; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C013675 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C013675
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTOX high mobility group box family member 4-A, putative isoform 4
Genome locationchr11:19436586..19439226
RNA-Seq ExpressionMELO3C013675
SyntenyMELO3C013675
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012862 - Protein of unknown function DUF1635


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061953.1 TPRXL protein [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-16499.68Show/hide
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XP_022948173.1 uncharacterized protein LOC111451829 [Cucurbita moschata]1.3e-14489.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHV7 Uncharacterized protein1.0e-16395.64Show/hide
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A0A1S3BKE0 Uncharacterized protein8.0e-172100Show/hide
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A0A5A7V1C9 TPRXL protein2.1e-16499.68Show/hide
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A0A6J1G8N0 uncharacterized protein LOC1114518296.3e-14589.13Show/hide
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A0A6J1KYE1 uncharacterized protein LOC111499860 isoform X15.8e-13886.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28140.1 Protein of unknown function (DUF1635)5.5e-1630.13Show/hide
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AT2G28690.1 Protein of unknown function (DUF1635)9.6e-4547.06Show/hide
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AT3G44940.1 Protein of unknown function (DUF1635)9.4e-1632.21Show/hide
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        +  E+L+Q L+ TT ELE  K+ A EE  K  E++  L  +L    +ERDEA ++    L+N ++     +       Q +  +  P    SSI E   +
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AT5G22930.1 Protein of unknown function (DUF1635)4.8e-2034.71Show/hide
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        +  E+++Q LL TT EL+  KM A EE  K  E++  L  +L    +ERDEA ++ Q+LM                                  +S+SL 
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        +   H +   S A S  D    P    +N + SS  S   +  +S  ++   PP        + E+      ++D L + + LP+KGKLLQAV +AGPLL
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        QTLL+AGPLPQWR+ PPPL++F+IPP+ V      NGC   N
Subjt:  QTLLVAGPLPQWRN-PPPLQTFKIPPLLV------NGCNTKN

AT5G59760.1 Protein of unknown function (DUF1635)5.5e-2435.56Show/hide
Query:  SLWRFQENVEDLKQKLLQTTFELESLKMEASEESIKNKEKVKSLLLLLQAAYEERDEARDQLQKLMNKIMPTTATELPALLHFQPESPLNIPTKANSSIT
        S W  QE++++++Q L  T FELE+LKMEA+E+S  ++E+V  LL LL+   +ERDEAR QL +               + H Q ++P       + S+T
Subjt:  SLWRFQENVEDLKQKLLQTTFELESLKMEASEESIKNKEKVKSLLLLLQAAYEERDEARDQLQKLMNKIMPTTATELPALLHFQPESPLNIPTKANSSIT

Query:  ESNSLYETYNHHSYGSSPADSFFDGVSSPDFSTANMADSSKISFVNQPFVSEYNNAPQPPLATGLDTPKTEKTDPFSAVIDNLAKGRALPQKGKLLQAVT
        +SNS   + +  S  SS   +F                               N  PQP   T L+ P           +D L  G+A P+ GKLL+AV 
Subjt:  ESNSLYETYNHHSYGSSPADSFFDGVSSPDFSTANMADSSKISFVNQPFVSEYNNAPQPPLATGLDTPKTEKTDPFSAVIDNLAKGRALPQKGKLLQAVT

Query:  EAGPLLQTLLVAGPLPQWRNPPP---LQTFKIPPLLVNG
        EAGPLL+TLL+AGPLP+W NPPP    Q F++P +   G
Subjt:  EAGPLLQTLLVAGPLPQWRNPPP---LQTFKIPPLLVNG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGATTTGGGCAGTTTATGGAGATTTCAGGAGAACGTGGAGGATTTGAAGCAGAAACTCCTACAGACGACTTTTGAACTTGAGTCACTAAAAATGGAAGCAAGCGA
AGAAAGTATTAAGAACAAAGAGAAAGTGAAGAGCTTACTTCTTCTATTGCAGGCAGCATACGAAGAAAGAGATGAAGCAAGAGATCAACTGCAAAAACTGATGAACAAGA
TAATGCCAACTACTGCAACTGAATTACCAGCTCTGCTTCATTTCCAACCTGAAAGCCCTCTCAACATACCTACAAAAGCAAATTCAAGCATCACAGAATCAAATAGTCTC
TATGAAACTTATAATCATCATTCATATGGTTCTTCACCAGCAGATTCGTTCTTCGATGGAGTTTCATCACCCGATTTCTCCACTGCAAACATGGCCGATTCAAGCAAAAT
AAGTTTTGTAAATCAGCCCTTTGTCTCAGAGTATAATAATGCCCCTCAACCTCCTCTGGCAACAGGACTTGACACTCCAAAAACAGAAAAGACCGATCCATTCTCTGCAG
TGATCGATAACCTTGCTAAGGGAAGAGCATTACCTCAGAAAGGGAAGCTCCTGCAAGCTGTTACAGAGGCCGGTCCTTTACTTCAGACACTTCTCGTTGCTGGGCCTCTT
CCACAATGGCGTAATCCTCCGCCATTGCAAACTTTCAAGATTCCCCCTCTTCTAGTGAACGGCTGCAACACTAAAAATATCAATCAAAATCCTTCTTCAAAAGCCAGCAG
CTCTTCCCCAAAGCCTCTCCATTCTCTTTTACACGCTGAAATGTCGTCCCGTGGGTCTTCTCAAATTTGTTCAGCTTCCTCTACGTTGAGTTTCACAAATGGTCCTTCTG
GTTCTTGCATCAACAGCGCCTTGATGATGGCTCCAAATGTTAACCACACTCAGATTCTAGCAGCCAAGAGACAGAAAATTCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTTAACCCAACAAGAAACCCTTTTTCAAAGTGAATTAAAAGTTGTAATATTCCAATTTTCTACTGATTACTTGGATCCATATTGTTAGACACCACAGAAATGGATGAA
ATATGGGCTTCCATGGGCCCATTTCTCCAACAAGTAAAACCCCTTTGTACAAATAAAAATGTTGCAGGAGAGAGAGAAGGAGAGCCGCCGGGGGAAATTAAAATTTAAAA
GGAGATAATTTGGGATTTTAAATCTTTATTTAGAGTCTAAGCTTAGAAAAGGTAGGCATTTTGTATTTGTATTGTAGCGACAAGAATTTAAATAAGGGAAATCTAACCGG
TCTTTACTGCTTGACCTTCATGTGAGAGAAAGAGAGTCCTCTGTTTCCATTTTTGAGCAAAGAGAAAGAAGAGGTTTATAATGGAATTCAATACGCCCTTCCTCTCGGGC
GTAGAATTTGGAATTTCATTTCTTTCTATACTTGACCCTCCCCCCACCTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTCTACTAATTTCTTTCTTGATGTCGACTGCCTTTCTCTGGA
ACTTTGTGAGAGAGAGAAAAAAAAACCCATTTCTCTCTCTCTCTAGCTTATACCTGTCCTATCATTCACATCAATTTATAAATGTCTCAGGGTTCAACTTTCTTTCTTAA
ACTCCCCTCTATACTTTTCTCCCTTCCTCCCTTCCTCCCTTCATATTAGGCAAGCAGTAGAAACAACTATGGAGGATTTGGGCAGTTTATGGAGATTTCAGGAGAACGTG
GAGGATTTGAAGCAGAAACTCCTACAGACGACTTTTGAACTTGAGTCACTAAAAATGGAAGCAAGCGAAGAAAGTATTAAGAACAAAGAGAAAGTGAAGAGCTTACTTCT
TCTATTGCAGGCAGCATACGAAGAAAGAGATGAAGCAAGAGATCAACTGCAAAAACTGATGAACAAGATAATGCCAACTACTGCAACTGAATTACCAGCTCTGCTTCATT
TCCAACCTGAAAGCCCTCTCAACATACCTACAAAAGCAAATTCAAGCATCACAGAATCAAATAGTCTCTATGAAACTTATAATCATCATTCATATGGTTCTTCACCAGCA
GATTCGTTCTTCGATGGAGTTTCATCACCCGATTTCTCCACTGCAAACATGGCCGATTCAAGCAAAATAAGTTTTGTAAATCAGCCCTTTGTCTCAGAGTATAATAATGC
CCCTCAACCTCCTCTGGCAACAGGACTTGACACTCCAAAAACAGAAAAGACCGATCCATTCTCTGCAGTGATCGATAACCTTGCTAAGGGAAGAGCATTACCTCAGAAAG
GGAAGCTCCTGCAAGCTGTTACAGAGGCCGGTCCTTTACTTCAGACACTTCTCGTTGCTGGGCCTCTTCCACAATGGCGTAATCCTCCGCCATTGCAAACTTTCAAGATT
CCCCCTCTTCTAGTGAACGGCTGCAACACTAAAAATATCAATCAAAATCCTTCTTCAAAAGCCAGCAGCTCTTCCCCAAAGCCTCTCCATTCTCTTTTACACGCTGAAAT
GTCGTCCCGTGGGTCTTCTCAAATTTGTTCAGCTTCCTCTACGTTGAGTTTCACAAATGGTCCTTCTGGTTCTTGCATCAACAGCGCCTTGATGATGGCTCCAAATGTTA
ACCACACTCAGATTCTAGCAGCCAAGAGACAGAAAATTCAGTGACCACCATTGTACAAATTCAAGATTGATCTGGAGTTGGCAGTGTAAAAAATGACTTGATAGTAGTTT
TATTGACGAGATTTGAAGTTTTAATTACATCAAAAATTAACTTCATCGGCCATCATTCCAATCAATCTCAACTTCAATTTTCTTTTTCCTCACAGCAGAAAAAAATGACA
ACAAACAGTGACAACAAACTTTTAACTTCTTGCATTATTATCTAAATACAATAACTAGTATTCGATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDLGSLWRFQENVEDLKQKLLQTTFELESLKMEASEESIKNKEKVKSLLLLLQAAYEERDEARDQLQKLMNKIMPTTATELPALLHFQPESPLNIPTKANSSITESNSL
YETYNHHSYGSSPADSFFDGVSSPDFSTANMADSSKISFVNQPFVSEYNNAPQPPLATGLDTPKTEKTDPFSAVIDNLAKGRALPQKGKLLQAVTEAGPLLQTLLVAGPL
PQWRNPPPLQTFKIPPLLVNGCNTKNINQNPSSKASSSSPKPLHSLLHAEMSSRGSSQICSASSTLSFTNGPSGSCINSALMMAPNVNHTQILAAKRQKIQ