; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C018647 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C018647
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationchr01:1785186..1790174
RNA-Seq ExpressionMELO3C018647
SyntenyMELO3C018647
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136872.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus]2.7e-6898.65Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_008455213.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495430 [Cucumis melo]2.4e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.1e-6593.24Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+ LQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_022988990.1 uncharacterized protein LOC111486188 [Cucurbita maxima]1.8e-6491.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRW+GAVANLTEM SNL+L QKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]3.6e-6593.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+ LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein1.3e-6898.65Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A1S3C1M4 uncharacterized protein LOC1034954301.2e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X11.0e-6593.24Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+ LQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X11.9e-6491.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEM SNL+ LQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

A0A6J1JEJ3 uncharacterized protein LOC1114861888.7e-6591.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRW+GAVANLTEM SNL+L QKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein5.2e-5475.84Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEM SNLD LQKLLLKKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++Q+AAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHV

Query:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE
        Q+VTKELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGCGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTTACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCTTTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CTATCACCGCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCACAAAGAGCTGCTGAAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCGAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTTGGTGGGAG
AGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATGGCACAAATACGAAATGTAAGAACAAACGATAACGCGGTAAAATTGAATGCTAAACATGATCGTCGGGTGGGTTCTTACTTCTTAGCTCTCTCGCTAAGTCTCTAC
ACGGATCATGAAGTTCAACCATAATTGAATCGTGAATTTGCAAAACTGCAAGCGTCGGAGAAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGG
CGCCGTTGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTTACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCTTTGT
GCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTGCTATCACCGCTGCGGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGT
CAAGCAGAGGCAGCACAAAGAGCTGCTGAAGTACATGTACAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTACGCGCGAA
GCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTTGGTGGGAGAGAATAAAGTCTGCAAATATGTGAGGTTTAGATTTTGA
TTATTAGGATGTTAGTATTTTTCTTTGTTTTGTGGGTGAAGTTTTAGTGTAAAATATTTATGGATAGTCTGGTTGAATCTGATTAGGAATTTGGTGTGTAATATATTGTT
TTGAACTTAGTGAATTAACATTTTTTAGAAAATGGATAAATCAAATTCAAATTACATTTCATTGGATGACAATGTACAAGTTATTTGCTCCCAGTGCCAACTACTATGAG
AATAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDLLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQRAAEVHVQEVTKELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGRE