; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C022009 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C022009
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionVesicle transport v-SNARE family protein
Genome locationchr09:1841788..1845438
RNA-Seq ExpressionMELO3C022009
SyntenyMELO3C022009
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0012507 - ER to Golgi transport vesicle membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0031902 - late endosome membrane (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007705 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal
IPR010989 - SNARE
IPR027027 - GOSR2/Membrin/Bos1
IPR038407 - Vesicle transport v-SNARE, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578564.1 Vesicle transport v-SNARE 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-10495.93Show/hide
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KAG7016122.1 Vesicle transport v-SNARE 13 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-10495.48Show/hide
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XP_004141451.1 vesicle transport v-SNARE 11 [Cucumis sativus]1.7e-10698.64Show/hide
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XP_008459347.1 PREDICTED: vesicle transport v-SNARE 11 [Cucumis melo]6.8e-108100Show/hide
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XP_022939644.1 vesicle transport v-SNARE 13-like [Cucurbita moschata]1.2e-10495.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUA8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein8.1e-10798.64Show/hide
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A0A1S3C9G1 vesicle transport v-SNARE 113.3e-108100Show/hide
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A0A5D3BNH0 Vesicle transport v-SNARE 113.3e-108100Show/hide
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A0A6J1FHT9 vesicle transport v-SNARE 13-like5.8e-10595.93Show/hide
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A0A6J1K0S2 vesicle transport v-SNARE 133.7e-10495.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O89116 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A3.9e-2633.18Show/hide
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        MS  F+GYE+ +  L+A ++ K      L  ++KKQ V+ V+  ++EA  L+ +MDLE R +PP  + +   ++R YK ++  L+++ KR        A 
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL +SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A + L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + +++V+AI+  + F
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Q96AJ9 Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A5.1e-2632.13Show/hide
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        MS  F+GYE+ +  L+A ++ K      L  ++KKQ V+ V+  ++EA+ L+ +MDLE R +PP  + +   ++R YK ++  L+++ KR        A 
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         DE+    + D   +S +QR+ L+  TERL +SS R++   +  +ETE++G  +L++L   R+ +  A   L   D N+GKS RILT M RR+ +N+ ++
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          + +++V+ I++ + F + +
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Q9LVP9 Vesicle transport v-SNARE 131.4e-8776.47Show/hide
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        MS+ F+ YERQYCE+SANLS+KCTSA AL+GEQKKQ +SE+K+G++EAEAL++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  
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        RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELGVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW +
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         +II VLVLAII ILYFKLT+
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Q9SEL5 Vesicle transport v-SNARE 121.2e-7569.68Show/hide
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        MS+VF+GYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S     +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERL +SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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        +TS+IV LVLAIILI+ +KL+
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Q9SEL6 Vesicle transport v-SNARE 111.1e-8775.57Show/hide
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        MS+VFDGYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG L+AA 
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        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERLG+++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
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         +II+ L+ AI +ILYFKLTK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26670.1 Vesicle transport v-SNARE family protein8.6e-7769.68Show/hide
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        MS+VF+GYERQYCELS NLSRKC SAS L NGE+KK K++E+K+GIDEA+ LIRKMDLEARSL P+ KAV L+KLREYKSDLN LK E KR+ S     +
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        +R+EL+ESGMAD    SADQR RL  + ERL +SSDRI+ESRR MLETEE+G+SI+QDL  QRQ+LLHAHN LHGVDD I KSK++LT MSRRM +NKWI
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        +TS+IV LVLAIILI+ +KL+
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AT3G29100.1 vesicle transport V-snare 133.1e-6677.65Show/hide
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        ++KMDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELG
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Query:  VSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLTK
        VSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKLT+
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AT3G29100.2 vesicle transport V-snare 133.4e-6578.44Show/hide
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        MDLEAR+LPPNVK+ LL KLREYKSDLNN K+EVKRI SG+L+A  RDELLE+GMADTLTASADQRSRLM +T+ LG+++DRIK+SRRT+LETEELGVSI
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Query:  LQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLTK
        LQDLH QRQSLL AH TLHGVDDN+GKSK+ILT M+RRMN+NKW + +II VLVLAII ILYFKLT+
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AT5G39510.1 Vesicle transport v-SNARE family protein7.5e-8975.57Show/hide
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        MS+VFDGYERQYCELSA+LS+KC+SA +L+GEQKKQK+SE+K+G++ AE LIRKMDLEAR+LPPN+K+ LL KLRE+KSDLNN K+EVKRI SG L+AA 
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        RDELLE+GMADT TASADQR+RLM +TERLG+++DR+K+SRRTM+ETEE+GVSILQDLH QRQSLL AH TLHGVDDNIGKSK+ILT+M+RRMNKNKW +
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         +II+ L+ AI +ILYFKLTK
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AT5G39630.1 Vesicle transport v-SNARE family protein8.4e-4044.8Show/hide
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        MS VF  Y++QY ELS NLS+KC+ A +L G +KK+K+SE+   ++ AE LI KMD  A +LPPN+K++LL KL+E KS L  L++E+KR  S +L   T
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        R+E+LE+  AD     ADQRSRLM +TE L ++ + IK+S+R +LETE +G+SIL++L  Q++SL ++   LH +DD + +S+ I+ ++     K  + V
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Query:  TSIIVVLVLAIILILYFKLTK
        T+ I++  L       FKL K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGTTTCTGAAGTAAAGGCAGGAATTGATGAAGCAGAAGCTCTGATTCGGAAAATGGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCTGTCCTTCTAGCTAAAT
TGAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAACTTAAAAAGTGAAGTTAAACGCATTGAATCTGGAAGCTTAAGTGCAGCCACTAGAGACGAGTTGCTGGAATCAGGAATGGCT
GATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAAGGTCGAGATTAATGAGCACAACAGAGAGGCTAGGTAAGTCAAGTGATAGAATTAAGGAAAGTCGAAGAACCATGCTAGAAAC
CGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAAGATTTGCACTCGCAGAGACAGTCTCTCTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAATATAGGGAAGAGTAAGA
GAATTTTAACCAACATGTCGAGAAGGATGAACAAGAACAAATGGATTGTTACATCCATAATTGTTGTTCTTGTATTGGCCATCATCCTGATATTGTACTTCAAACTTACC
AAATAG
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AAAAAAATTGTGAAAAAGGAATTACATATTTAGGTGGCTAAGTTATTTTATTATTGGAGACGCCGTTGGCTATTCGAAGCGTCGATTCATTTGTCAAAGCAACAAAATTT
TGGTGCTTCCTGACGGGGTCCGTTCGCACTCCACCTGCCGTTTATTAATTCTTCCAATTTTCTCGTTCTACACAATTCCTCATTCTCTGGGCTTTGCAATCTTTGATCCT
ATCTGGTTTGGGCACGATGAGTGAGGTGTTCGACGGATATGAACGACAATACTGCGAGCTTTCGGCGAATCTGTCAAGAAAATGCACTTCGGCTAGTGCCCTTAATGGAG
AGCAAAAGAAGCAAAAGGTTTCTGAAGTAAAGGCAGGAATTGATGAAGCAGAAGCTCTGATTCGGAAAATGGATCTTGAGGCCAGAAGTTTGCCGCCTAATGTCAAGGCT
GTCCTTCTAGCTAAATTGAGAGAGTACAAATCTGACCTCAACAACTTAAAAAGTGAAGTTAAACGCATTGAATCTGGAAGCTTAAGTGCAGCCACTAGAGACGAGTTGCT
GGAATCAGGAATGGCTGATACATTGACGGCATCAGCTGACCAAAGGTCGAGATTAATGAGCACAACAGAGAGGCTAGGTAAGTCAAGTGATAGAATTAAGGAAAGTCGAA
GAACCATGCTAGAAACCGAAGAACTTGGAGTTTCAATTCTTCAAGATTTGCACTCGCAGAGACAGTCTCTCTTGCATGCTCATAATACGCTTCATGGAGTAGATGACAAT
ATAGGGAAGAGTAAGAGAATTTTAACCAACATGTCGAGAAGGATGAACAAGAACAAATGGATTGTTACATCCATAATTGTTGTTCTTGTATTGGCCATCATCCTGATATT
GTACTTCAAACTTACCAAATAGTAAGGATATATATATATATATATCTTTTCTTCATTTGGGTTTGTCATATTGTTGTTGAGTGTTGTTGAAACATGAGTTCATGGTTTAT
GTATTTTTCTGGGTCTGTTGTGAGTTTGTACATGGCTTATGTCATGATTAATATATCTTGCCAGCATCTTTGTCTTAATTAAGATGGGCAAGTGTTCACAATACAATTTT
TAATGTTGTATCCATATTTGCTTACTGTGGGATATCCATATTTGCCTTACTTTGAGAGCTTCAATTGATAATCTACAAAGATGGTTTGAGCTTTAGATAATTTGTTTTAC
TTTGATTAAAATGGTGCATTCGAAGATATACCAAATGTGGAATATATCTGGCGTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DTLTASADQRSRLMSTTERLGKSSDRIKESRRTMLETEELGVSILQDLHSQRQSLLHAHNTLHGVDDNIGKSKRILTNMSRRMNKNKWIVTSIIVVLVLAIILILYFKLT
K