; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C014835 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C014835
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionCell wall protein DAN4-like
Genome locationchr06:22005731..22006210
RNA-Seq ExpressionMELO3C014835
SyntenyMELO3C014835
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056279.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]5.1e-2684.31Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFFTNGF
        MAYQSLA LALIIVAVTGAVAQAP+TSPTS+PATMTSS  SS+S  S+   TTT SSADASSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS ETSR FTNGF
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFFTNGF

Query:  FG
        FG
Subjt:  FG

KAA0056285.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-3293.4Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF
        MAYQSLALLALI+VAVTGAVAQAPSTSPTSSP TMTSSVDSSTSSSSSLDS    TTTTSSADASSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF

Query:  TNGFFG
        TNGFFG
Subjt:  TNGFFG

KGN58213.1 hypothetical protein Csa_017497 [Cucumis sativus]8.7e-1871.68Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTT------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS
        MAYQSLA LALIIVA+TGAVAQ P++S   PT  S+PA MT    SS+SSSSSLDSTTTT      SS D+ SISAAP  SPDSSAQSPTTATSP+GSPS
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTT------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS

Query:  GETSRFFTNGFFG
         ETSR F+NGFFG
Subjt:  GETSRFFTNGFFG

XP_008450206.1 PREDICTED: cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo]5.6e-2582.86Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS-----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRF
        MAYQSLA L LIIVA+TG VAQAPSTSPTS+PATMTSS DSSTSSSSSLDS     TTTTSS D SSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGS S ETSR 
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS-----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRF

Query:  FTNGF
        F+NGF
Subjt:  FTNGF

XP_031737565.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]1.6e-1670.34Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSST-SSSSSLDSTTTT----------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSP
        MAYQSLA LALIIVAVTG VAQ P++S   PT  S+PA  TSS DSST SSSSSLDSTTTT          SSAD+ SIS AP  +PDS AQSPTTA SP
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSST-SSSSSLDSTTTT----------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSP

Query:  TGSPSGETSRFFTNGFFG
        TGS S ETSRFFTNGFFG
Subjt:  TGSPSGETSRFFTNGFFG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8Q5 Uncharacterized protein4.2e-1871.68Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTT------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS
        MAYQSLA LALIIVA+TGAVAQ P++S   PT  S+PA MT    SS+SSSSSLDSTTTT      SS D+ SISAAP  SPDSSAQSPTTATSP+GSPS
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTS---PT--SSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTT------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS

Query:  GETSRFFTNGFFG
         ETSR F+NGFFG
Subjt:  GETSRFFTNGFFG

A0A0A0LB81 Uncharacterized protein7.9e-1770.8Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSST-SSSSSLDSTTTT----------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS
        MAYQSLA LALIIVAVTG VAQ P+   +S+PA  TSS DSST SSSSSLDSTTTT          SSAD+ SIS AP  +PDS AQSPTTA SPTGS S
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSST-SSSSSLDSTTTT----------SSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS

Query:  GETSRFFTNGFFG
         ETSRFFTNGFFG
Subjt:  GETSRFFTNGFFG

A0A1S3BPQ2 cell wall protein DAN4-like2.7e-2582.86Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS-----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRF
        MAYQSLA L LIIVA+TG VAQAPSTSPTS+PATMTSS DSSTSSSSSLDS     TTTTSS D SSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGS S ETSR 
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS-----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRF

Query:  FTNGF
        F+NGF
Subjt:  FTNGF

A0A5D3C1H7 Cell wall protein DAN4-like1.3e-3293.4Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF
        MAYQSLALLALI+VAVTGAVAQAPSTSPTSSP TMTSSVDSSTSSSSSLDS    TTTTSSADASSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDS----TTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFF

Query:  TNGFFG
        TNGFFG
Subjt:  TNGFFG

A0A5D3C1I1 Cell wall protein DAN4-like2.5e-2684.31Show/hide
Query:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFFTNGF
        MAYQSLA LALIIVAVTGAVAQAP+TSPTS+PATMTSS  SS+S  S+   TTT SSADASSIS APAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPS ETSR FTNGF
Subjt:  MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFFTNGF

Query:  FG
        FG
Subjt:  FG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTATCAATCTCTTGCACTCTTGGCTCTCATCATTGTCGCCGTCACTGGTGCTGTTGCTCAGGCTCCTTCTACCTCCCCCACCTCCTCTCCAGCTACCATG
ACCTCCTCAGTTGATTCCTCTACTTCGTCTTCATCTTCACTCGATTCAACTACCACCACTTCCTCGGCCGATGCTTCATCAATCTCAGCAGCTCCAGCATTCTCA
CCCGATTCCTCTGCTCAATCACCAACGACCGCCACATCTCCCACCGGTTCTCCATCTGGTGAGACTTCTCGCTTCTTTACAAATGGTTTTTTCGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCGATCCTTTTTTTCCATCTTCTTTTTCTTCAATATCATCTCTTACATTAATTATCATAATGGCTTATCAATCTCTTGCACTCTTGGCTCTCATCATTGTCGCC
GTCACTGGTGCTGTTGCTCAGGCTCCTTCTACCTCCCCCACCTCCTCTCCAGCTACCATGACCTCCTCAGTTGATTCCTCTACTTCGTCTTCATCTTCACTCGAT
TCAACTACCACCACTTCCTCGGCCGATGCTTCATCAATCTCAGCAGCTCCAGCATTCTCACCCGATTCCTCTGCTCAATCACCAACGACCGCCACATCTCCCACC
GGTTCTCCATCTGGTGAGACTTCTCGCTTCTTTACAAATGGTTTTTTCGGCTGAAAATTTTATGGAGAGGAGATTCAAATCTCAACTTTTGGTAGAGACTAATAT
TATTTTAATCGTATGAGCTATGCTCCTCGAGGCAATGTAGTCGTCGAGTCATAATTTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYQSLALLALIIVAVTGAVAQAPSTSPTSSPATMTSSVDSSTSSSSSLDSTTTTSSADASSISAAPAFSPDSSAQSPTTATSPTGSPSGETSRFFTNGFFG