; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C018954 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C018954
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description50S ribosomal protein L29, chloroplastic
Genome locationchr07:13808773..13811122
RNA-Seq ExpressionMELO3C018954
SyntenyMELO3C018954
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001854 - Ribosomal protein L29/L35
IPR036049 - Ribosomal protein L29/L35 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137190.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic [Cucumis sativus]1.3e-7492.94Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLS+ASLPS LPIPSKFLNSTSKS FN LQIRFPFSF +PPKTATTG GRNSSVVMMAKRE+ELKDIR+KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRISRMLTV+REREIEEGVGKR+SRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

XP_008455595.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L29, chloroplastic [Cucumis melo]5.4e-81100Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

XP_022941582.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]8.1e-6989.41Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLS+AS PS++  PSKFL+STSKS FNG QIRFPFSF VPPKTA+T GGRNSSVVMMAKREEELK+IR KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRI+RMLTVKREREIEEGVGKR+SRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

XP_022977189.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.8e-6888.82Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        M+NLS+AS PS++  PSKFL+STSKS FNG QIRFPFSF VPPKTA+T GGRNSSVVMMAKREEELK+IR KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRI+RMLTVKREREIEEGVGKR+SRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

XP_023531622.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-6888.82Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLS+AS PS++  PSKFL+STSKS FNG QIRFPFSF VPPKTA+T GGRNS VVMMAKREEELK+IR KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRI+RMLTVKREREIEEGVGKR+SRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVL7 Uncharacterized protein6.3e-7592.94Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLS+ASLPS LPIPSKFLNSTSKS FN LQIRFPFSF +PPKTATTG GRNSSVVMMAKRE+ELKDIR+KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRISRMLTV+REREIEEGVGKR+SRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

A0A1S3C2I8 50S ribosomal protein L29, chloroplastic2.6e-81100Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

A0A5D3CWZ4 50S ribosomal protein L292.6e-81100Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

A0A6J1FMW5 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like3.9e-6989.41Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        MINLS+AS PS++  PSKFL+STSKS FNG QIRFPFSF VPPKTA+T GGRNSSVVMMAKREEELK+IR KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRI+RMLTVKREREIEEGVGKR+SRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

A0A6J1IQR3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like8.7e-6988.82Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE
        M+NLS+AS PS++  PSKFL+STSKS FNG QIRFPFSF VPPKTA+T GGRNSSVVMMAKREEELK+IR KTTEEINEEV+DLKGELLMLRLQKSARNE
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNE

Query:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
        FKSSEFRRMRKRI+RMLTVKREREIEEGVGKR+SRKLDRKWK+SIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA
Subjt:  FKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8HMR2 50S ribosomal protein L297.3e-0431.75Show/hide
Query:  ELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEE
        ++KD+   +  E+  +++DLK +L  LRLQK+ R E K  +F+ +R ++++++T++R+R++ +
Subjt:  ELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEE

P82248 50S ribosomal protein L29, chloroplastic8.5e-3757.14Show/hide
Query:  NLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQI-RFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEF
        +LS     S L  P K    T KS F+GL++     S  +  +  T      SSVV+M K+E+ELK++R KT E++NEE++ LKGEL MLRLQ+SAR  F
Subjt:  NLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQI-RFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEF

Query:  KSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKS
        K S+F RMRKR++RMLTVKREREIE+GVGKR+SRKLD+ WK+SIVVRPPPSLKKL+E+  A  EAEK+
Subjt:  KSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKS

Q9FJP3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic1.9e-4462.5Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTS-KSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN
        M++LS+A+  +A        ++TS  S F+G++I+   S  VP     +      SVVMM+KRE ELK+IR+KTTE++ EEVVDLKGEL MLRLQKSARN
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTS-KSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN

Query:  EFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAE
        EFKSS+FRRM+K+++RMLTVKREREI+EG+ KR+SRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA E AE
Subjt:  EFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAE

Q9SWI6 50S ribosomal protein L29, chloroplastic4.7e-3573.15Show/hide
Query:  RNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPP
        R +++V MAKRE+EL++IRA TTE++ EEVVDLKGEL +LRL++SAR EFK+SEF RMRKRI+RMLTVKREREIE+G+ KR+SRKLDRKWK+SIVVRPPP
Subjt:  RNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPP

Query:  SLKKLREE
        SL+  +EE
Subjt:  SLKKLREE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G65220.1 Ribosomal L29 family protein1.3e-4562.5Show/hide
Query:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTS-KSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN
        M++LS+A+  +A        ++TS  S F+G++I+   S  VP     +      SVVMM+KRE ELK+IR+KTTE++ EEVVDLKGEL MLRLQKSARN
Subjt:  MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTS-KSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARN

Query:  EFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAE
        EFKSS+FRRM+K+++RMLTVKREREI+EG+ KR+SRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA E AE
Subjt:  EFKSSEFRRMRKRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAAACCTTTCAGTTGCTTCTTTACCTTCGGCCCTTCCAATCCCTTCAAAATTTCTTAATTCGACTTCCAAATCCTTCTTCAATGGCCTTCAAATCCGTTTCCCATT
TTCGTTTTGCGTTCCTCCTAAAACTGCAACTACTGGAGGAGGCCGCAATTCATCGGTGGTAATGATGGCCAAGAGGGAGGAGGAATTGAAGGATATAAGGGCCAAAACTA
CTGAGGAAATAAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGTGAACTTCTTATGCTTCGTCTTCAAAAATCAGCCCGCAATGAGTTTAAGTCTAGCGAATTCCGCCGCATGCGC
AAACGGATTTCTCGGATGCTAACAGTAAAACGTGAGAGAGAGATTGAAGAGGGTGTGGGCAAAAGGATGTCAAGAAAGTTAGATAGAAAGTGGAAGAAAAGTATTGTTGT
CAGACCACCTCCATCTCTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGCAGCAGCTGAAGAAGCTGAGAAATCTGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATATAATATATGTGGATAGCGGATGTACTATGGGCATTTGCGTAAATAGGGGTAAGAGGGGTAATAGGGGATCTCGAAAAGTAACAATAGAAGTGCTGGGAGCTTAT
CTCATTCTTTAGTAGCAGAGCGCTCTTACAAACTTTGAAGATGATAAACCTTTCAGTTGCTTCTTTACCTTCGGCCCTTCCAATCCCTTCAAAATTTCTTAATTCGACTT
CCAAATCCTTCTTCAATGGCCTTCAAATCCGTTTCCCATTTTCGTTTTGCGTTCCTCCTAAAACTGCAACTACTGGAGGAGGCCGCAATTCATCGGTGGTAATGATGGCC
AAGAGGGAGGAGGAATTGAAGGATATAAGGGCCAAAACTACTGAGGAAATAAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGTGAACTTCTTATGCTTCGTCTTCAAAAATCAGC
CCGCAATGAGTTTAAGTCTAGCGAATTCCGCCGCATGCGCAAACGGATTTCTCGGATGCTAACAGTAAAACGTGAGAGAGAGATTGAAGAGGGTGTGGGCAAAAGGATGT
CAAGAAAGTTAGATAGAAAGTGGAAGAAAAGTATTGTTGTCAGACCACCTCCATCTCTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGCAGCAGCTGAAGAAGCTGAGAAATCTGCT
TGAACGAATCAGATACATGCTCGCATTCAATCTTTATGAGTTTGAAGTTGTTGAGATTTGAGAACGCTGTTTAAGCAACACTTTAGAAAAAAAAAATTCCAACTTTAAAC
ATTCTGATTCTTGTACTTAGCTTATGCACAAATGGAAATAGATTTCGAGTGGATCATGTTGAATTTATATGCTTTCACTCCTTAATTTAAATTAGATAAAAGGTATGTTT
GGGAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMR
KRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA