; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C010783 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C010783
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptiontranscription factor bHLH49 isoform X1
Genome locationchr03:28490178..28492796
RNA-Seq ExpressionMELO3C010783
SyntenyMELO3C010783
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-18199.71Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]5.5e-141100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein1.3e-16792.38Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X14.0e-182100Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X22.7e-141100Show/hide
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A0A2K2AGW6 BHLH domain-containing protein8.8e-4443.33Show/hide
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            QI N  CP +Y +            ++++ +S +  + + P   N  +R+ V  SNS   PNKNAE       +  +++I  + D K QK+E   S
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        AN   K  +KQAK   Q+ ++PK++YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM++LQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA V 
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         E   + E+I         S ++L  RG N
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X12.0e-18199.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q69WS3 Transcription factor BHLH0944.4e-2456.14Show/hide
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        +  +DK   +  R  A  ++ + SK A   +   + PK++YI V+ARRG+A ++HSLAER RREKISERMK+LQ LVPGC+++ GK  VLDEIINY+QSL
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Q6NKN9 Transcription factor bHLH744.8e-3151.45Show/hide
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        D++QK +H+     N +S     K  SQ+ ++PKENYI ++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQV
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        EFLSMKLA V  E +++ ++IL        + ++L  R     D  + T   +P   FQ  G  P +  TT+P
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Q9C670 Transcription factor bHLH762.3e-2555.97Show/hide
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        DK QK E   ++N N  +  KQ         S K+ YI ++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC ++TGK V+LDEIINYVQSLQ Q+
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        EFLSMKL+ V   L+ +LE+   LL  ++  SS+
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Q9CAA9 Transcription factor bHLH497.7e-2938.46Show/hide
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        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E+        Q+     SN+   
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Query:  NKNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPG
         +N + N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPG
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        C+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
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Q9SRT2 Transcription factor bHLH621.4e-2549.67Show/hide
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        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
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Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL++V        +  LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.4e-3251.45Show/hide
Query:  DKTQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQV
        D++QK +H+     N +S     K  SQ+ ++PKENYI ++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQV
Subjt:  DKTQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQV

Query:  EFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDHRSRTFHTSPHVMFQLYGTRPTMPKTTSP
        EFLSMKLA V  E +++ ++IL        + ++L  R     D  + T   +P   FQ  G  P +  TT+P
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AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.5e-3038.46Show/hide
Query:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSP
        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E+        Q+     SN+   
Subjt:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSP

Query:  NKNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPG
         +N + N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPG
Subjt:  NKNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPG

Query:  CHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL
        C+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
Subjt:  CHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL

AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.5e-3038.46Show/hide
Query:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSP
        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E+        Q+     SN+   
Subjt:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNEN--------QRKFVVGSNSSSP

Query:  NKNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPG
         +N + N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPG
Subjt:  NKNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPG

Query:  CHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL
        C+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
Subjt:  CHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.0e-2838.62Show/hide
Query:  FDMFGSGNFSDMVG-------SLGFLTEAD-------HSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDVKSQ---PDRVNE-------NQRKFVVGSNSSSPN
        F +F  GNFSDMV        ++G   +          S   N+  P + V +   E  V      K        V+E       N +K    S+++   
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Query:  KNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC
        K    N   A +    ++++       +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YI V+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC
Subjt:  KNAEDNLNVATTEILNKADK------TQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC

Query:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL
        +++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA V  +     E +L
Subjt:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQIL

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.6e-2749.67Show/hide
Query:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDSKQAKGGSQNVQ-----SPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDSKQAKGGSQNVQ-----SPKENYIRVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL++V        +  LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAATAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCACAGTCAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAATGAAAATCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCAACAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGAAAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAG
ATAGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAAGCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTTATCGATGAAACTCGCAAATGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACC
TTTCATCATCGAACGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCATAGATCAAGGACATTTCACACAAGTCCTCATGTGATGTTCCAACTTTATGGAACAAGGCCA
ACCATGCCAAAAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACACTTTGATTTATCCTTATAATTTTGATTCTCCTAAGAAAAAAAGAAACCCCGTTTTGTTCTTTTTCATTTTAACTATGAATTTTGGCTTTGATTTTTAGGCTAAA
GGAGACCAACCCGAACTTTACTGTCTATCAATCACAATGATGTTTGGATTCAAAGGATTTGTCAAAATTACTTTCTTCTTCTTCCACACTCAAAAGTGAAAGTGAAGAAA
AGTAAGGAATCTGTTTCTTTTTTTTCTAAGTCTCTCTTGAGCTGTTACTTAGCTAAGGCCATTGTTTTTTCATATTTGTCTCAACTTTATGCTCTGAAAGGTTCTTTCAC
TTTATAATGTTTGTTAGATTTTATGCTTCACATATTAGATTTCCTTTTGGTTTCATAAAGCTGCATATTTTACTTTTTCCTGTTTACTCCTTTCTATGAAATCACCACCT
TCCCAACTTTGGTCAAACTCCTCTTCTTCAGCTTCTCTTTTACACTTCTAAATTTCAGTCCTTTATTCGGTTTTTCTGACACACAAGTTTAGTATAGTATCCTTTGGTTT
TTCTTTTTCTTTTGAATTTGGTTTGGCTGCCCAAATTGGGAAATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAATAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCA
GCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGGATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCA
TTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATATGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCTGATATGGTGGGTTCTTTAGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCACAGT
CAGATCGCCAATATTAAATGTCCATTTAGTTATGTGCAAATTCTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGTAAAGTCTCAACCCGATCGCGTTAATGAAAA
TCAAAGAAAATTTGTTGTTGGTTCCAATTCTTCCAGCCCAAATAAGAATGCTGAAGATAACTTGAATGTGGCAACAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGA
AAGTGGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAGATAGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAATCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAA
GCGCGACGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAAAGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCA
GATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATCAACTATGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTTTATCGATGAAACTCGCAAATGTCGGACTAGAATCAA
GCTTGGAGACAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACCTTTCATCATCGAACGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCATAGATCAAGGACATTTCAC
ACAAGTCCTCATGTGATGTTCCAACTTTATGGAACAAGGCCAACCATGCCAAAAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAACCTTTTCAAGATGAAAGGATAATCAGTAGATG
ATCAAAATTATGCAGCTGCAAAAACCAGAGATGGATGTCAGTATTTATCCTTTGATAGTCATTACATGTGGCGCAGCAAATTAATTAAAGACAGCAATGTAAAAACAGTA
CTCATTTGATTGAATTCAAATGTTGTTCTTAATCTTACACATACTTTTTAATCAAATCTTACTTTATCTTCTAGATTTTCTATCTAAAACAATAAACTTGCTTATTCTAT
TCCCCAAGTGAGAGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGSTSGFQCEIMKCSFGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELSTASLENEGVKTISNLLHDPSTLSFDMFGSGNFSDMVGSLGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQI
LDDEEMVSPKNDVKSQPDRVNENQRKFVVGSNSSSPNKNAEDNLNVATTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDSKQAKGGSQNVQSPKENYIRVQARRGRAANNHSLAE
RVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLANVGLESSLETEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDHRSRTFHTSPHVMFQLYGTRP
TMPKTTSPSTF