; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C022700 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C022700
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionMediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1
Genome locationchr09:14497232..14497762
RNA-Seq ExpressionMELO3C022700
SyntenyMELO3C022700
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034013.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]7.1e-7797.32Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

KAA0036767.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-7594.63Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHG+EVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNS+AGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRG+HNEYLYYEVPAAVPEQ +ELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

KAA0055624.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]7.8e-7695.97Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ +SEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ +ELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

KAA0067080.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]6.0e-7696.64Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDS VGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

TYK18891.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-7596.03Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM--TQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM  TQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM--TQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY

Query:  DLGCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        DLG DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  DLGCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SU33 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein3.4e-7797.32Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

A0A5A7UKC7 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein3.8e-7695.97Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ +SEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ +ELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

A0A5A7VIP6 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X12.9e-7696.64Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDS VGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

A0A5D3BAB0 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein3.2e-7594.63Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHG+EVPPMTQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNS+AGQSSTDFGQQYYDL
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDL

Query:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        G DPSSSYMHGHGRGRG+HNEYLYYEVPAAVPEQ +ELQQQENAAVPGQ
Subjt:  GCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

A0A5D3D5R5 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X11.1e-7596.03Show/hide
Query:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM--TQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY
        MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM  TQ QSEHNY+SPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY
Subjt:  MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPM--TQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYY

Query:  DLGCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ
        DLG DPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQ NELQQQENAAVPGQ
Subjt:  DLGCDPSSSYMHGHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAACATCCACTATATGTACGATGTCCCTATTGTACCTGCTCCTGTTCAGAGGAGACGTCCTCTAGTGCAAGAGCCCGATCAATTGGAAGAAGTTGACCAACACGG
GGAAGAAGTGCCTCCAATGACACAGGCACAAAGCGAGCATAATTACATTAGTCCAGTAATGATGATGCCAACATTTGGAACGACATATTATGATTCAGGAGTCGGTCAAT
CGTCAGACTTTGGAAGAGGATATTACAATTCAGAGGCAGGTCAATCATCAACGGACTTTGGGCAACAATACTATGATTTAGGGTGCGATCCATCGTCTTCATACATGCAT
GGTCACGGGCGTGGTCGTGGAGAACATAATGAATATTTGTACTACGAAGTGCCTGCAGCGGTACCCGAGCAATTAAATGAGCTACAGCAACAAGAGAATGCAGCAGTACC
CGGGCAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGAGATCAAACAATATTAGACTTCGGAATGTTGCAGATGATCCACAACAGGTTCTAAATATATGCAACGATAACGAGCAGTATATGGAGAACATCCACTATATGTACGA
TGTCCCTATTGTACCTGCTCCTGTTCAGAGGAGACGTCCTCTAGTGCAAGAGCCCGATCAATTGGAAGAAGTTGACCAACACGGGGAAGAAGTGCCTCCAATGACACAGG
CACAAAGCGAGCATAATTACATTAGTCCAGTAATGATGATGCCAACATTTGGAACGACATATTATGATTCAGGAGTCGGTCAATCGTCAGACTTTGGAAGAGGATATTAC
AATTCAGAGGCAGGTCAATCATCAACGGACTTTGGGCAACAATACTATGATTTAGGGTGCGATCCATCGTCTTCATACATGCATGGTCACGGGCGTGGTCGTGGAGAACA
TAATGAATATTTGTACTACGAAGTGCCTGCAGCGGTACCCGAGCAATTAAATGAGCTACAGCAACAAGAGAATGCAGCAGTACCCGGGCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENIHYMYDVPIVPAPVQRRRPLVQEPDQLEEVDQHGEEVPPMTQAQSEHNYISPVMMMPTFGTTYYDSGVGQSSDFGRGYYNSEAGQSSTDFGQQYYDLGCDPSSSYMH
GHGRGRGEHNEYLYYEVPAAVPEQLNELQQQENAAVPGQ