; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C021987 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C021987
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationchr09:2156099..2156985
RNA-Seq ExpressionMELO3C021987
SyntenyMELO3C021987
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]2.8e-4292.71Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]1.6e-4292.71Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]2.3e-4493.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor3.2e-4497.83Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 26.3e-48100Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 26.3e-48100Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like1.4e-4292.71Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like7.9e-4392.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 13.9e-2371.43Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 34.7e-2461.7Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 13.9e-2371.43Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 15.5e-2557.73Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 21.4e-3678.79Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger3.3e-2561.7Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 13.9e-2657.73Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 244.3e-1767.31Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 29.9e-3878.79Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 222.5e-1767.31Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATGCCGTTGATGGGTGTCGAGAATTTATGGCAAGTGGTGACGAAGGGACGACAGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGCGGTTGCCATCGGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCCAAGAACCCCATTTCAATTTAACAAGACCTAGCTAATTACCCTAAAATGGATCTTTTGTTACAATTTTTTTTTCTTTGGTTCAAATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCT
TAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGACACTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCACGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATG
CCGTTGATGGGTGTCGAGAATTTATGGCAAGTGGTGACGAAGGGACGACAGCTGGACTGACTTGCGCCGCTTGCGGTTGCCATCGGAATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGA
ACTGAGGTAGTGTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAATTAAAAGACTATACATATAATAATACTATAACTTCAGTGTGTATGGGGTGAGGATTTTTTTT
CTTTTTCTTTTTCGGGGTGCTGAATAAACAAAATTTCTCAACATGGGATTGAGAGTTGAGAGTTGAGAGTTGAGATTCAGCTTTGTTGTTCTGTTGCTTGAATTATTATT
ATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAAAAAAAAAATTCTTGTGTTGGATTGGAATCAACTTGACTTCAACTAAGAAATATGTGCTTTGTGTAATTTTGAATTTTTTT
CCCTTTAATTTCAGGTTCATATGAGGATCAAAAAAGTTATGTAAATCCTTTTTTTTTTTTTCATTACATCTCTTTTGAATTATATATGTATTTGATTTGAGTGTATCTTT
TGGAGATTGGAAGTAATAGACCAAAAATCTTTATTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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