CuGenDBv2

Gene ID	MELO3C022237
Organism	Cucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	chr11:29584053..29593050
RNA-Seq Expression	MELO3C022237
Synteny	MELO3C022237
Gene Ontology terms	GO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process) GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]

6.0e-283

95.01

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS
        MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS

Query:  SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA
        SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA
Subjt:  SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA

Query:  PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF
        PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF
Subjt:  PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF

Query:  QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL
        QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL
Subjt:  QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL

Query:  SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA
        SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA
Subjt:  SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA

Query:  SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR
        SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR
Subjt:  SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR

Query:  DILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
        DILLRLE                                  IEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
Subjt:  DILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD

Query:  AI
        A+
Subjt:  AI

XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

2.8e-187

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP SGSSVAP
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS
         FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+SS+P  FG A SA TS+  LFG  +SAA++ SA LFG SAP +  G+S+FG S  +SGS+ S LFGS+PF     
Subjt:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS

Query:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF
         +SSSVSTSNLF SS SS   +PFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF
Subjt:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF

Query:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS
        SI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSG  SSFTGFGVTS+A+S
Subjt:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS

Query:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
        SSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
Subjt:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ

Query:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE
        ERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLE                                  IEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE
Subjt:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE

Query:  DDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        +DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA+
Subjt:  DDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.0e-186

72.65

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SS F SS SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP
         SS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP+SGSSVAP
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALF-GASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFG---------
         FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+S  PS FG ASS+ +SS+P FG A SA +S  +LF G S+ A+ S A LFGTSAP++ S GS +FG         
Subjt:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALF-GASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFG---------

Query:  SSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPAS
        SS FG+S   +SSSVSTSNLF SS SS   SPFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPAS
Subjt:  SSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPAS

Query:  SSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTG
        S+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSG  SSFTG
Subjt:  SSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTG

Query:  FGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEI
        FGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS+TPKLPSEITGKTVEEI
Subjt:  FGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEI

Query:  IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE
        IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLE                                  IEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQE
Subjt:  IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQE

Query:  VDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        VDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA+
Subjt:  VDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

XP_031743587.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus]

9.9e-262

90.61

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGFGFGSSTSQ  SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNP  SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
        SSSS PSS+A SASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
Subjt:  SSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA

Query:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP
        APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS LFGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Subjt:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP

Query:  FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS
        FQS+LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS
Subjt:  FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTS

Query:  LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP
        LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP
Subjt:  LSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAP

Query:  ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
        ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN
Subjt:  ASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQN

Query:  RDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTR
        RDILLRLE                                  IEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTR
Subjt:  RDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTR

Query:  DAI
        DA+
Subjt:  DAI

XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

1.5e-193

75.7

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSG G GSS+SQ SSSSSPFSS+TGFSFGST+ FSFGSS++PLSL SSSSSSNPTSSSSPF N T NP SSSSS GFGSSSF SS SSPFSFSL      
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFG
                                       FG++ SS  SSAPLFG+ASSS          GSSPAPSFG A SSGSS+ PSFGAL SS G+SSAPLFG
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFG

Query:  AAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFG-TAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS
        A PSAGA SAPSLFGG SSATTSSAPLFG T+AS AS GSALFGAS  ASGS +SLFGTS  +SGS+GS LFGSSPFGA     SSS+STSNLFASS SS
Subjt:  AAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFG-TAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS

Query:  ---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA----SPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAP
           SPFQ+S SSSSSQNL SSS FAA    S SGFSF T +LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP
Subjt:  ---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA----SPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAP

Query:  STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS
        STTATKPTSLSLS+SVAPLFSTVTTTS STPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSG VSSFTGFGVTS ASSSSAIGSLSLPTKTS
Subjt:  STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTS

Query:  TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIA
        TAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTV+ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIA
Subjt:  TAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIA

Query:  EWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLL
        EWDRRIMQNRDILLRLE                                  IEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLL
Subjt:  EWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLL

Query:  LDDEAASTRDAI
        LDDEAASTRDA+
Subjt:  LDDEAASTRDAI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KA27 Nsp1_C domain-containing protein

1.4e-232

71.93

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGFGFGSSTSQ  SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSL SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNP  SSSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSL-SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
        SSSS PSS+A SASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSS SLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
Subjt:  SSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA

Query:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP
        APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGT+ASAASSGS LFGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SS STSNLFASSLS+SP
Subjt:  APSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP

Query:  FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNV----------------------------------------------------------
        FQS+LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV                                                          
Subjt:  FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNV----------------------------------------------------------

Query:  ----------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                            
Subjt:  ----------------------------------------------------------------------------------------------------

Query:  -PSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSS
          SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL                SASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSS
Subjt:  -PSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSS

Query:  SAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSG
        SAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSG
Subjt:  SAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSG

Query:  TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSF
        TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLE                                 
Subjt:  TTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSF

Query:  LIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
         IEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA+
Subjt:  LIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

2.9e-283

95.01

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS
        MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGAS

Query:  SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA
        SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA
Subjt:  SSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAA

Query:  PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF
        PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF
Subjt:  PSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPF

Query:  QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL
        QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL
Subjt:  QSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL

Query:  SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA
        SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA
Subjt:  SLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA

Query:  SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR
        SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR
Subjt:  SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNR

Query:  DILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
        DILLRLE                                  IEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
Subjt:  DILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD

Query:  AI
        A+
Subjt:  AI

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

1.3e-187

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP SGSSVAP
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS
         FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+SS+P  FG A SA TS+  LFG  +SAA++ SA LFG SAP +  G+S+FG S  +SGS+ S LFGS+PF     
Subjt:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS

Query:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF
         +SSSVSTSNLF SS SS   +PFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF
Subjt:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF

Query:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS
        SI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSG  SSFTGFGVTS+A+S
Subjt:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS

Query:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
        SSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
Subjt:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ

Query:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE
        ERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLE                                  IEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE
Subjt:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE

Query:  DDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        +DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA+
Subjt:  DDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

A0A6J1H7F5 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2

1.5e-170

72.11

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP SGSSVAP
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS
         FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+SS+P  FG A SA TS+  LFG  +SAA++ SA LFG SAP +  G+S+FG S  +SGS+ S LFGS+PF     
Subjt:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA-LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSS

Query:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF
         +SSSVSTSNLF SS SS   +PFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF
Subjt:  GTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGF

Query:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS
        SI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSG  SSFTGFGVTS+A+S
Subjt:  SINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASS

Query:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
        SSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LV+ASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ
Subjt:  SSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ

Query:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEV
        ERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLE                                  IEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEV
Subjt:  ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEV

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

7.3e-186

71.62

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG
        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTG
Subjt:  MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTG

Query:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP
        ASS         S S+LF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP+SGSSVAP
Subjt:  ASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSA--------------PLFGAASSSGTSSASLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAP

Query:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAAS---------------AASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTG
         FG+  SS G+S  P FGA+PSAG+S  PS FG ASS+ +SS+P FG A S               A +S + LFG SAP +  G+S+FG SA +SGS+ 
Subjt:  SFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAAS---------------AASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTG

Query:  SGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSF
        S LFGS+ F +SSSGT SSVSTSNLF SS SS   +PFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT    +SSSSSLT ASTSSSSFSF
Subjt:  SGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS---SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSF

Query:  GTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTV
        GTPASS+SQSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSG  
Subjt:  GTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTV

Query:  SSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGK
        SSFTGFG+TS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVS+TPKLPSEITGK
Subjt:  SSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGK

Query:  TVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIE
        TVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLE                                  IEVAKVVETQ ELEKKLELIE
Subjt:  TVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLELIE

Query:  THQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        THQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA+
Subjt:  THQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

1.7e-62

46.24

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSA----SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSS--SFGFGSSS-----FSSSTSSPFS
        MSGF FG S          +S  GFSFGS++ +  SSA    SPLS  S + SSNP+S+   F +  S+ P+SS+  SFGFG+SS     F SS SS   
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSA----SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSS--SFGFGSSS-----FSSSTSSPFS

Query:  FSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAP-------LFGAASSSGTSSASLFGAGSSPA--PS---FGAAPSSGSS
         S  S   G+S+S  P+S+ PS    FG ++SS+      FG+S+++A+S+AP       +  +ASS+ T S+SLFGA +S A  PS   FGAAP+SGS+
Subjt:  FSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAP-------LFGAASSSGTSSASLFGAGSSPA--PS---FGAAPSSGSS

Query:  VAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFG-TSAPSSGSTGSGLFGSSP--F
          P FG         S+P   +APS+ ++S  SLFG +SSA TS++PLFG A S+A+  +  F  ++ A GS +S+FG T +  S S  S   GSSP  F
Subjt:  VAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFG-TSAPSSGSTGSGLFGSSP--F

Query:  GASSS----GTSSSV-STSNLFASSLSS------SPF-QSSLSSSSSQNLT--SSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSF
        GA+ S    G+SSS  ST +LFASS S       SPF  S+ +SSS+ N +  S+SPF+AS +GFSF  ST S TT      SS++ S+    ++SSSSF
Subjt:  GASSS----GTSSSV-STSNLFASSLSS------SPF-QSSLSSSSSQNLT--SSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSF

Query:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG
        SFGT A+S      GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A ++ P  ASS 
Subjt:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG

Query:  TVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSE
           S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +PKLPSE
Subjt:  TVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSE

Query:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKL
        ITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLE                                  IEVAKVVETQ+ LE++L
Subjt:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKL

Query:  ELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        ELIETHQQEVDKAL S+E++AERIY DER  LLDDEAASTRDA+
Subjt:  ELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

1.2e-63

46.24

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSA----SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSS--SFGFGSSS-----FSSSTSSPFS
        MSGF FG S          +S  GFSFGS++ +  SSA    SPLS  S + SSNP+S+   F +  S+ P+SS+  SFGFG+SS     F SS SS   
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSA----SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSS--SFGFGSSS-----FSSSTSSPFS

Query:  FSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAP-------LFGAASSSGTSSASLFGAGSSPA--PS---FGAAPSSGSS
         S  S   G+S+S  P+S+ PS    FG ++SS+      FG+S+++A+S+AP       +  +ASS+ T S+SLFGA +S A  PS   FGAAP+SGS+
Subjt:  FSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAP-------LFGAASSSGTSSASLFGAGSSPA--PS---FGAAPSSGSS

Query:  VAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFG-TSAPSSGSTGSGLFGSSP--F
          P FG         S+P   +APS+ ++S  SLFG +SSA TS++PLFG A S+A+  +  F  ++ A GS +S+FG T +  S S  S   GSSP  F
Subjt:  VAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFG-TSAPSSGSTGSGLFGSSP--F

Query:  GASSS----GTSSSV-STSNLFASSLSS------SPF-QSSLSSSSSQNLT--SSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSF
        GA+ S    G+SSS  ST +LFASS S       SPF  S+ +SSS+ N +  S+SPF+AS +GFSF  ST S TT      SS++ S+    ++SSSSF
Subjt:  GASSS----GTSSSV-STSNLFASSLSS------SPF-QSSLSSSSSQNLT--SSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSF

Query:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG
        SFGT A+S      GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A ++ P  ASS 
Subjt:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG

Query:  TVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSE
           S TGFG+ SS  ++ +  S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T + LVV SSS   TST  A V+ +PKLPSE
Subjt:  TVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSE

Query:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKL
        ITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLE                                  IEVAKVVETQ+ LE++L
Subjt:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKL

Query:  ELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI
        ELIETHQQEVDKAL S+E++AERIY DER  LLDDEAASTRDA+
Subjt:  ELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCACCTTTTCCTTCGGATCATC
CGCTTCCCCTTTATCTCTATCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCGTCCTCCCCGTTTCCCAATCCAACCTCCAATCCGCCTTCTTCTTCTTCTTCCTTTG
GCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGTTCCTTCTTCCTCAGCACCT
TCAGCTTCGTCCTTATTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACGGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCCGCTCCCTTGTTTGGGGCTGC
TTCCTCCTCCGGGACCTCATCTGCCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTCACCTGCGCCGTCGTTTGGGGCTGCTCCATCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGG
CTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACT
TCCAGTGCACCATTGTTCGGCACAGCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCGGCGTTGTTTGGTGCCTCTGCTCCCGCTTCAGGTTCTGGTGCCTCTCTGTTTGGGACATC
GGCTCCATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTCGTCATCGGTTTCCACTTCGAACTTGTTTGCGTCAT
CTTTATCCAGCTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTCCCGACGAGT
ACTTTGTCTAAAACTACTAGCATTACCAATGTACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTC
GTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAA
ATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCCTCGACTCCAGCTGCCAGTAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCT
TCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCATCGGGTACTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATC
AAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGCTTCCCTTCTCTGGCATCCGCTTCTACTGCTG
CTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCT
TCTACACCAAAACTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAA
TGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATAATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGGAGGCATCAAAGTACACACTGGACCTTGAGCTGCATATGTTGTCTTCTT
TGTCGGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGAAGTTGGCTCTTTCTTTCTTAATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTG
ATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGATGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAGGCTGCATC
TACAAGGGATGCAATTCTAATGATGTTGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CAAGTCTTCATACATCAAGGCATTGTCATATTTTTTTCTCACACATCTCATATACTCCACTATACCAACAAATTTTTTTATAAAAAAAACATGTGCAAAATAAACTTAAA
ATCACAGCAAATTAATGAGAAAAATGATTTGAGTTTAGGCATTTTAAGTCGGGAAGGAGATTAAGACCTTAAACATGTTTTGCCCATAATCTAAAACATCCTTCAGAATT
CAAAGATAAACCGTAAACTCAAAAGTTGTTATCCACATCGACGAAACGCGCCACCGCCGTCCACGATGCTGTCCAATCCCGATTTCCTCCGTTCGCCGTCGTTGCCCGAT
CGATCTATTTCTTAGCAAAAGGGCAAATGGGACATTTCATATGTTCATACTGATGACCTCTAAAACCTTCTAAAACCCTTCATTTCAGTCTTTTCCACCGGAGATCGATC
GAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCACCTTTTCCTTCGGATC
ATCCGCTTCCCCTTTATCTCTATCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCCTCGTCCTCCCCGTTTCCCAATCCAACCTCCAATCCGCCTTCTTCTTCTTCTTCCT
TTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGTTCCTTCTTCCTCAGCA
CCTTCAGCTTCGTCCTTATTTGGGGTTTCTTCATCCTCAACGGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCCGCTCCCTTGTTTGGGGC
TGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCTGCCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTCACCTGCGCCGTCGTTTGGGGCTGCTCCATCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTG
GGGCTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACT
ACTTCCAGTGCACCATTGTTCGGCACAGCTGCATCCGCTGCAAGTTCGGGATCGGCGTTGTTTGGTGCCTCTGCTCCCGCTTCAGGTTCTGGTGCCTCTCTGTTTGGGAC
ATCGGCTCCATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTCGTCATCGGTTTCCACTTCGAACTTGTTTGCGT
CATCTTTATCCAGCTCTCCATTCCAGAGCTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTCCCGACG
AGTACTTTGTCTAAAACTACTAGCATTACCAATGTACCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGC
TTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTAT
CAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCCTCGACTCCAGCTGCCAGTAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGT
TCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCATCGGGTACTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTC
ATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGCTTCCCTTCTCTGGCATCCGCTTCTACTG
CTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAGCTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTG
TCTTCTACACCAAAACTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGC
CAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATAATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGGAGGCATCAAAGTACACACTGGACCTTGAGCTGCATATGTTGTCTT
CTTTGTCGGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGAAGTTGGCTCTTTCTTTCTTAATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAG
TTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGATGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAGGCTGC
ATCTACAAGGGATGCAATTCTAATGATGTTGTAGGTACGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTA
AATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAA
GGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCCGATCGTGAACTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTAACTCACATTTGCGG
TTTATTTCTAGTTTACTTCTTTTTATTGGGGGGTGGTAGTATCATTGGCTCAACTGGAAATCTTTTTGTCCAAAAGGATGTATTCATTTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAA
AACATGAATATAGGGCGGATACTTAAAAGATAAACTAGGCTCAAGCCTCAAGTTGGTGCATATTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTTTATGAATTTTGGTATG
TTTATTCTCCTACTAAATATCAATTTTGGACCAAAAATTTTGCATGTTTAAATACTTTCAACTGGGAGATATTCAAGTAGGAGAGATTTCAATGACCTTTAGAGTGTAGT
GATCTCGAACAATTTATATTCTG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAP
SASSLFGVSSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATT
SSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTS
TLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSS
SAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVS
STPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEEASKYTLDLELHMLSSLSEFVLHIGALKLALSFLIEVAKVVETQAELEKKLEL
IETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAILMML

MELO3C022237 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome