; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C010692 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C010692
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionethylene-responsive transcription factor ESR1
Genome locationchr03:29046080..29047159
RNA-Seq ExpressionMELO3C010692
SyntenyMELO3C010692
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061059.1 ethylene-responsive transcription factor ESR1 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-19999.72Show/hide
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KAG6598241.1 Ethylene-responsive transcription factor ESR2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-10259.85Show/hide
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XP_008444372.1 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ESR1 [Cucumis melo]5.5e-200100Show/hide
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XP_038886431.1 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like [Benincasa hispida]8.3e-14880.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMT0 AP2/ERF domain-containing transcription factor4.3e-17489.86Show/hide
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A0A1S3BAY0 ethylene-responsive transcription factor ESR12.7e-200100Show/hide
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A0A5A7V5R7 Ethylene-responsive transcription factor ESR11.3e-19999.72Show/hide
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A0A6J1HFS9 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like3.7e-10161.79Show/hide
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        LNFPS+N ++   PS   NT  T        + +   PPPPP++       YSS+FLPKDSPDSGLLEE+IHGFFPKS  SN N +   D   +   N++
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A0A6J1K7P9 ethylene-responsive transcription factor ESR2-like2.4e-10060.22Show/hide
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        LNFPS+N ++   PS             NN++ TKI   PPP++       YSS+FLPKDSPDSGLLEE+IHGFFPKS +SN N ++  D   +   +++
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FYK5 Ethylene-responsive transcription factor ESR23.9e-2335.82Show/hide
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        ME    R    ++  T+ +       + ++T P +P   TT    +    +  S             T+RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTF
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        DTAEEAA AYDCAAR+MRGLKARTNFVYP                          +P L+S +  IFS                    SP ++M LLRD 
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Query:  LNFPSSNYNHSSKPSYP------INTTTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK
        LN  S + +  +  +YP      +N     +  N N     ++P          E+  S     +   SGLL+E++ GF PK
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Q9FZ90 Ethylene-responsive transcription factor ERF0873.6e-2158.42Show/hide
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        ++Y GVRRRPWGRYAAEIR+P +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARS+RGL ARTNFVY   P      S      S  ++   FN  P   L   NS+
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Query:  N
        N
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Q9M644 Ethylene-responsive transcription factor LEP5.6e-2257.63Show/hide
Query:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF
        TT+S S K+     +   GT R+ GVRRRPWGRYAAEIRDP +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARSMRG +ARTNFVY   PP     SS    I   
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Query:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI
        + PP    P    SN P+
Subjt:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI

Q9MAI5 Ethylene-responsive transcription factor 81.1e-2059.34Show/hide
Query:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP
        ++++  +RYRGVR+RPWGRYAAEIRDP  K R WLGTFDTA++AARAYD AAR  RG+KA+TNF V   S P   S   D     RF  PP
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Q9SAD4 Ethylene-responsive transcription factor ESR11.3e-2642.98Show/hide
Query:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP
        P T   T  T +  +     SS   T+    + S T RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAE+AA AYD AAR+ RG KARTNF YP++ 
Subjt:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP

Query:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN
          P          PRF+F  K S P   S+  P+ S P  +   +F  +  AQRI NT S     + LRD         + SS+ + P N +   ++++ 
Subjt:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN

Query:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS
        ++S T        EN  S F P++S D+GLL+EV+  F  K+
Subjt:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12980.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein9.2e-2842.98Show/hide
Query:  PTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSP
        P T   T  T +  +     SS   T+    + S T RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTFDTAE+AA AYD AAR+ RG KARTNF YP++ 
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Query:  PAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTP--NRGPDFLWSGHAQRI-NTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNHSSKPSYPINTTTTTTTNNN
          P          PRF+F  K S P   S+  P+ S P  +   +F  +  AQRI NT S     + LRD         + SS+ + P N +   ++++ 
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Query:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS
        ++S T        EN  S F P++S D+GLL+EV+  F  K+
Subjt:  NSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKS

AT1G24590.1 DORNROSCHEN-like2.8e-2435.82Show/hide
Query:  MEADSFRRVPIDNNNTSSNPFLDYQMKCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTF
        ME    R    ++  T+ +       + ++T P +P   TT    +    +  S             T+RYRGVRRRPWGRYAAEIRDP SKERRWLGTF
Subjt:  MEADSFRRVPIDNNNTSSNPFLDYQMKCNATTPTTPTATTTTTTTTTTTTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTF

Query:  DTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDF
        DTAEEAA AYDCAAR+MRGLKARTNFVYP                          +P L+S +  IFS                    SP ++M LLRD 
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Query:  LNFPSSNYNHSSKPSYP------INTTTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK
        LN  S + +  +  +YP      +N     +  N N     ++P          E+  S     +   SGLL+E++ GF PK
Subjt:  LNFPSSNYNHSSKPSYP------INTTTTTTTNNNNSSTTKITPPP------PPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPK

AT1G28160.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.6e-2258.42Show/hide
Query:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS
        ++Y GVRRRPWGRYAAEIR+P +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARS+RGL ARTNFVY   P      S      S  ++   FN  P   L   NS+
Subjt:  MRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLS------SDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSS

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT1G53170.1 ethylene response factor 87.5e-2259.34Show/hide
Query:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP
        ++++  +RYRGVR+RPWGRYAAEIRDP  K R WLGTFDTA++AARAYD AAR  RG+KA+TNF V   S P   S   D     RF  PP
Subjt:  NSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNF-VYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPP

AT5G13910.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein4.0e-2357.63Show/hide
Query:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF
        TT+S S K+     +   GT R+ GVRRRPWGRYAAEIRDP +KER WLGTFDTAEEAA AYD AARSMRG +ARTNFVY   PP     SS    I   
Subjt:  TTTSSSLKRTLRDHNSSSGTMRYRGVRRRPWGRYAAEIRDPQSKERRWLGTFDTAEEAARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRF

Query:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI
        + PP    P    SN P+
Subjt:  NFPPKHSLPRLNSSNWPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCCACCGCCACAACAACGACAACCACCACCACCACCACCACCACCACCAGTAGTAGTCTCAAGCGAACCCTCCGAGATCACAACTCCTCCAGTGGCACAATGAGA
TACCGTGGAGTCCGTCGCAGGCCTTGGGGCCGTTACGCAGCCGAGATTCGAGACCCTCAATCCAAAGAAAGAAGATGGCTTGGAACTTTCGACACTGCTGAAGAA
GCTGCACGTGCCTACGACTGCGCTGCACGCTCCATGCGTGGCCTGAAAGCTCGCACCAATTTCGTTTACCCTTCATCTCCACCCGCCCCTCATTCCCTCTCCTCC
GACGATTACTTAATCCCTCGCTTCAATTTCCCTCCTAAACACTCTCTCCCTCGCCTTAACTCCTCTAACTGGCCCATTTTTTCAACTCCAAATCGTGGGCCTGAC
TTCCTATGGTCCGGTCATGCACAGCGGATCAACACCGCTTCTCCCACTCTCGACATGCTTCTCCTTCGTGATTTCCTCAATTTCCCTTCTTCCAATTATAACCAT
TCCTCCAAACCCTCTTATCCTATTAATACCACCACCACTACTACTACTAATAATAATAATAGCAGCACTACCAAAATAACTCCTCCTCCTCCTCCTGAAAATTAC
TCCTCTGAATTTCTCCCCAAGGACTCCCCTGATTCCGGTTTATTGGAAGAGGTAATTCACGGCTTCTTTCCCAAATCACATGATTCCAACAATATCAACAACTCT
GACGATTATTTCAACAATAACGACGAAAACAAGAACGCCAATCTCAGTGGTCATAATTTGGACTTATTGGATTACCAATTGGCCGACGAAAACTTCAACAACAAC
AACACCGCCTTGATTAATCAAGATGCTCCCGATCACGGCCGTCTGTTTGGCGACGCTCACAACTTGATTCTGGATGATATTTTCCAATGTCCAGAGCTTTTAAAC
CCTTTTCCTTCTAAACTCCAAAACGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCCTCCAAACCCTCTTATCCTATTAATACCACCACCACTACTACTACTAATAATAATAATAGCAGCACTACCAAAATAACTCCTCCTCCTCCTCCTGAAAATTAC
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CCTTTTCCTTCTAAACTCCAAAACGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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AARAYDCAARSMRGLKARTNFVYPSSPPAPHSLSSDDYLIPRFNFPPKHSLPRLNSSNWPIFSTPNRGPDFLWSGHAQRINTASPTLDMLLLRDFLNFPSSNYNH
SSKPSYPINTTTTTTTNNNNSSTTKITPPPPPENYSSEFLPKDSPDSGLLEEVIHGFFPKSHDSNNINNSDDYFNNNDENKNANLSGHNLDLLDYQLADENFNNN
NTALINQDAPDHGRLFGDAHNLILDDIFQCPELLNPFPSKLQNA