; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C018242 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C018242
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionNAC domain-containing protein
Genome locationchr04:7532763..7534463
RNA-Seq ExpressionMELO3C018242
SyntenyMELO3C018242
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003441 - NAC domain
IPR036093 - NAC domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3C0D5 NAC domain-containing protein 72-like3.3e-144100Show/hide
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A0A6J1IWL3 NAC domain-containing protein 72-like2.2e-10376.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A3Q7HH64 NAC domain-containing protein JA2L1.0e-6562.1Show/hide
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Q93VY3 NAC domain-containing protein 725.0e-6557.42Show/hide
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        S +Q+           E S  GSSS+ SSS LDDVL+S PEIKD  F+LPR+NSL T+               + NFDWAS A      G N + ELAP 
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Q9C932 NAC domain-containing protein 196.1e-6355.43Show/hide
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Q9LDY8 NAC domain-containing protein 553.7e-6053.58Show/hide
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         EL          GL  +   +P+ +      +Q+ + G  RF+N   +  N  FS +  NGFG+
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Q9SQL0 NAC domain-containing protein JA21.6e-6364.42Show/hide
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        SS  K P M+   SS E S+G  SST SSS  DD+LESLPE+ D   +LPR+NSL       +  KF    + S NFDWA  A      G   + EL P 
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         Q+    G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01720.1 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein1.4e-4171.43Show/hide
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AT1G52890.1 NAC domain containing protein 194.3e-6455.43Show/hide
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Query:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGG-SSSTCSSSHLDDVLESL-PEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNH-LMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAEL
        SSAQK        ++ E SN G SS+T SSSH +DVL+S   EI +  F     N + +L+ D    K   H L  ++NFDWAS A   + E  NSV EL
Subjt:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGG-SSSTCSSSHLDDVLESL-PEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNH-LMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAEL

Query:  APLTQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSGFQRFHNFGWLQK--------NFSNSGNGFGF
             S     L  +  Y+          E+EV+S    F+N G L +         +S    GFGF
Subjt:  APLTQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSGFQRFHNFGWLQK--------NFSNSGNGFGF

AT3G15500.1 NAC domain containing protein 32.6e-6153.58Show/hide
Query:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN
        +FGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDK+IST+G++VGIKKALVFY+GKAPKGTKTNWIMHEYRLI+ SR+ GSTKLDDWVLCRIYKK 
Subjt:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN

Query:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMG------STNFDWASAAAGTSFEGYNSV
        +SAQK        S  E SN GSS++ SS   DDVLESL EI +         S   L   H  +   NH  G        +FDWA+        G NSV
Subjt:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMG------STNFDWASAAAGTSFEGYNSV

Query:  AELAPLTQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSGFQRFHNFGWLQKN--FS-NSGNGFGF
         EL          GL  +   +P+ +      +Q+ + G  RF+N   +  N  FS +  NGFG+
Subjt:  AELAPLTQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSGFQRFHNFGWLQKN--FS-NSGNGFGF

AT4G27410.2 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein3.5e-6657.42Show/hide
Query:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN
        +FGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKII+  G++VGIKKALVFY GKAPKGTKTNWIMHEYRLI+ SR  GS+KLDDWVLCRIYKK 
Subjt:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN

Query:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAELAPL
        S +Q+           E S  GSSS+ SSS LDDVL+S PEIKD  F+LPR+NSL T+               + NFDWAS A      G N + ELAP 
Subjt:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAELAPL

Query:  TQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSG-FQRFHNFGWLQKNFSNSGNGFG
              +GL S   Y          AE E +SG   R  N   L ++F  S +GFG
Subjt:  TQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSG-FQRFHNFGWLQKNFSNSGNGFG

AT4G27410.3 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein3.5e-6657.42Show/hide
Query:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN
        +FGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKII+  G++VGIKKALVFY GKAPKGTKTNWIMHEYRLI+ SR  GS+KLDDWVLCRIYKK 
Subjt:  MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKN

Query:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAELAPL
        S +Q+           E S  GSSS+ SSS LDDVL+S PEIKD  F+LPR+NSL T+               + NFDWAS A      G N + ELAP 
Subjt:  SSAQKLPPMTSSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAELAPL

Query:  TQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSG-FQRFHNFGWLQKNFSNSGNGFG
              +GL S   Y          AE E +SG   R  N   L ++F  S +GFG
Subjt:  TQSQAPSGLISSDMYIPACQPPRSTAEQEVQSG-FQRFHNFGWLQKNFSNSGNGFG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGGAGAAAAAGAATGGTATTTTTTCAGTCCAAGAGACCGAAAATATCCAAACGGGTCAAGACCTAACCGGGTCGCTGGATCGGGATATTGGAAGGCTACCGGAAC
CGATAAGATTATAAGTACTCAAGGGAAAAAAGTTGGCATTAAAAAGGCTCTTGTTTTCTATGTTGGGAAAGCTCCTAAAGGAACTAAAACCAATTGGATCATGCATGAAT
ATCGCCTCATTGATACTTCCCGCAAGACCGGTAGTACTAAGCTGGATGATTGGGTTTTATGCCGAATATACAAGAAGAATTCAAGTGCGCAAAAGCTGCCACCAATGACG
AGTAGCATTTCGAGTATGGAATGCAGCAATGGGGGCTCATCGTCCACGTGTTCTTCCTCGCACCTCGACGACGTTCTCGAGTCGTTGCCCGAAATTAAAGACGGGTTGTT
CAGCTTGCCTAGAGTTAATTCTCTCCTAACTTTACAGCAAGATCACGAGAATCTCAAGTTTCAGAATCATCTTATGGGGTCCACTAATTTCGACTGGGCCTCCGCCGCCG
CCGGAACTTCCTTTGAAGGCTACAACTCGGTCGCCGAACTCGCTCCTCTGACTCAGTCTCAGGCTCCGTCGGGGCTTATTAGTTCCGACATGTATATTCCGGCCTGCCAA
CCGCCGAGGAGCACGGCGGAGCAGGAAGTACAGAGTGGATTTCAACGGTTTCATAACTTTGGTTGGTTGCAGAAAAATTTCTCCAACTCCGGCAACGGTTTTGGGTTTTG
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAACCCATTAAACTAAAAAGCCTCCATTATTCTTGTTCCATCTTTAAACAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAGAAGAAACATGGGA
GTAGCTGAAAAAGATCCACTTTCAGAGCTTAGTCTGCCGCCGGGATTCCGATTTTACCCAACTGACGAAGAGCTTTTAGTTCAATATCTCTGCCGAAAAGTCGCCGGCCA
CCATTTCTCCCTTCAAATTATCGGCGACATCGACCTCTACAAATTCGACCCTTGGGTTCTCCCTAGTACGTATTCAGAAAAATATTATATCATTTCCATTTTAATTTTTC
TTAATTCAAAAAGGTTAATTACTAATATTTATTATAATTATTTTTTAATTTTTTTGGTTTTGCAGGTAAGGCGATGTTTGGAGAAAAAGAATGGTATTTTTTCAGTCCAA
GAGACCGAAAATATCCAAACGGGTCAAGACCTAACCGGGTCGCTGGATCGGGATATTGGAAGGCTACCGGAACCGATAAGATTATAAGTACTCAAGGGAAAAAAGTTGGC
ATTAAAAAGGCTCTTGTTTTCTATGTTGGGAAAGCTCCTAAAGGAACTAAAACCAATTGGATCATGCATGAATATCGCCTCATTGATACTTCCCGCAAGACCGGTAGTAC
TAAGCTGGATGATTGGGTTTTATGCCGAATATACAAGAAGAATTCAAGTGCGCAAAAGCTGCCACCAATGACGAGTAGCATTTCGAGTATGGAATGCAGCAATGGGGGCT
CATCGTCCACGTGTTCTTCCTCGCACCTCGACGACGTTCTCGAGTCGTTGCCCGAAATTAAAGACGGGTTGTTCAGCTTGCCTAGAGTTAATTCTCTCCTAACTTTACAG
CAAGATCACGAGAATCTCAAGTTTCAGAATCATCTTATGGGGTCCACTAATTTCGACTGGGCCTCCGCCGCCGCCGGAACTTCCTTTGAAGGCTACAACTCGGTCGCCGA
ACTCGCTCCTCTGACTCAGTCTCAGGCTCCGTCGGGGCTTATTAGTTCCGACATGTATATTCCGGCCTGCCAACCGCCGAGGAGCACGGCGGAGCAGGAAGTACAGAGTG
GATTTCAACGGTTTCATAACTTTGGTTGGTTGCAGAAAAATTTCTCCAACTCCGGCAACGGTTTTGGGTTTTGAAAAATGTCCGGTGACCGGTTTGGCCAGAGTTGGTGC
GGTTTTGGGGGAGCGGGTTGGAAGAGTCTTTGTGTAGATAATTCTTTGGGCTAACATTTGGGACTTCAAAAACACGACAAAAAAAAATTAGGTCCAAAATTTGAGGCAAT
TTTTACTCTAATACTTCCATAAAATATTTGCACTTTTGATTAAATGTCCTGATAAATGTTGTAGTTTTACCATATGGTAAATTTTTGTTTGAACATTTTATTGAAAAAGC
ATTCTCATGGCTTTTAATGAATCATATAAGTTAGGAATAATATCAAGTTATATTTTTAAATTGTATCAAATTTGAATCAAAGTTTTTGTAATGGTACCAATTTACCCCTT
ATCGGAATCAATATGAAAATAAGCTCCAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIISTQGKKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLIDTSRKTGSTKLDDWVLCRIYKKNSSAQKLPPMT
SSISSMECSNGGSSSTCSSSHLDDVLESLPEIKDGLFSLPRVNSLLTLQQDHENLKFQNHLMGSTNFDWASAAAGTSFEGYNSVAELAPLTQSQAPSGLISSDMYIPACQ
PPRSTAEQEVQSGFQRFHNFGWLQKNFSNSGNGFGF