFVSGG GNCGFS SRNFDLNNGPSLDEMGAETVPL QQNK+YMPFSSLLPGMKVNSGEIGNFYS FPQ
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        GN+YSALTAIPSVLPGRGEQSYVPAAVSQRVFAPPTGTGF AEIYRAPVLSSSPALAFPPANSFTYSGFPFETSFP+QSN YSGCSTSYMDSS GCSLGF
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        PTITSHLLGPAGVAPTPYSRPFIMSY +GS  VGPEIGKWGSQGLDLNAGHGIIDKER+DEKLP   RQLS PS+QP      + F+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G48050.1 BAH domain ;TFIIS helical bundle-like domain1.9e-6838.38Show/hide
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        S+ ++  S+   +++FDLNEG   D+    D    + SV L   P       PF +   S     SITVA+AAKG  VPP + L N+  +GW+GSAATSA
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        FR AEPRK  ++ LS+++      ++  G+Q    LDFDLNVPD+R+LE               ++T S    ++ V     D   GGLDLDLNK D+S 
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        D+   ++ S  RL+         S G       G R+FDLN+GP  D+   E ++ L Q ++S +P    L G++VN   + +F +WFP  N YSA+ ++
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        P ++P RG+Q +   A    QR+  P TG + F  E YR PVLSSSPA+ F  + +F Y  FPF  SFP+ S  + G ST++MDSSS     FP + S +
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        LGP    P+ Y RP+I+   +G  +G V     KW   GLDLN+G G  + E  DE      RQLS+ +S PL    +R ++
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AT3G48050.2 BAH domain ;TFIIS helical bundle-like domain1.9e-6838.38Show/hide
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        S+ ++  S+   +++FDLNEG   D+    D    + SV L   P       PF +   S     SITVA+AAKG  VPP + L N+  +GW+GSAATSA
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        FR AEPRK  ++ LS+++      ++  G+Q    LDFDLNVPD+R+LE               ++T S    ++ V     D   GGLDLDLNK D+S 
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        D+   ++ S  RL+         S G       G R+FDLN+GP  D+   E ++ L Q ++S +P    L G++VN   + +F +WFP  N YSA+ ++
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        P ++P RG+Q +   A    QR+  P TG + F  E YR PVLSSSPA+ F  + +F Y  FPF  SFP+ S  + G ST++MDSSS     FP + S +
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        LGP    P+ Y RP+I+   +G  +G V     KW   GLDLN+G G  + E  DE      RQLS+ +S PL    +R ++
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AT3G48060.1 BAH domain ;TFIIS helical bundle-like domain1.8e-6636.13Show/hide
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        P  P   D  G++   +    A     V+ A S+ +    D+  +++FDLNEG   D+    D    + SV L   P       PF +   S   P SIT
Subjt:  PAIPLPEDDQGEKLSLDVPELAGTKDHVTCANSSFSAPRSDSVVKLDFDLNEGCSADEGTQ-DEIIGNSSVQLPVIP-------PFSIPSASENFPVSIT

Query:  VASAAKGSVVPPTNSLANRVELGWKGSAATSAFRRAEPRKNLELPLSLSDVPLVTTTSKEGRQP---LDFDLNVPDQRLLEEVTLSNLPQKASVESGPSD
        VA+A KG  VPP + L  +  +GW+GSAATSAFR AEPRK  ++ LS+++      ++  G+Q    LDFDLNVPD+R+LE++         +  SG ++
Subjt:  VASAAKGSVVPPTNSLANRVELGWKGSAATSAFRRAEPRKNLELPLSLSDVPLVTTTSKEGRQP---LDFDLNVPDQRLLEEVTLSNLPQKASVESGPSD

Query:  R---------GGGLD-----LDLNKADESHDVGPCSV-SKGRLELPMSSRPFVSGGLGNCGFSGSRNFDLNNGPSLDEMGAE-TVPLGQQNKSYMPFSSL
                  G  LD     LDLNK D+  D+   ++ S  RL+         S G       G R+FDLN+GP  D+   E ++ L Q ++S +P    
Subjt:  R---------GGGLD-----LDLNKADESHDVGPCSV-SKGRLELPMSSRPFVSGGLGNCGFSGSRNFDLNNGPSLDEMGAE-TVPLGQQNKSYMPFSSL

Query:  LPGMKVNSGEIGNFYSWFPQGNTYSALTAIPSVLPGRGEQSYVPAAV--SQRVFAPPTG-TGFAAEIYRAPVLSSSPALAFPPANSFTYSGFPFETSFPI
        L G++VN   + +F +WFP  N YSA+ ++P ++P RG+Q +   A    QR+  P TG + F+ E YR PVLSSSPA+ F  + +F Y  FPF  SFP+
Subjt:  LPGMKVNSGEIGNFYSWFPQGNTYSALTAIPSVLPGRGEQSYVPAAV--SQRVFAPPTG-TGFAAEIYRAPVLSSSPALAFPPANSFTYSGFPFETSFPI

Query:  QSNAYSGCSTSYMDSSSGCSLGFPTITSHLLGPAGVAPTPYSRPFIMSYASG--SGTVGPEIGKWGSQGLDLNAGHGIIDKERIDEKLPTGLRQLSAPSS
            + G ST++MDSSS     FP + S +LGP    P+ Y RP+I+   +G  +G V     KW   GLDLN+G G  + E  DE      RQLS+ +S
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Query:  QPLLMSSSRCFR
         P     +R ++
Subjt:  QPLLMSSSRCFR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
atgcacggggaatctcctgccatacccttaccagaagatgatcagggtgagaaattaagtttagatgttcctgagttggctggaaccaaagaccacgtcacttgtgcaaa
ttcttcattttctgctccaaggtcagattcagtggtaaagctggactttgatctaaacgaaggttgttctgctgatgaagggacacaagatgagattattgggaattcct
ctgttcagctgcccgttatcccacctttctcaatcccttcagcatcagaaaacttccctgtttcaattactgtggcttctgctgcaaaaggatcagttgttccaccaaca
aactccctagcaaacagagttgaacttggatggaagggttcggctgctacaagtgcttttcgcagggcagaaccacggaaaaatcttgagttgccactcagtttaagtga
tgtacctcttgttaccaccactagcaaggaggggcgccaacctttggacttcgacctgaatgtgccagaccagagactcctagaagaagttactttgtcaaatttaccac
agaaagcaagtgttgaatcagggccttctgatcgaggtggtggacttgatcttgatttgaataaagctgatgaaagtcatgatgtgggcccatgttctgtgagcaagggt
aggttggagctccccatgtcaagtaggccttttgtttctggtggattagggaattgtggattcagtggctccagaaactttgatttgaacaatggtccttcccttgatga
aatgggggcagaaacagtgcctcttggtcagcagaataaaagctacatgccattttcatcacttctccctggaatgaaggtgaactctggagaaattgggaacttctact
cttggtttcctcaggggaacacatattcagcattaacagcaatcccatcagtcttgccaggtagaggagaacaaagttatgttcctgctgctgtttctcagagagtattt
gctcctccgacaggcactggctttgctgctgaaatttatcgtgcaccagtgctttcttcctctcctgctttggcattcccacctgctaactcctttacttattctgggtt
ccctttcgaaactagttttcctatacaatcaaatgcatattcaggttgctcaacatcgtacatggattcatcctctggctgttctcttggattccctaccattacttctc
atttgttaggaccggctggggtagcccctaccccttattcaaggcccttcatcatgagctatgctagtggcagtggtactgttggtcctgagattggaaaatggggaagc
cagggtttggatcttaatgcaggtcatgggattatagataaagaaagaattgatgaaaaattgcctacaggattgagacaactttcagctcccagttcgcaacctttgct
gatgagcagctcaagatgtttcagatag
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAATTTGGCCCCAAGCCCACGTATTCGCTCTCATTCGCCATTTTCGTCTTCTCAAATCCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAAATCTCTCACGGCGAGTTCTT
CGCTCAAAATCTTCGGAACCCATTTCTTCTTTTTACTCCTTTTCCCCATAATTTCATTCCTTTCATCATTTCGATTTCTTTCCCTTTTACTGCCAACCCAATTCTCACCC
CAATTCTACCAAAATCCCTAGTTTAGTTTCCCCCAATCCCCATCTCCTTTCCCCTTTATTCATGTCTCCCTCTTCTTTTTCTGCTTACTTCAACAACACCCATCTCTGAT
TTCAGAGGAAAGTGGTCTTTTATTCAAGATTCAAGGAAAATGGAGGGATATGCATGGGTCTGGAGGTGAGAGGTGGAAACAGAGGCGGCACATGTGGCCGGTCCATTCTA
ATTCCACAGCTGTAGCTTCCGAATTATCCGCCCCAGATTTCTTTCTCAAAGATGGACGCAAAATCCACGTTGGTGATTGTGCTCTTTTCAAGCCACCTCTAGATTCTCCT
CCTTTTATTGGAATTATACGTTCACTGAAGTCAGAGAAGGAGACTAATTTAAGGTTAGATGTGAATGGCTTTACCGACCTGCTGATGTGAAGCTCCCAAAAGGATTATCG
TTAGATGCTGCACCAAATGAGATTCTTTTACTCATTTCATAAAGATGAGATACCTGCCGCTCGTTGCTTCATTCCGTGTAAAGTTGCATTCCTCCGCAAAGGCGTTGAAC
TCCCATCAAGCATTTCCTCATTTGTGTGCAGAAGAGTGTATGATACTGACAACAAGTGTTTATGGTGGTTAACTGATAGAGATTATATTAATGAACGTCAAGAAGAAGTA
GATCAATTATTAGAAAAGACAAGGCTAGAAATGCATGGGGTGGTGCAGTCTGGAGGCCGTTCACCAAAGCCCTTGAATGGTTCAATTCCAGCAGTGCAGCCAAAATCTGG
TTCAGAAAATATATCAAATAGTTCCTTTCTCACTTCTCACGTTAAAAGCAAGAAAAGGGAACGGGGTGATCAGGGTCTGAACCCACCAAGAGAGAGCGGTTATTTAAAGT
AGAAGAGGGGGAATTCGGTCAATTTAGATTAGAGAGTACACTAAAGAATGAGATTGCAAAAATTACTGATAAAGGAGGACTTACTGACTTTGAGGGGGTTGAAAATTTGT
CAAACTTATACAACCCTGACAGCTCTGGTAAGAAAATAGACTTGGCTGATCGAGTGATGCTTGCTGATGTTATAGCAGTCACTGATAGGTTTGATTGTTAGGATGGTTTT
TGCAGCTCAGGGGTTTGCCTGTATTAGATGAATGGCTTCAAGAAGTTCACAAGGGAAAAATTTGTGATGGTAATAGCATGAAAGGAAGTGATAAAACTGTTGAGGATTTT
CTTTTGGCTCTACTTCGTGCTCTGGACAAACTTCCTGTGAATCTCAATGCTCTTCAGACTTGTAATGTAGGCAAGTCTGTGAATCATTTACGTAGTCATAAGAATTCTGA
AATTCAGAAGAAAGCAAGGAGTTTGGTTGATACTTGGAAGAAACGTGTGGAAGCTGAGATGGATGTTAATGATGCAAAGTCTGAATCCAGTCGCGGTGTCTCATGGCCTT
CTAAATCTGCGCCTTTGGAAGTTTCTCAAGCAGCAAGCAGAAAAGCTGGGGGGGTCTGGTGACGATGGTTTAAAGAGCTCTACACAATCTAACATGTTTAAACATTCTCA
ATCTAAATTTGGTCCCACTGAAATGGTTGGCAAATCATCTGCATTGCCAAACAGCATGAAGTCTTCTTCAACCATGGGTGCTTCATCAAAGGATTATACTTTAAAACACT
AATTGTGGGAAACTCAGATCTTCCCTTGACTCCTATAAAGGAGGAAAGGAGCAGCGGGTCCAAGTCAGTCCCAAAACAACAGTCAGTCTAGTGATCATGCAAAACTGTGG
CATCTTCATGCAAAGAAGACACTAGGAGTTCAAATTCTGGTTCAGGAAGTGTTAGCAAGGTTTCTAGTGGTGCTTCTCGCCATCGGAAATCTAGCAATGGTATTCACTTG
AATACTCACACTGGAACACAGAAAATATCTGGGTCTGGAAAACTTAATGTGGTAAATAAAAGTTTGACTACTGAGAAGGCCTCCACTGCATCACATGAGAAGTCTCTAGA
TGTGTCACTTGTTGAACATGGATATAGTCGACTTGTTGTGAAGTTGCCAAACACCTGCAAAAGTCCAGTTGGAACTACTAGGCTTGTCACTGAAGATCAAGTTGTTTCAT
GTCACAAAGGATCTCTTCACGATGAGGTAGGTGATAACCGTGAAAAGAAAGCTAAAGGCAGAAGTGATTTGCATGGGGCTAGTTTTGCCACTGAAGCGCACTCAGACCGA
TGCCATAAGAAAGATCAATTTTTCGGCTCGGAGGAGGGTAAAGAGGTAGCTACCAGCAATGAACGATGCGGGCTTGTTGAAGCTGGTGAAGGCAATCCGataccactgct
tcatcgactggaattatatctaggccgggaaaaacatatgacacttctctaagctccataaatgccttgattgatagctgtgttaaattttcggagactaatgcatcacc
atcgccaggggatgttctagggatgaatcttcttgctagtgtggctactggggaaatatctaaatctaacaatgtgtctccgttggattctccccaggaacaatcaccta
caGCTGAAGAATCTTCTGCTGTCAATGATGGACAATCGAAACTTTGCCTGAAGAGAACAAAGTGAAGAAGTGTATGCTAATGGTGGTGGCCGGGGGGTCAGTCATCTTCT
GAGCCTCTTGGCAGCAATAACGTGTTGCATGATAGAAATGGATCTCATCCTGTCTCGACCAGCGCTGACTGTTTCTAGAGATGGAAGAGCTGTTGCATTTGGGTTGTTCA
GGAGCGGTAGTAAGCCATCTAATGCTCAGCAAAACATGGAGAGGACACCTTCAAAGTGTGATTAAAACCTGATGCTGAAGCACGCATGCCTCCATAGCTAGTGCGGAAGG
AAGGTAATGCAGAGACTGAGGAGACAGAATCAAGTCATTCTGATCAAAATGAACTAGAGGCAACAAAGGCTCCTTAAAGTGGAGGTAGTAGTTACCTGACTCATTATTGG
AAGAGGGTACTCCACTCCGTGAAAATGAAAAAGTTGATCAAACTGATGACAGAATGGCTGATAATGGAGTGATTTTGAAATCAGAAGTACTACAGCAACCCTTGAAGTGG
AAAAGCAAGTGGATGAAAAGCCATCTTGTTTATCTTCACAACTGAGTGGCGGTGATGTCAGACCCACAGCAACTTAAACAGTGGCAGTGGAGAAGAGAAACTGTCTTCTA
CACCGGAAACTCATGCAAACGCTCAGGGAGGGAAAGACTGAGGACTGCTGTGATGTTTCCTGATGCAAATCTTCTGATGCAGAATTTAAGGAGAAAAAATCAAATATTGT
GAActcagaaattcaagttaatcagggtcctctgtcagatcagaaagatgatcatgcaacggaggacttgggaagaacagatggcattaatgattgttgtggtagggttt
ctatgcacggggaatctcctgccatacccttaccagaagatgatcagggtgagaaattaagtttagatgttcctgagttggctggaaccaaagaccacgtcacttgtgca
aattcttcattttctgctccaaggtcagattcagtggtaaagctggactttgatctaaacgaaggttgttctgctgatgaagggacacaagatgagattattgggaattc
ctctgttcagctgcccgttatcccacctttctcaatcccttcagcatcagaaaacttccctgtttcaattactgtggcttctgctgcaaaaggatcagttgttccaccaa
caaactccctagcaaacagagttgaacttggatggaagggttcggctgctacaagtgcttttcgcagggcagaaccacggaaaaatcttgagttgccactcagtttaagt
gatgtacctcttgttaccaccactagcaaggaggggcgccaacctttggacttcgacctgaatgtgccagaccagagactcctagaagaagttactttgtcaaatttacc
acagaaagcaagtgttgaatcagggccttctgatcgaggtggtggacttgatcttgatttgaataaagctgatgaaagtcatgatgtgggcccatgttctgtgagcaagg
gtaggttggagctccccatgtcaagtaggccttttgtttctggtggattagggaattgtggattcagtggctccagaaactttgatttgaacaatggtccttcccttgat
gaaatgggggcagaaacagtgcctcttggtcagcagaataaaagctacatgccattttcatcacttctccctggaatgaaggtgaactctggagaaattgggaacttcta
ctcttggtttcctcaggggaacacatattcagcattaacagcaatcccatcagtcttgccaggtagaggagaacaaagttatgttcctgctgctgtttctcagagagtat
ttgctcctccgacaggcactggctttgctgctgaaatttatcgtgcaccagtgctttcttcctctcctgctttggcattcccacctgctaactcctttacttattctggg
ttccctttcgaaactagttttcctatacaatcaaatgcatattcaggttgctcaacatcgtacatggattcatcctctggctgttctcttggattccctaccattacttc
tcatttgttaggaccggctggggtagcccctaccccttattcaaggcccttcatcatgagctatgctagtggcagtggtactgttggtcctgagattggaaaatggggaa
gccagggtttggatcttaatgcaggtcatgggattatagataaagaaagaattgatgaaaaattgcctacaggattgagacaactttcagctcccagttcgcaacctttg
ctgatgagcagctcaagatgtttcagataggtggtacacacaagagaaaagaacctgacagtggcttagatggtgccgataggtttaactacaaacaccaatgagtgagg
gcagttgcatttccttgtggtcaccaaccaagtcctggccaaagaattacagaccgagaaaaaaaacagttttttacaggcaatagtggagcaaataatcaagaactgct
tatgaaagggctcgtactgttccctcacaaatgttgcagcaacatcactggtttccaggcaggtctgacattcttctctctggtggacacatttggacagattcgtttca
ctgaagcagacaaggtttcatttgtaaatatctaacttaatagaagcataaggaagttgctgtctagaacgctgatgaatggtgtgtccaataTgtggatggtttcccat
ccattcgatacactgtcaagccaaaccctttctcaatcctcatcttcacccttcggaacagactggaatgtaaggactttttttcgaggttgtggccggcctttgtcaat
gatactcaagctgtgttctttcccttacatatgtagttattacttcattcttactgttaggttctttttacactcttttttattgatagtaatacacagggcccctttct
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ta
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MHGESPAIPLPEDDQGEKLSLDVPELAGTKDHVTCANSSFSAPRSDSVVKLDFDLNEGCSADEGTQDEIIGNSSVQLPVIPPFSIPSASENFPVSITVASAAKGSVVPPT
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QGLDLNAGHGIIDKERIDEKLPTGLRQLSAPSSQPLLMSSSRCFR