; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C010138 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C010138
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr02:14443345..14444352
RNA-Seq ExpressionMELO3C010138
SyntenyMELO3C010138
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033290.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-4584.82Show/hide
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KAA0035181.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-61100Show/hide
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KAA0056515.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-4076.79Show/hide
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TYK21967.1 RING-H2 finger protein ATL66 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-5094.64Show/hide
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XP_008441954.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485953 [Cucumis melo]2.0e-4077.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4L3 uncharacterized protein LOC1034859539.5e-4177.68Show/hide
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A0A5A7SQU2 Putative nuclease HARBI15.8e-4684.82Show/hide
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A0A5A7T0R2 Retrotransposon protein3.7e-61100Show/hide
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A0A5A7U0H7 Retrotransposon protein9.5e-4177.68Show/hide
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A0A5D3DE65 RING-H2 finger protein ATL665.9e-5194.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGATTTGTCCTATGTCTTCGACAAAGATCAAAGATCGGGTAACAAAAGCGCGTTCAGAGACCTTTGCTGATATAGGATCTAATGTCCCAAACATGTTTAAT
GACGACGTTCCACTCGGTGATTCACATGATCAAGACATCCCGATGATGTATAGCCAAGGAGAGCATATGTCACCAGATGAGATCTTTGGAATACGTGCAGGTCAA
GCAAGTGAGAGAAAAAAATGTTCAAGTGGAAGTAAGAGGAAACGAGGTAGTGAACATTCTGAAACAGTAGAGATGATGAGGAGTGCATTAGAATTTGGAAATGAT
CAATTAAAGGCAATTGCAAATTGGCTAAAAGAGAAGCGTGCAATAGAGGTCGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTAAGTTCGTCACGAGCACCGAAACACACATGGACTAAAGAGGAAGAAGCAAAACTTGTTGAGTGCTTGGTGGAATTGGTTTCAGCTGGGGGATGGAGGTTC
GATAATGGGACATTTCGATTTGGGTACCTGGCCCAATTGCAATGAATGATGGTAGAGAAGTTGCCCGACACTAATATCCAAGGATCGCCGACAATAGATTGTCGT
GTGAAATCTCTTTAAAAAACCTACCAAGCAATTGCAGAAATGAGGGGGCCATCATGTAGTGACTTTAGATGGAATGAAGAATTCCATTGCATCATCGCATAACGA
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AGTGTGGAGGCTATTGAAGGATTCTTGTCGATTCCAACATAACTTAAATTTGAGTATTGCAATATTCTCTTGTAAAATTAGGGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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