; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C016486 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C016486
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationchr06:27523199..27526364
RNA-Seq ExpressionMELO3C016486
SyntenyMELO3C016486
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein4.7e-10698.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X14.3e-107100Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD14.4e-10496.52Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like1.2e-10496.52Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like1.2e-10496.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM12.1e-8779.71Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC14.8e-8778.22Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM21.1e-8678.71Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c8.1e-8777.61Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.3e-9284.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.6e-8576.24Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.1e-6258.45Show/hide
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        ++YDYL KLLLIGDS VGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVT+  SFNNI+ W
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +A A+E GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++  G    K            
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        +KS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein9.2e-9484.16Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C5.8e-8877.61Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.9e-8677.11Show/hide
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        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNN+K
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        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV T+TAKAFA+ELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+S CC
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Query:  S
        S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTGATAGATATGCTAATGATAGTGTATGCAAGCTTTTAGTAGGAAATAAGTGTGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTTGACACGCAGACAGCGAAGGCATTTGCA
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ATAATGGTATAATCTAAGTTAACAAGTTTCTTAAGAAGATGAAATTGTGTTTACTTTGTGTTGGCTCAAGGATCTCTATGTAATTGTGAATTATTCCCCGTTTGA
ATCCTTGTGTGTATAAATGCTTTGTGACAGTTACCTTTGGATACTCTCTCTCCCTCTCCTAATCACCACTATATGCTAAAGTTTGGAGAGAATTATATCAGTGTA
GTTTGGAGTAAAGAAAACTATTCTGACATTCATTGAGTATAGTTTCATTATGTCAAATGTTAATTCTGGGACACGTCCAAGCCACATCACTGTTGCTCGATTAGG
CA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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